; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0007615 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0007615
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationLG06:3932328..3935378
RNA-Seq ExpressionTan0007615
SyntenyTan0007615
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014205.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.2e-15190.29Show/hide
Query:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP-----SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATS
        MSSA+AA  +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP     SSSSSSSSSSSLLCP CLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFV+VDPLP TS
Subjt:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP-----SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATS

Query:  DDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
        DDNYLL+SPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSS MLEEDP+LICAICKD+FLL+VEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
Subjt:  DDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC

Query:  PLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVN
        PLCR+KLPSD+PSDHVRCRGATMALLRARDLM QEDSYGLRTTL H+ARRHSSIFSEG+QVDSSQSPTQLGVA +G+GEQTDS ETVSSVATDDGIVIVN
Subjt:  PLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVN

Query:  SSGNENGLV
        SSG+ENG V
Subjt:  SSGNENGLV

XP_022953211.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita moschata]2.5e-15689.47Show/hide
Query:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP------SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPAT
        MSSA+AA  +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP      SSSSSSSSSSSLLCP CLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSPPDSDPSSFV+VDPLP T
Subjt:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP------SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPAT

Query:  SDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDS
        SDDNYLL+SPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSS MLEEDP+LICAICKD+FLL+VEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDS
Subjt:  SDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDS

Query:  CPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIV
        CPLCR+KLPSD+PSDHVRCRGATMALLRARDLM QEDSYGLRTTL H+ARRHSSIFSEG+QVDSSQSPTQLGVA +G+GEQTDS ETVSSVATDDGIVIV
Subjt:  CPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIV

Query:  NSSGNENGLVVMDGSINEDAGTV
        NSSG+ENG VVMDG INEDAGT+
Subjt:  NSSGNENGLVVMDGSINEDAGTV

XP_022991911.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita maxima]6.6e-15789.75Show/hide
Query:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP-----SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATS
        MSSA+AA  +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP     SSSSSSSSSSSLLCP CLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFV+VDPLP TS
Subjt:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP-----SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATS

Query:  DDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
        DDNYLL+SPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSS MLEEDP+LICAICKD+FLLDVEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
Subjt:  DDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC

Query:  PLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVN
        PLCR+KLPSD+PSDHVRCRGATMALLRARDLM QEDSYGLRTTL H+ARRHSSIFSEG+QVD SQSPTQLGVA +G+GEQTDS ETVSSVATDDGIVIVN
Subjt:  PLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVN

Query:  SSGNENGLVVMDGSINEDAGTV
        SSG+ENG V+MDG INEDAGT+
Subjt:  SSGNENGLVVMDGSINEDAGTV

XP_023549060.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.0e-15789.78Show/hide
Query:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP------SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPAT
        MSSA+AA  +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP      SSSSSSSSSSSLLCP CLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFV+VDPLP T
Subjt:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP------SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPAT

Query:  SDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDS
        SDDNYLL+SPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSS MLEEDP+LICAICKD+FLL+VEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDS
Subjt:  SDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDS

Query:  CPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIV
        CPLCR+KLPSD+PSDHVRCRGATMALLRARDLM QEDSYGLRTTL H+ARRHSSIFSEG+QVDSSQSPTQLGVA +G+GEQTDS ETVSSVATDDGIVIV
Subjt:  CPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIV

Query:  NSSGNENGLVVMDGSINEDAGTV
        NSSG+ENG VVMDG INEDAGT+
Subjt:  NSSGNENGLVVMDGSINEDAGTV

XP_038899359.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Benincasa hispida]2.2e-15288.96Show/hide
Query:  SSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATSDDNYLL
        S+AT  A +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP SSSSSSSSSSLLCP CLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSPPDSDPSSFVVVDP+P T+DDNYLL
Subjt:  SSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATSDDNYLL

Query:  NSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFK
        NSPQFLRLFQQLADSSDSDF PSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKV+S +LEEDPVLICAICKDQFLL+VEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFK
Subjt:  NSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFK

Query:  LPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVNSSGNEN
        LPSDDPSDHVRCR AT ALLRARDL+HQEDSYGLRTTL H+ARRH SI+SEGIQVD SQS TQ GVAE+G+GEQTDS ETVSSVATDDGIVIVNS+G+EN
Subjt:  LPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVNSSGNEN

Query:  GLVVMDGSINEDAGTVV
        G V MDG INEDAGTVV
Subjt:  GLVVMDGSINEDAGTVV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBK3 RING-type E3 ubiquitin transferase9.1e-14485.09Show/hide
Query:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP----SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATSD
        MSSAT  A +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP    SSSSSSSSSSSL+CP CLTDF+EHMDFTIPTSSSSISD+P SSS P DSDPSSFV VDPLP TSD
Subjt:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP----SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATSD

Query:  DNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCP
        DNYLLNSPQFLRLFQ LADSS+SDF PSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKV+S +L+EDPVLICAICKDQFLL+VEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCP
Subjt:  DNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCP

Query:  LCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVNS
        LCRFKLPSDDPSD VRCR  T ALLRARDLMHQEDSYGLRTTL  +ARRHSSI SEGI VDS QSPTQ GVA + SGEQTDS ETVSSVATDDGIVIVNS
Subjt:  LCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVNS

Query:  SGNENGLVVMDGSINEDAGTVV
        +G+ENG + MDG I EDAGTVV
Subjt:  SGNENGLVVMDGSINEDAGTVV

A0A1S3CE92 RING-type E3 ubiquitin transferase7.4e-14686.92Show/hide
Query:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP---SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATSDD
        MSSAT  A +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP   SSSSSSSSSSSLLCP CLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSP DSDPSSFVVVDPLP TSDD
Subjt:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP---SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATSDD

Query:  NYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPL
        NYLLNSPQFLRLFQ LADSS+SDF PSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKV+S +L+ED VLICAICKDQFLL+VEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPL
Subjt:  NYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPL

Query:  CRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVNSS
        CRFKLPSDDPSD VRCR  T ALLRARDLMHQEDSYGLRTTL  +ARRHSSI SEGI VDS QSPTQ GVA + SGEQTDS ETVSSVATDDGIVIVNS+
Subjt:  CRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVNSS

Query:  GNENGLVVMDGSINEDAGTVV
        G+ENG V MDG I EDAGTVV
Subjt:  GNENGLVVMDGSINEDAGTVV

A0A5D3CET0 RING-type E3 ubiquitin transferase8.8e-14787.23Show/hide
Query:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP---SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATSDD
        MSSAT  A +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP   SSSSSSSSSSSLLCP CLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSP DSDPSSFVVVDPLP TSDD
Subjt:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP---SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATSDD

Query:  NYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPL
        NYLLNSPQFLRLFQ LADSS+SDF PSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKV+S +L+EDPVLICAICKDQFLL+VEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPL
Subjt:  NYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPL

Query:  CRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVNSS
        CRFKLPSDDPSD VRCR  T ALLRARDLMHQEDSYGLRTTL  +ARRHSSI SEGI VDS QSPTQ GVA + SGEQTDS ETVSSVATDDGIVIVNS+
Subjt:  CRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVNSS

Query:  GNENGLVVMDGSINEDAGTVV
        G+ENG V MDG I EDAGTVV
Subjt:  GNENGLVVMDGSINEDAGTVV

A0A6J1GMD4 RING-type E3 ubiquitin transferase1.2e-15689.47Show/hide
Query:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP------SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPAT
        MSSA+AA  +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP      SSSSSSSSSSSLLCP CLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHP SSSSPPDSDPSSFV+VDPLP T
Subjt:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP------SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPAT

Query:  SDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDS
        SDDNYLL+SPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSS MLEEDP+LICAICKD+FLL+VEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDS
Subjt:  SDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDS

Query:  CPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIV
        CPLCR+KLPSD+PSDHVRCRGATMALLRARDLM QEDSYGLRTTL H+ARRHSSIFSEG+QVDSSQSPTQLGVA +G+GEQTDS ETVSSVATDDGIVIV
Subjt:  CPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIV

Query:  NSSGNENGLVVMDGSINEDAGTV
        NSSG+ENG VVMDG INEDAGT+
Subjt:  NSSGNENGLVVMDGSINEDAGTV

A0A6J1JS41 RING-type E3 ubiquitin transferase3.2e-15789.75Show/hide
Query:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP-----SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATS
        MSSA+AA  +AAERHTYWCHECDMSVTLVSP     SSSSSSSSSSSLLCP CLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFV+VDPLP TS
Subjt:  MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSP-----SSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATS

Query:  DDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
        DDNYLL+SPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSS MLEEDP+LICAICKD+FLLDVEAK+LPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC
Subjt:  DDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSC

Query:  PLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVN
        PLCR+KLPSD+PSDHVRCRGATMALLRARDLM QEDSYGLRTTL H+ARRHSSIFSEG+QVD SQSPTQLGVA +G+GEQTDS ETVSSVATDDGIVIVN
Subjt:  PLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVN

Query:  SSGNENGLVVMDGSINEDAGTV
        SSG+ENG V+MDG INEDAGT+
Subjt:  SSGNENGLVVMDGSINEDAGTV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A1.1e-1641.58Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    LF+QL+  +     P  P       ++++ A+PTIK++   L       C +CKD+F L  EAK++PC+H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
Subjt:  PQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP

Query:  S
        S
Subjt:  S

O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A9.1e-1631.33Show/hide
Query:  SVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPI----SSSSPPDS-------DPSSFVV---------VDPLPATSDDNYLLNSP
        S T   P SSSSS+ S+S+      T  +      +  + S+ S +P+     S++ P S       D S+F +         + PLP +  + +LL S 
Subjt:  SVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPI----SSSSPPDS-------DPSSFVV---------VDPLPATSDDNYLLNSP

Query:  QFLRLFQQLA--DSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKL
         F RL  Q++  + + +    S    P +  K+++ A+P I++  T L  D    CA+CK+ F+L   A+ +PC+H+YHPDCILPWL+  +SCP+CR +L
Subjt:  QFLRLFQQLA--DSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKL

Query:  PSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGL
        P++D +D     GA +  + A     ++ + GL
Subjt:  PSDDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGL

P0CH30 E3 ubiquitin-protein ligase RING12.3e-1939.84Show/hide
Query:  LPATSDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTP--IKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPW
        LPA   D ++   P   +L QQLA++  + +         TP   K+++ A+P + ++ + L  +    CA+C D F    EAK++PC HLYH DC+LPW
Subjt:  LPATSDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTP--IKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPW

Query:  LSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA
        L  H+SCP+CR +LP+DDP    R RGA
Subjt:  LSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA

Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like3.3e-1829.03Show/hide
Query:  SSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVV-------------
        S+ +AAA    ++  ++C++C+ +VT+       S SSS+   CP+C   FLE  ++  P  + S++ +P SS S  P +DP S ++             
Subjt:  SSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVV-------------

Query:  ----------VDPLPATSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FAPSV-----------PFNPFTP--IKASV
                  + P   ++  N          +L N  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP   K+++
Subjt:  ----------VDPLPATSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FAPSV-----------PFNPFTP--IKASV

Query:  MAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA
         A+PT+KV+  ML+ + +  CA+C D+F    + K++PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP    R +G+
Subjt:  MAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA

Q9SPL2 E3 ubiquitin-protein ligase CIP86.9e-1647.95Show/hide
Query:  KASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDD
        K+++ A+ T +VSS+  E + V++CA+CKD  ++    K+LPC H YH DCI+PWL   +SCP+CRF+L +DD
Subjt:  KASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40830.1 RING-H2 finger C1A7.6e-1841.58Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    LF+QL+  +     P  P       ++++ A+PTIK++   L       C +CKD+F L  EAK++PC+H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
Subjt:  PQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP

Query:  S
        S
Subjt:  S

AT2G40830.2 RING-H2 finger C1A7.6e-1841.58Show/hide
Query:  PQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP
        P    LF+QL+  +     P  P       ++++ A+PTIK++   L       C +CKD+F L  EAK++PC+H+YH DCI+PWL  H+SCP+CR +LP
Subjt:  PQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLP

Query:  S
        S
Subjt:  S

AT2G44330.1 RING/U-box superfamily protein3.7e-2047.12Show/hide
Query:  SDFAPSVPF----NPFTPIKAS-----VMAIPTIKVSSTML----EEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSD
        S F  S PF    NPF   + S     + ++PTIK+SS+ML     +D  L CAIC++ F++   A+RLPC+HLYH DCI+PWL++H+SCPLCR +LP  
Subjt:  SDFAPSVPF----NPFTPIKAS-----VMAIPTIKVSSTML----EEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSD

Query:  DPSD
           D
Subjt:  DPSD

AT3G19950.1 RING/U-box superfamily protein2.4e-1929.03Show/hide
Query:  SSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVV-------------
        S+ +AAA    ++  ++C++C+ +VT+       S SSS+   CP+C   FLE  ++  P  + S++ +P SS S  P +DP S ++             
Subjt:  SSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSS-PPDSDPSSFVV-------------

Query:  ----------VDPLPATSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FAPSV-----------PFNPFTP--IKASV
                  + P   ++  N          +L N  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP   K+++
Subjt:  ----------VDPLPATSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQQLADSSDSD-------------FAPSV-----------PFNPFTP--IKASV

Query:  MAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA
         A+PT+KV+  ML+ + +  CA+C D+F    + K++PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP    R +G+
Subjt:  MAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGA

AT3G60080.1 RING/U-box superfamily protein3.9e-4642.07Show/hide
Query:  MSSATAAAPSA---AERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPD------SDPSSFVVVDPL
        MSS+T    +     ER TYWCHECDMS++L+  SSS S S SS LLCP C  DFLE MD    +SSS++ D  I      D       D   +  VDP 
Subjt:  MSSATAAAPSA---AERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPD------SDPSSFVVVDPL

Query:  PATSDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKAS-VMAIPTIKVSSTML------EEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDC
           SDDN+LL+SP   RL + LA  +    + S   +  + +K+S + +IPTI++SS++L      + D VL+CA+CK+ F++   A+RLPCSH+YH DC
Subjt:  PATSDDNYLLNSPQFLRLFQQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKAS-VMAIPTIKVSSTML------EEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDC

Query:  ILPWLSNHDSCPLCRFKLPS------DDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSI
        I+PWLS+H+SCPLCRF+LP+            +R R + +A + A     ++D  G+R  LR +ARRH  +
Subjt:  ILPWLSNHDSCPLCRFKLPS------DDPSDHVRCRGATMALLRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCTCCGCCACCGCAGCCGCCCCCTCCGCCGCCGAACGGCACACTTACTGGTGCCACGAGTGCGATATGAGCGTCACTTTGGTTTCCCCTTCTTCCTCGTCTTCTTC
ATCTTCTTCTTCCTCTCTCCTTTGCCCTCTCTGTCTCACTGACTTCCTCGAACACATGGATTTCACCATCCCCACTTCCTCTTCTTCAATTTCCGACCACCCCATTTCCT
CTTCTTCCCCTCCGGATTCCGATCCCTCATCCTTCGTCGTCGTCGACCCTCTTCCGGCCACCTCCGATGACAATTACCTCCTCAATAGCCCTCAATTCCTCCGCCTCTTC
CAGCAGCTCGCTGATTCATCCGATTCCGACTTCGCCCCATCTGTGCCCTTTAACCCCTTTACTCCGATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCCACTATTAAAGTTTCCTC
TACCATGCTTGAGGAAGACCCAGTTCTAATTTGTGCTATTTGCAAGGATCAGTTCCTTCTTGATGTTGAAGCCAAACGGCTCCCCTGTTCTCATCTTTACCATCCGGATT
GTATTCTTCCTTGGCTTTCTAATCATGATTCTTGCCCGCTTTGCCGTTTTAAGCTCCCATCTGATGACCCTTCAGATCATGTCAGATGTAGAGGGGCGACTATGGCTTTG
TTGAGGGCTAGGGATTTGATGCATCAGGAGGATAGTTATGGGTTGAGGACTACTCTGCGGCATATTGCTAGAAGGCATAGTTCTATTTTTAGTGAGGGAATTCAAGTGGA
TTCGTCTCAATCTCCCACTCAGTTGGGGGTTGCTGAGATTGGGAGTGGGGAACAGACTGACAGTGGTGAGACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGATGATGGGATTGTGATTG
TCAATAGCAGCGGTAATGAGAATGGACTTGTGGTAATGGATGGATCTATAAATGAGGATGCTGGCACTGTAGTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTACAACCCACCAAATAAAGCAAAGGGAATGGCGGACGGACCCACACGGGCAGCCCTGCCACTAACCAACTGCGCTAAAACCCAATTTGAAAACCACACCTAAAAATCCA
AAATCTCTTATCTGTACCCAATTTTGAGGGGCGAGATCGATTGAAACCCCAAAAATCATCGGTTCGTCACCTCCACTGTGGTAAAAACCATGTCCTCCGCCACCGCAGCC
GCCCCCTCCGCCGCCGAACGGCACACTTACTGGTGCCACGAGTGCGATATGAGCGTCACTTTGGTTTCCCCTTCTTCCTCGTCTTCTTCATCTTCTTCTTCCTCTCTCCT
TTGCCCTCTCTGTCTCACTGACTTCCTCGAACACATGGATTTCACCATCCCCACTTCCTCTTCTTCAATTTCCGACCACCCCATTTCCTCTTCTTCCCCTCCGGATTCCG
ATCCCTCATCCTTCGTCGTCGTCGACCCTCTTCCGGCCACCTCCGATGACAATTACCTCCTCAATAGCCCTCAATTCCTCCGCCTCTTCCAGCAGCTCGCTGATTCATCC
GATTCCGACTTCGCCCCATCTGTGCCCTTTAACCCCTTTACTCCGATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCCACTATTAAAGTTTCCTCTACCATGCTTGAGGAAGACCC
AGTTCTAATTTGTGCTATTTGCAAGGATCAGTTCCTTCTTGATGTTGAAGCCAAACGGCTCCCCTGTTCTCATCTTTACCATCCGGATTGTATTCTTCCTTGGCTTTCTA
ATCATGATTCTTGCCCGCTTTGCCGTTTTAAGCTCCCATCTGATGACCCTTCAGATCATGTCAGATGTAGAGGGGCGACTATGGCTTTGTTGAGGGCTAGGGATTTGATG
CATCAGGAGGATAGTTATGGGTTGAGGACTACTCTGCGGCATATTGCTAGAAGGCATAGTTCTATTTTTAGTGAGGGAATTCAAGTGGATTCGTCTCAATCTCCCACTCA
GTTGGGGGTTGCTGAGATTGGGAGTGGGGAACAGACTGACAGTGGTGAGACTGTTTCTAGTGTGGCTACTGATGATGGGATTGTGATTGTCAATAGCAGCGGTAATGAGA
ATGGACTTGTGGTAATGGATGGATCTATAAATGAGGATGCTGGCACTGTAGTTTAGGATTTTGGAGTTTCTCCTTCGAGTTTTGTTTATGCCAATTTGAGGATTTATGAT
GGCTGTTTTTGGGTTTGTTACTTGAAACATCCGTCTAGAGCATATTGGTCTTAGATAAAGATCGAAGCTTGATCCAAGCTTTCTGCTCTTATTTCCTACTGATGGCACTT
TGGATAATTTTCTGGCGATGATGCAGAAAGACTACAAATTTGAAACAATTCAGGCTATTCGGCAAGTAATATAGTAGAGTATGCTTGTTAGAGGAATCTTAGAAAGCTAC
CCAAGTAGATGATTGATTGGAAGTGTAAATTGCTACAGAGAAAGACTCTGCTACCTTCTTCTTCTTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTCTTCCTCTCTTTTTT
CATCTTTGGTAACCATGTCTCTACGTAATAAGATTTGAAACTTATTAAAAATGTTATCAGCTAGCAATGTTTCCCTCCCCTCTTCCCCAATTCTCTCTTCAGTCATGAAT
ATATATCAATATCTCTATATATAAAGCTCAGCAGTTTGAATTTTGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSATAAAPSAAERHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSLLCPLCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPISSSSPPDSDPSSFVVVDPLPATSDDNYLLNSPQFLRLF
QQLADSSDSDFAPSVPFNPFTPIKASVMAIPTIKVSSTMLEEDPVLICAICKDQFLLDVEAKRLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDHVRCRGATMAL
LRARDLMHQEDSYGLRTTLRHIARRHSSIFSEGIQVDSSQSPTQLGVAEIGSGEQTDSGETVSSVATDDGIVIVNSSGNENGLVVMDGSINEDAGTVV