; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0007445 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0007445
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description40S ribosomal protein S5-like
Genome locationLG08:64527943..64530704
RNA-Seq ExpressionTan0007445
SyntenyTan0007445
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000235 - Ribosomal protein S5/S7
IPR005716 - Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal
IPR020606 - Ribosomal protein S7, conserved site
IPR023798 - Ribosomal protein S7 domain
IPR036823 - Ribosomal protein S7 domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596652.1 40S ribosomal protein S5-1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.5e-10696.67Show/hide
Query:  MDAAVA--VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        MDAAVA  VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
Subjt:  MDAAVA--VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

XP_022157995.1 40S ribosomal protein S5-like [Momordica charantia]1.0e-10598.53Show/hide
Query:  VAVDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
        V V+A QELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
Subjt:  VAVDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII

Query:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
        HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
Subjt:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA

Query:  KANR
        KANR
Subjt:  KANR

XP_022941674.1 40S ribosomal protein S5-like [Cucurbita moschata]3.5e-10696.67Show/hide
Query:  MDAAVA--VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        MDAAVA  VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
Subjt:  MDAAVA--VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

XP_023005183.1 40S ribosomal protein S5-like [Cucurbita maxima]5.9e-10695.75Show/hide
Query:  MDAAVA----VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
        MDAAVA    VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
Subjt:  MDAAVA----VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI

Query:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
        IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
Subjt:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK

Query:  KDEIERVAKANR
        KDEIERVAKANR
Subjt:  KDEIERVAKANR

XP_023540376.1 40S ribosomal protein S5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.9e-10594.81Show/hide
Query:  MDAAVA----VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
        MDAAV     V+AGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
Subjt:  MDAAVA----VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI

Query:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
        IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
Subjt:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK

Query:  KDEIERVAKANR
        KDEIERVAKANR
Subjt:  KDEIERVAKANR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DIA2 40S ribosomal protein S52.4e-10598.04Show/hide
Query:  VAVDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
        VAV+A QELT+ HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
Subjt:  VAVDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII

Query:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
        HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
Subjt:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA

Query:  KANR
        KANR
Subjt:  KANR

A0A6J1DU15 40S ribosomal protein S5-like3.2e-10597.55Show/hide
Query:  VAVDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
        VAV+A QELT+ HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
Subjt:  VAVDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII

Query:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
        HLLTDLNPIQVI+DAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
Subjt:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA

Query:  KANR
        KANR
Subjt:  KANR

A0A6J1DUK1 40S ribosomal protein S5-like4.9e-10698.53Show/hide
Query:  VAVDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
        V V+A QELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
Subjt:  VAVDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII

Query:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
        HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
Subjt:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA

Query:  KANR
        KANR
Subjt:  KANR

A0A6J1FP41 40S ribosomal protein S5-like1.7e-10696.67Show/hide
Query:  MDAAVA--VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        MDAAVA  VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
Subjt:  MDAAVA--VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

A0A6J1L1H1 40S ribosomal protein S5-like2.9e-10695.75Show/hide
Query:  MDAAVA----VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
        MDAAVA    VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
Subjt:  MDAAVA----VDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI

Query:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
        IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
Subjt:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK

Query:  KDEIERVAKANR
        KDEIERVAKANR
Subjt:  KDEIERVAKANR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65731 40S ribosomal protein S5 (Fragment)3.1e-9794.21Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        +VKLFNRW+FDDVQ++D+SL+DY+GV P+KHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTD NPIQVIVD
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIK+IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P46782 40S ribosomal protein S53.3e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P51427 40S ribosomal protein S5-26.8e-9787.86Show/hide
Query:  AVAVDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME
        A A D   E+ Q   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAME
Subjt:  AVAVDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME

Query:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
        IIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
Subjt:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER

Query:  VAKANR
        VAKANR
Subjt:  VAKANR

Q5E988 40S ribosomal protein S53.3e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

Q9ZUT9 40S ribosomal protein S5-11.4e-9787.62Show/hide
Query:  MDAAVAVDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        M A+  +DA   Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+K
Subjt:  MDAAVAVDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37270.1 ribosomal protein 5B9.8e-9987.62Show/hide
Query:  MDAAVAVDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        M A+  +DA   Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+K
Subjt:  MDAAVAVDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

AT2G37270.2 ribosomal protein 5B9.8e-9987.62Show/hide
Query:  MDAAVAVDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        M A+  +DA   Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+K
Subjt:  MDAAVAVDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

AT3G11940.1 ribosomal protein 5A4.9e-9887.86Show/hide
Query:  AVAVDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME
        A A D   E+ Q   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAME
Subjt:  AVAVDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME

Query:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
        IIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
Subjt:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER

Query:  VAKANR
        VAKANR
Subjt:  VAKANR

AT3G11940.2 ribosomal protein 5A4.9e-9887.86Show/hide
Query:  AVAVDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME
        A A D   E+ Q   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAME
Subjt:  AVAVDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME

Query:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
        IIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
Subjt:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER

Query:  VAKANR
        VAKANR
Subjt:  VAKANR

ATCG01240.1 ribosomal protein S74.7e-0835.29Show/hide
Query:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT
        RL N L+     +GKK +A +II  A++ I   T+ NP+ V+  A+    P     A R+G  G   +  ++I   +    AI  L   +R+   RN   
Subjt:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT

Query:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        +A  L+ EL++AAKGS +  AI+KK+E  R+A+ANR
Subjt:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGCTGCGGTTGCGGTGGATGCAGGTCAGGAACTTACCCAGCCTCACCATGATGTGAAGCTTTTCAACCGCTGGACCTTTGATGATGTCCAGGTTAATGACATCTC
TCTTGTGGATTACGTTGGAGTTGCACCAGCCAAGCATGCAACCTACGTTCCACACACAGCTGGTCGATACTCTGTGAAGCGTTTCAGGAAAGCTCAATGCCCAATTGTGG
AGAGACTGACAAACTCCCTCATGATGCACGGTAGAAACAATGGAAAGAAACTAATGGCTGTAAGGATTATCAAGCATGCGATGGAGATCATCCATCTACTAACTGATCTT
AATCCGATTCAAGTTATTGTCGATGCTGTTGTTAACAGTGGACCCCGGGAAGACGCTACTCGAATTGGTTCAGCTGGTGTTGTTAGGCGTCAAGCTGTTGATATATCCCC
TCTGCGGCGTGTAAATCAAGCAATATATCTCCTCACAACCGGTGCTCGTGAGGCTGCTTTCAGAAACATCAAGACAATTGCCGAATGTTTGGCCGATGAACTCATCAATG
CTGCAAAGGGCTCATCAAACAGTTATGCTATCAAGAAAAAAGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCCAACCGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAGGTTAATGGATTTAGGGCTTTGGGCGTCGTGTGAATCAACCATGTGTTCTTAAAAGCAAGCCCAAGCAAGTTCTATTGTCTTCCTCGTTTAACCCTAGACGCCG
TTCCAGTCTTTCTTCTCTCTCCGTTTCAGCTTCTCCATCAAGCTGCCGGTCGGAAAATGGACGCTGCGGTTGCGGTGGATGCAGGTCAGGAACTTACCCAGCCTCACCAT
GATGTGAAGCTTTTCAACCGCTGGACCTTTGATGATGTCCAGGTTAATGACATCTCTCTTGTGGATTACGTTGGAGTTGCACCAGCCAAGCATGCAACCTACGTTCCACA
CACAGCTGGTCGATACTCTGTGAAGCGTTTCAGGAAAGCTCAATGCCCAATTGTGGAGAGACTGACAAACTCCCTCATGATGCACGGTAGAAACAATGGAAAGAAACTAA
TGGCTGTAAGGATTATCAAGCATGCGATGGAGATCATCCATCTACTAACTGATCTTAATCCGATTCAAGTTATTGTCGATGCTGTTGTTAACAGTGGACCCCGGGAAGAC
GCTACTCGAATTGGTTCAGCTGGTGTTGTTAGGCGTCAAGCTGTTGATATATCCCCTCTGCGGCGTGTAAATCAAGCAATATATCTCCTCACAACCGGTGCTCGTGAGGC
TGCTTTCAGAAACATCAAGACAATTGCCGAATGTTTGGCCGATGAACTCATCAATGCTGCAAAGGGCTCATCAAACAGTTATGCTATCAAGAAAAAAGATGAGATTGAGA
GAGTTGCAAAGGCCAACCGTTAAGGATAGTTGTTGAATAGAGAGAGCTCAATGGTACAACAGGAGTTTTGTTTTGTTCTTTCTCAAGTTTTTATGGACATGGTGGTTGTG
TATGTTTTTGTTTTCTTTTCTTAGTGGTGAGAATCCATTTAAGAACTTAATTAAGGTTAAAGAGTTTTGATATGGATGAGATATTAGTTTATTTAATTTTGAGCAAATTG
CAAAAAGTATCTTTGCAGTTAAGGAATTTGTGTCTGATTATCTCTATTATAGTTTCTTCTCGTGAATCATAAATTGGAGCTGTTTGAGACGTTGAATGGGTTATAATAAC
ATGGATTATAATAGTATGTGGGTTATTATAATATGTAAAATCATATAATATTATTTAAAATGTAGAATTATTTAATCTGGATTATAATAGTCTGTATTTGGAATCCTCTA
TGTTTTGGAGAGAACTCTCTTCTGATCAAATATGTATTATATAAAATGTAGAATTATTTAATTTAGGTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDAAVAVDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDL
NPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR