; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0007589 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0007589
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionProtein kinase domain-containing protein
Genome locationLG04:84317496..84318041
RNA-Seq ExpressionTan0007589
SyntenyTan0007589
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025322 - Protein of unknown function DUF4228, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022948492.1 uncharacterized protein LOC111452155 isoform X1 [Cucurbita moschata]2.8e-6774.59Show/hide
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XP_022948495.1 uncharacterized protein LOC111452155 isoform X2 [Cucurbita moschata]2.8e-6774.59Show/hide
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XP_022998311.1 uncharacterized protein LOC111492985 isoform X1 [Cucurbita maxima]9.2e-6370.72Show/hide
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XP_023523993.1 uncharacterized protein LOC111788070 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.6e-6774.59Show/hide
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XP_023523994.1 uncharacterized protein LOC111788070 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.6e-6774.59Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5B7ALW7 Uncharacterized protein (Fragment)2.2e-3041.05Show/hide
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        ALSSWLC+N  K+ LV+IVHPGGH+ELHD PV AAEIMLRNP+ C+ H      PWAIV+PDTTLMLG K+Y++P +T+  LQ+   ++ P       T 
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          C + G    C   N+   D C   + + + I     +E   + E ++ +       +   R     SP+R+  S D+W+P L SI+EE
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A0A6J1G9G0 uncharacterized protein LOC111452155 isoform X11.3e-6774.59Show/hide
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A0A6J1GA04 uncharacterized protein LOC111452155 isoform X21.3e-6774.59Show/hide
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A0A6J1K7L4 uncharacterized protein LOC111492985 isoform X24.5e-6370.72Show/hide
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A0A6J1K9X0 uncharacterized protein LOC111492985 isoform X14.5e-6370.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06980.1 unknown protein2.5e-0524.4Show/hide
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        L+RIVH  G++E     + A EI+  NP   L+   SQ       I+SP++ L  G  Y+L+P++++   ++R          L   +            
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                  G   +G  EC +  E    + V+      ++R+ R   +    S   W P L+SISE+
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AT1G29195.1 unknown protein2.1e-0426.98Show/hide
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        ++RIVH  GH+E   G + A+EIM  +PK  L    S ++ H            IV P+  L  G  Y+L+              P+T+SD C  GG   
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            +  +  +   +V  RS+     R G  +C  GE+ + K  N          R    + +  +     R  G    W P+L SISE
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AT2G30230.1 unknown protein3.8e-0625.3Show/hide
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        L+RIVH  GH++    P+ A EI+  NP   L+   SQ       I+SP++ L  G  Y+L+P+ ++   +K+      E  C             E G 
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        D     V +   +     + C + LE   ++ +       N          S   W P+L+SI+E+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AACGAGAAGGGCGGCGACTGCGAGAGAATTGTGAGATCGGAAATTGGAATTAGTTGCAGAGGAAAGTCGGAATGTGGAGAGAATTTGGAGGGGAAGACGGTTAATAGGAG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCACCGCCCTCTCAAGCTGGCTCTGCAGCAATGGCGCCAAGTCCAAGCTCGTTCGAATCGTCCATCCCGGCGGCCACATCGAGCTCCACGACGGCCCCGTCCGGGC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATALSSWLCSNGAKSKLVRIVHPGGHIELHDGPVRAAEIMLRNPKFCLTHSQSAHHPWAIVSPDTTLMLGCKYYLLPENTVGNLQKRHPPPSTESDCLNGGNCMMCFVL
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