; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0007876 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0007876
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationLG03:67066432..67072582
RNA-Seq ExpressionTan0007876
SyntenyTan0007876
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN48169.1 hypothetical protein Csa_004025 [Cucumis sativus]1.1e-19183.22Show/hide
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TYK05878.1 uncharacterized protein E5676_scaffold432G00090 [Cucumis melo var. makuwa]2.1e-19383.68Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KH78 Uncharacterized protein5.5e-19283.22Show/hide
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A0A0A0LAG1 Uncharacterized protein2.5e-14464.33Show/hide
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A0A1S3BNS7 uncharacterized protein LOC1034916481.5e-19484.14Show/hide
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A0A5A7TUW1 Uncharacterized protein1.5e-19484.14Show/hide
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A0A5D3C3U1 Uncharacterized protein1.0e-19383.68Show/hide
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         NGQ DM+R V  Q FVKGLELD+ ETA LFFMVSFLSAVYGWV+LSFTLTY+LVLGMVFISVVNDLTG+FSSLVG ICDGT+LG KRLS FIIMKWAVR
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Query:  DALTQLLGVWYFGEIESKYSFFKLFVRLKLMPFSIMSPWIQGFEKEISGFLLTWFLMDTLLDFLFAVDAWAVLADSRRSGREIVKEGCYLLSIMLNQAVQ
        DALTQLLG+WYFGEIE+KYSFFKLFVRLKLMPFSIMSPW++GFEKEISGF+ TWFLMD+LL FLFAVDAWAVLADSRRSGREIVKEGCYLLSIMLNQAVQ
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        I CLEAIFCG L R V+G  LGKYVAM FQSVVE+
Subjt:  IKCLEAIFCGWLSRGVLGWILGKYVAMVFQSVVEI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37035.1 unknown protein9.5e-9649.01Show/hide
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        MTDH  H         RLR+T+ L RQ +SSF S+  TF+ L+ LL SF  LV++ + ++TSF+D DPSL +LLSRL  P N           S S  PT
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Query:  R-RFRRRRPFLHLTRVGTLDDDLFSGD-GDEDRRLFGAGNGLSP-NRSFLMFTHFDSMLGVSDSVVDNGISVSEVVRPGVAFRARIASLVVNNDGGEDQD
        R    RR PFL LTR+GTLDDD FS D  D  RR     +  SP N + +  + F+S+ G S  ++DNG+ + +++R GV  R     L   + GG++ +
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Query:  EEKRDVERENGNGNGQSDMDRAVGFQFFVKGLELDHRETAVLFFMVSFLSAVYGWVVLSFTLTYSLVLGMVFISVVNDLTGKFSSLVGTICDGTILGFKR
         E  + E +  +     D +  V  +   KGLEL   + A LFF+VSFLSA YGWV+L FT  YSLVL ++F++V+NDL G+F S +G +  G+ LGFKR
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Query:  LSWFIIMKWAVRDALTQLLGVWYFGEIESKYSFFKLFVRLKLMPFSIMSPWIQGFEKEISGFLLTWFLMDTLLDFLFAVDAWAVLADSRRSGREIVKEGC
        ++ F++M+WAVRDALTQLLG+WYFGE+E +YSFF+LFVRLKLMPF++M PWI+GFEKEISGFL  WFL+DTL+  + AVDA+  + DSRR GREIVKEG 
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Query:  YLLSIM
           S++
Subjt:  YLLSIM


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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