; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0007744 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0007744
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionglycine-rich protein-like
Genome locationLG02:3633237..3635009
RNA-Seq ExpressionTan0007744
SyntenyTan0007744
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572253.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.3e-3683.2Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKY----GGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYG
        M+SKAF+FLGLLFA VLLISSEVAARDLAETST +++E   ETNGVEDAKY    GGYGG GGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGR G GG GGYG
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKY----GGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYG

Query:  GGCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP
         GCRYGRCG RCCSYAGEVVEGA P
Subjt:  GGCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP

KAG7011884.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.4e-3583.74Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKY----GGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYG
        M+SKAF+FLGLLFA VLLISSEVAARDLAETST +++E   ETNGVEDAKY    GGYGG GGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGR G GG GGYG
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKY----GGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYG

Query:  GGCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGA
         GCRYGRCG RCCSYAGEVVEGA
Subjt:  GGCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGA

XP_022952570.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X1 [Cucurbita moschata]2.0e-3480.65Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKY----GGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYGG
        M+SKAF+FLGLLFA VLLISSEVAARDLAETST +++E   ETNGVEDAKY    GGYGG GGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY     GG GGYG 
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKY----GGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYGG

Query:  GCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP
        GCRYGRCG RCCSYAGEVVEGA P
Subjt:  GCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP

XP_022969295.1 glycine-rich protein-like [Cucurbita maxima]1.1e-3585.25Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETS-TRDDEVAVETNGVEDAKYGGY-GGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYGGGC
        M+SKAF+FLGLLFAF+LLISSEVAARDLAETS  ++ E  VETNGVEDAKYGGY GGYG  GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGR G GGRGGYG GC
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETS-TRDDEVAVETNGVEDAKYGGY-GGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYGGGC

Query:  RYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP
        RYGRCG RCCSYAGEVVEGA P
Subjt:  RYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP

XP_023554637.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-3381.97Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKYGGY-GGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYGGGC
        M+SKAF+FLG LFA +L+ISSEVAARDLAETS  +++E  VETNGVEDAKYGGY GGYG  GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGR G GG GGYG GC
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKYGGY-GGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYGGGC

Query:  RYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP
        RYGRCG RCCSYAGEVVEGA P
Subjt:  RYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C180 cold and drought-regulated protein CORA-like3.0e-3180.8Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAET-STRDDEVAVETNGVEDAKYG-----GYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYG
        M+SKAFVFLGLL AFVLL+SSEVAARDLAET S  D+E  VETNGVEDAKYG     GYGG GGYGRGGY GRGGY GRGGYGGRGG    YGGGRGGYG
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAET-STRDDEVAVETNGVEDAKYG-----GYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYG

Query:  GGCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP
         GCRYGRCG RCCSYAGEVVEGA P
Subjt:  GGCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP

A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like7.8e-3280.8Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETSTR-DDEVAVETNGVEDAKYG-----GYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYG
        M+SKAFVFLGLL AFVLL+SSEVAARDLAETS++ D+E  VETNGVEDAKYG     GYGG GGYGRGGY GRGGY GRGGYGGRGG    YGGGRGGYG
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETSTR-DDEVAVETNGVEDAKYG-----GYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYG

Query:  GGCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP
         GCRYGRCG RCCSYAGEVVEGA P
Subjt:  GGCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP

A0A6J1GKL6 glycine-rich protein-like isoform X23.9e-3177.5Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKYGGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYGGGCRY
        M+SKAF+FLGLLFA VLLISSEVAARDLAETST +++E   ETNGVEDAKYGGY        GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY     GG GGYG GCRY
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKYGGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYGGGCRY

Query:  GRCGGRCCSYAGEVVEGANP
        GRCG RCCSYAGEVVEGA P
Subjt:  GRCGGRCCSYAGEVVEGANP

A0A6J1GM55 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X19.9e-3580.65Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKY----GGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYGG
        M+SKAF+FLGLLFA VLLISSEVAARDLAETST +++E   ETNGVEDAKY    GGYGG GGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY     GG GGYG 
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETST-RDDEVAVETNGVEDAKY----GGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYGG

Query:  GCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP
        GCRYGRCG RCCSYAGEVVEGA P
Subjt:  GCRYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP

A0A6J1HZJ5 glycine-rich protein-like5.2e-3685.25Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETS-TRDDEVAVETNGVEDAKYGGY-GGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYGGGC
        M+SKAF+FLGLLFAF+LLISSEVAARDLAETS  ++ E  VETNGVEDAKYGGY GGYG  GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGR G GGRGGYG GC
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETS-TRDDEVAVETNGVEDAKYGGY-GGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYG-GGRGGYGGGC

Query:  RYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP
        RYGRCG RCCSYAGEVVEGA P
Subjt:  RYGRCGGRCCSYAGEVVEGANP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22612 Dormancy-associated protein 23.0e-0453.98Show/hide
Query:  KAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETSTRDDEVAVETNGVEDAKYGGYGGYGGY--------GRGGYGGRGGY-GGRGGYGGRGGY---GGRYGGGRG
        KA + LGLL A VLLISSEV+AR+L E      EV  +++ V DAKYGGYG  GGY        G GGY G GGY  G GGY G GGY   GG Y  G G
Subjt:  KAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETSTRDDEVAVETNGVEDAKYGGYGGYGGY--------GRGGYGGRGGY-GGRGGYGGRGGY---GGRYGGGRG

Query:  GYGGGCRYGRCGG
        GY GG  Y   GG
Subjt:  GYGGGCRYGRCGG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05530.1 Glycine-rich protein family4.0e-0450Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETSTRDDEVAVETNGVEDAKYGGYGGYGGY-GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYGGGCRY
        M SKA V  G LFA VLL+ +EVAA      S   + V        D   GG+GG GGY G GGY G GG+ G GGY G GGY    GGG GG  G CRY
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETSTRDDEVAVETNGVEDAKYGGYGGYGGY-GRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYGGGCRY

Query:  GRC------GGRCCSYAGEVVE
        G C        RCCSYAGE V+
Subjt:  GRC------GGRCCSYAGEVVE

AT2G05540.1 Glycine-rich protein family1.7e-0752.99Show/hide
Query:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETSTRD-----DEVAVETNGVEDAKYGGY--GGYGGYGRGGYGGR--GGYGGR-GGYGGR-GGYGGRYGGG
        M SKA +FL L+   VLLI+SEV ARDLAE S        DEV       +  ++GG+  GGYGG+  GGYGG   GGYG R GGY  R GGYG R GGG
Subjt:  MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETSTRD-----DEVAVETNGVEDAKYGGY--GGYGGYGRGGYGGR--GGYGGR-GGYGGR-GGYGGRYGGG

Query:  RGGYGGG-CRYGRC-----GG--RCCSYAGEVVE
         G  GGG CRYG C     GG  RCC+YAG+ V+
Subjt:  RGGYGGG-CRYGRC-----GG--RCCSYAGEVVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATTCCAAGGCTTTTGTTTTCCTCGGTCTTCTTTTCGCCTTTGTTCTTCTCATCTCCTCCGAGGTCGCTGCGAGAGACCTAGCCGAGACCTCCACCAGAGACGATGA
GGTCGCGGTGGAGACGAATGGCGTAGAGGACGCTAAGTATGGAGGTTATGGAGGTTATGGAGGCTACGGTCGTGGCGGCTATGGGGGACGTGGCGGCTACGGCGGCCGAG
GTGGCTATGGCGGACGTGGTGGCTACGGCGGCCGCTATGGTGGCGGGCGTGGCGGCTATGGAGGTGGTTGCCGGTACGGTCGGTGCGGTGGCAGGTGCTGCAGCTACGCC
GGTGAAGTGGTAGAGGGGGCAAACCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TATAAATCTTCCCCTAAAGATAAGATTTTGAAGAGAGCTGACTCACTTTTCCTTCTGATTTCAAAATATAATGCATCTCAATCAGTTCATCAACACCCAACTAAATTATG
GGCCAGTCTTTAATTGCCAATGTCTGAATTCAACTCATTTCTCCTACTCTTGATGCCTATAAATACATCAAGAAGGATGCAAATCTTACTCATCCCATCTTCAAAAACCA
ATCTCTTATAAACACAAAAATGAATTCCAAGGCTTTTGTTTTCCTCGGTCTTCTTTTCGCCTTTGTTCTTCTCATCTCCTCCGAGGTCGCTGCGAGAGACCTAGCCGAGA
CCTCCACCAGAGACGATGAGGTCGCGGTGGAGACGAATGGCGTAGAGGACGCTAAGTATGGAGGTTATGGAGGTTATGGAGGCTACGGTCGTGGCGGCTATGGGGGACGT
GGCGGCTACGGCGGCCGAGGTGGCTATGGCGGACGTGGTGGCTACGGCGGCCGCTATGGTGGCGGGCGTGGCGGCTATGGAGGTGGTTGCCGGTACGGTCGGTGCGGTGG
CAGGTGCTGCAGCTACGCCGGTGAAGTGGTAGAGGGGGCAAACCCCTAAGGCAGCGTGTGAATGTGCTAAAATGAAGAAATAGTTTTAAAGTTATTTGTATTTGGTTAGT
GAGTGTATGAAGAACTGTGAAGTTTGAGAAATAAATGCAATGGGGAATCGAATGGCTGGGGCTTTTTCTTTTTCCCTGTGTTTTGTTTTTAGTGTGTTTCTACAGATTTG
CTTTTGCAAATTTTTATAATATCAAGAACATATTTCAGCTTTGTGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNSKAFVFLGLLFAFVLLISSEVAARDLAETSTRDDEVAVETNGVEDAKYGGYGGYGGYGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGGRYGGGRGGYGGGCRYGRCGGRCCSYA
GEVVEGANP