; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0007863 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0007863
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like
Genome locationLG06:7417403..7419016
RNA-Seq ExpressionTan0007863
SyntenyTan0007863
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0068047.1 protein no-on-transient A-like [Cucumis melo var. makuwa]3.4e-0855.88Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAA-VRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK----RIRSGRVG----GPHKSAANRSRLASFG
        MAAIKSL+ IS+ +ALL FSESL+TSAA  RG  +SNS+TG L RN+LQT     +  E K+NVHIK+    RIR    G    G  KSAA+RS++ASFG
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAA-VRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK----RIRSGRVG----GPHKSAANRSRLASFG

Query:  VG
        +G
Subjt:  VG

KAG6575859.1 hypothetical protein SDJN03_26498, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.2e-1461.39Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKINVHIKKRIRSGRVGGPHKSAANRSRLASFGVGS
        MAA+KSLVS+++ +ALLLFSESL T++AV  S  SNSLTG L RN+LQT        +VESS ERK+NVHIK+R+R     G   SAANRSR+AS GVGS
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKINVHIKKRIRSGRVGGPHKSAANRSRLASFGVGS

Query:  V
        V
Subjt:  V

KAG6593163.1 hypothetical protein SDJN03_12639, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.2e-1058.76Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKKRIRSGRV--GGPHKSAANRSRLASFGVGSV
        MAAIK+L+SI++ +ALLLF ESL TSAAV   AS+ SL G L RNI+QTT +     E+K NVHIK+R+R   V  G P  SAANRSR A  GVGS+
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKKRIRSGRV--GGPHKSAANRSRLASFGVGSV

KAG7025561.1 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-0757.78Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKKRIRSGRV--GGPHKSAANRSRLA
        MAAIK+L+SI++ +ALLLF ESL TSAAV   AS+ SL G L RNI+QTT +     E+K NVHIK+R+R   V  G P  S ANRSR A
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKKRIRSGRV--GGPHKSAANRSRLA

KGN44886.1 hypothetical protein Csa_015765 [Cucumis sativus]1.3e-0755.45Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAA-VRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK-------RIRSGRVGGPHKSAANRSRLASFGV
        MAAIKSL+SIS+ +ALL FSESL+TSAA  RG  +SNS+T  L RNILQT     +  E K+NV IKK        I +G   G   SAANRSR+ SFG+
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAA-VRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK-------RIRSGRVGGPHKSAANRSRLASFGV

Query:  G
        G
Subjt:  G

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAQ7 Uncharacterized protein6.2e-0855.45Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAA-VRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK-------RIRSGRVGGPHKSAANRSRLASFGV
        MAAIKSL+SIS+ +ALL FSESL+TSAA  RG  +SNS+T  L RNILQT     +  E K+NV IKK        I +G   G   SAANRSR+ SFG+
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAA-VRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK-------RIRSGRVGGPHKSAANRSRLASFGV

Query:  G
        G
Subjt:  G

A0A1S3BT53 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like2.9e-0551.46Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKIN-VHIKKRIR------SGRVGGPHKSAANRSRL
        MAAI+ LVSI++ +ALL FSESL T         S+SLTG  HRNIL T        +VESS +RK N +H K R R      SG  G  HKSA NRSR+
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKIN-VHIKKRIR------SGRVGGPHKSAANRSRL

Query:  ASF
        ASF
Subjt:  ASF

A0A5A7VLE5 Protein no-on-transient A-like1.6e-0855.88Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAA-VRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK----RIRSGRVG----GPHKSAANRSRLASFG
        MAAIKSL+ IS+ +ALL FSESL+TSAA  RG  +SNS+TG L RN+LQT     +  E K+NVHIK+    RIR    G    G  KSAA+RS++ASFG
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAA-VRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK----RIRSGRVG----GPHKSAANRSRLASFG

Query:  VG
        +G
Subjt:  VG

A0A5D3D3Y6 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like1.5e-0651.85Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKIN-VHIKKRIR------SGRVGGPHKSAANRSRL
        MAAI+ LVSI++ +ALL FSESL T         S+SLTG  HRNIL T        +VESS +RK N +H K R R      SG  G  HKSA NRSR+
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKIN-VHIKKRIR------SGRVGGPHKSAANRSRL

Query:  ASFGVGSV
        ASF VGS+
Subjt:  ASFGVGSV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCGATCAAATCTCTAGTCTCGATATCAATTGTCGTTGCTCTTCTCTTGTTCTCTGAATCTCTAGCCACTTCCGCCGCCGTTCGCGGCAGCGCTTCGTCAAATTC
TCTCACCGGAAAACTTCATCGGAACATCCTTCAGACGACCGTCGAGTCCTCCGTCGAACGGAAGATAAATGTTCATATCAAAAAGCGGATCCGATCTGGACGAGTTGGCG
GCCCCCATAAATCGGCGGCGAATCGGAGCCGACTCGCCTCGTTTGGGGTTGGATCTGTCAAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCGATCAAATCTCTAGTCTCGATATCAATTGTCGTTGCTCTTCTCTTGTTCTCTGAATCTCTAGCCACTTCCGCCGCCGTTCGCGGCAGCGCTTCGTCAAATTC
TCTCACCGGAAAACTTCATCGGAACATCCTTCAGACGACCGTCGAGTCCTCCGTCGAACGGAAGATAAATGTTCATATCAAAAAGCGGATCCGATCTGGACGAGTTGGCG
GCCCCCATAAATCGGCGGCGAATCGGAGCCGACTCGCCTCGTTTGGGGTTGGATCTGTCAAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAVRGSASSNSLTGKLHRNILQTTVESSVERKINVHIKKRIRSGRVGGPHKSAANRSRLASFGVGSVK