; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0008153 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0008153
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionextensin-like
Genome locationLG06:19949312..19951522
RNA-Seq ExpressionTan0008153
SyntenyTan0008153
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6576117.1 hypothetical protein SDJN03_26756, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.5e-18583.77Show/hide
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KAG7014636.1 hypothetical protein SDJN02_24815 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.5e-18583.77Show/hide
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XP_022991372.1 extensin-like [Cucurbita maxima]3.8e-18985.34Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAD5 Uncharacterized protein8.3e-18282.54Show/hide
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A0A5D3DMB9 Extensin1.2e-18083.25Show/hide
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A0A6J1JLM5 extensin-like1.9e-18985.34Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P13983 Extensin1.0e-0640.08Show/hide
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Query:  FSLSDPRTWIPYIPPFSPPLPPP---SPPPPFSLDDPRTWI--PHVPPFSPPPPPAFDPQDPRTWIPHIPQFSPPPPP-AFDPRDPRTWIPNIPPFSPSP
        +  S P       P +SPPLP P   SPPPP     P T+   P +PP   PPPPA+ P  P T+ P  P +SPPPP  A  P  P T+ P  P +SP P
Subjt:  FSLSDPRTWIPYIPPFSPPLPPP---SPPPPFSLDDPRTWI--PHVPPFSPPPPPAFDPQDPRTWIPHIPQFSPPPPP-AFDPRDPRTWIPNIPPFSPSP

Query:  PPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGAQNQKP
        P P     P    P  P F PPPP    L  P    PH  P PP     Q P
Subjt:  PPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGAQNQKP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 34.0e-0839.76Show/hide
Query:  LSYRPLKKNATLCGENKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYTFPFPFPPLPPFSSFPLPPLPPLPPLPPFPPVPYFPLPTCPNPSSLPFPFPPSPPLFPSP---
        LS  P+   +  CG +    P  +T         PP + P P PP P FS+ P    PP PP PP PPV Y P P  P P  +  P PP PP  P P   
Subjt:  LSYRPLKKNATLCGENKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYTFPFPFPPLPPFSSFPLPPLPPLPPLPPFPPVPYFPLPTCPNPSSLPFPFPPSPPLFPSP---

Query:  PSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYIPPFSPPLPPPSPPPPFSLDDPRTWIPHVPPF--SPPPPPAFDPQDPRTWIPHIPQFSPPPPPAFDPRDPRTWI
        P PPPP  PPPPP +S   P    P  P +SPP PPP PPP      P  + P  PP   SPPPPP+  P       P  P    PPPP F P  P  + 
Subjt:  PSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYIPPFSPPLPPPSPPPPFSLDDPRTWIPHVPPF--SPPPPPAFDPQDPRTWIPHIPQFSPPPPPAFDPRDPRTWI

Query:  PNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPP
         + PP   S PPP  P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
Subjt:  PNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G26960.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein9.8e-3441.86Show/hide
Query:  SLLLLLFTTSFFTNLFGLTAE----TPTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVD
        SL + LF    F  +  L+++     P     IT++G VYCD C  NS SKHSYF+ GV+V + C+F+A +    E +TFS NRTT+++G+Y++ I S+D
Subjt:  SLLLLLFTTSFFTNLFGLTAE----TPTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVD

Query:  GINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSKVCNVPGLKTTSEEISVKSKQDNLCIFSLSALSYRPLKKNATLCGE
           C D  ++ S CQASLIG    S   CN+PG +TT++++  KS+Q N C++  +AL++RP K++  LCG+
Subjt:  GINCVDGMTMQSFCQASLIGS---SSKVCNVPGLKTTSEEISVKSKQDNLCIFSLSALSYRPLKKNATLCGE

AT4G13340.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein2.9e-0939.76Show/hide
Query:  LSYRPLKKNATLCGENKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYTFPFPFPPLPPFSSFPLPPLPPLPPLPPFPPVPYFPLPTCPNPSSLPFPFPPSPPLFPSP---
        LS  P+   +  CG +    P  +T         PP + P P PP P FS+ P    PP PP PP PPV Y P P  P P  +  P PP PP  P P   
Subjt:  LSYRPLKKNATLCGENKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYTFPFPFPPLPPFSSFPLPPLPPLPPLPPFPPVPYFPLPTCPNPSSLPFPFPPSPPLFPSP---

Query:  PSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYIPPFSPPLPPPSPPPPFSLDDPRTWIPHVPPF--SPPPPPAFDPQDPRTWIPHIPQFSPPPPPAFDPRDPRTWI
        P PPPP  PPPPP +S   P    P  P +SPP PPP PPP      P  + P  PP   SPPPPP+  P       P  P    PPPP F P  P  + 
Subjt:  PSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYIPPFSPPLPPPSPPPPFSLDDPRTWIPHVPPF--SPPPPPAFDPQDPRTWIPHIPQFSPPPPPAFDPRDPRTWI

Query:  PNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPP
         + PP   S PPP  P  P +  P I P+  PPPP   +  P     + PP PP
Subjt:  PNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPP

AT4G22505.1 Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein8.7e-0641.59Show/hide
Query:  PLPPLPPFPPVPYFPLPTCPNPSSLPFPFPPSPPLFPSPPSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYIPPFSPPLP---PPSPPPPFSLDDPRTWIPHVPPF
        P P  PP P  P  P P  P     P P PP  P  P PP P  P TPPPPPP +   P T  P  PP SP +P   PP  PP      P    P  PP 
Subjt:  PLPPLPPFPPVPYFPLPTCPNPSSLPFPFPPSPPLFPSPPSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYIPPFSPPLP---PPSPPPPFSLDDPRTWIPHVPPF

Query:  SPP-PPPAFDPQDPRTWIPHIPQFSPP---------PPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSP------SPP--PPF-DPRDPRTWIPHIPPFFPP-PPPAFDLR
        SPP  PP   P+ P T  P +P  SPP          PP   PR P T  P  PP SP      SPP  PP   P  P T  P  PP  PP  PP    R
Subjt:  SPP-PPPAFDPQDPRTWIPHIPQFSPP---------PPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSP------SPP--PPF-DPRDPRTWIPHIPPFFPP-PPPAFDLR

Query:  DPRTWIPHFPPSPP
         P T  P  PP PP
Subjt:  DPRTWIPHFPPSPP

AT5G13140.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein2.0e-4744.11Show/hide
Query:  ISLLLLLFTTSFFTN-LFGLTAETPT------SVTRITVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEI
        + LL LLF  S  T+   G     P+        +RITVVG VYCDTC  N+ S+ SYFL GV+VH+ C+F+A +PK AE++  SVNRTT++ GVY+LEI
Subjt:  ISLLLLLFTTSFFTN-LFGLTAETPT------SVTRITVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEI

Query:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSK---VCNVPGLKTTSEEISVKSKQDNLCIFSLSALSYRPLKKNATLCG-------ENKEKIPDPLTSSKFFLP
        P VDGI+CVDG+ + S C A ++ +SS     C++P  +T + E+S+KSKQD +CI+SLSALSY+P  KN +LCG          EK+      SKFF P
Subjt:  PSVDGINCVDGMTMQSFCQASLIGSSSK---VCNVPGLKTTSEEISVKSKQDNLCIFSLSALSYRPLKKNATLCG-------ENKEKIPDPLTSSKFFLP

Query:  FFPPYTFPFPFPPLPPFSSFPLPPLPPLPPLPPFPPVPYFPLPTCPNPSSLPFPFPPSPPLFPSPPSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYIPPFSP
        +  PY FP+P+           P LPPLP LPPFP    FP P      SLPF  P                     P F   +P TWIPY+P F P
Subjt:  FFPPYTFPFPFPPLPPFSSFPLPPLPPLPPLPPFPPVPYFPLPTCPNPSSLPFPFPPSPPLFPSPPSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYIPPFSP

AT5G41050.1 Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein1.5e-3745.88Show/hide
Query:  IISLLLLLFTTSFFTNLFGLTAETPTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGI
        +I LLLLL   S   N   L   +     +ITV+G VYCD C +NS S HSYF+PGV+V + C+F + + +  E +TFS NRTT++ G+Y+L+I S++G+
Subjt:  IISLLLLLFTTSFFTNLFGLTAETPTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGI

Query:  NCVDGM---TMQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLKTTSEEISVKSKQDNLCIFSLSALSYRPLKKNATLCGE
         C       ++ + CQASLIG S   CNVPG +TT+E++  KSK  NLC++  +AL++RPL+KN  LCG+
Subjt:  NCVDGM---TMQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLKTTSEEISVKSKQDNLCIFSLSALSYRPLKKNATLCGE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTCAATTATTTCTCTCCTTCTCCTCCTCTTTACAACATCTTTCTTCACTAACTTGTTTGGCCTAACAGCTGAAACCCCAACGTCAGTCACTCGAATCACGGTAGT
GGGTGCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTATCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCTGTTGCTCCCA
AAATGGCTGAGCAGATGACCTTTTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCCTCTGTGGATGGAATTAATTGTGTTGATGGTATGACA
ATGCAGTCATTCTGCCAGGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCTAAAGTCTGCAATGTCCCGGGTTTAAAAACTACATCAGAAGAGATATCGGTGAAATCTAAGCAAGATAA
TCTCTGTATATTCAGCTTAAGCGCTTTGAGTTACAGGCCATTGAAGAAGAATGCAACCTTATGTGGAGAAAACAAAGAGAAAATTCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGT
TTTTTCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATACCTTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCACCATTCTCTTCCTTTCCTTTGCCTCCTCTTCCTCCATTGCCTCCACTTCCTCCA
TTCCCCCCTGTTCCATATTTTCCTCTCCCTACTTGTCCCAACCCATCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTCGCCACCTTTATTTCCTTCACCTCCAAGTCCACCTCC
GCCATCTACACCGCCTCCGCCACCTCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTACATTCCTCCATTTTCTCCTCCACTGCCTCCACCATCTCCGCCACCTC
CATTCAGTCTCGATGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTCCACCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTTGATCCTCAAGACCCAAGAACTTGGATTCCCCACATC
CCTCAATTTTCTCCTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGACCCTAG
AGACCCTAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCTGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTCCCCCCATCCCCTC
CACAGGGTGCTCAAAATCAAAAGCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCACATTCAGCCAAAAAGGTACTTCACATGTCTTTGTTTGTAGCGAATAGAATAATCATTTTCTCTTTTCTGATTACAGTTGGTCTAACACCAAGAACTCACGGGCACA
TTATATGCAAACAGTATATAGCAAACAAACGCTTCAAAATTTTAAGGCCTTACCCATCATCATTCATTGATGCTTCTCTAAACCTCCAGCTCCTTGAGTCTTTCTTATGG
ATTCAATTATTTCTCTCCTTCTCCTCCTCTTTACAACATCTTTCTTCACTAACTTGTTTGGCCTAACAGCTGAAACCCCAACGTCAGTCACTCGAATCACGGTAGTGGGT
GCAGTTTATTGTGACACATGTTTGAGCAACAGTATCTCCAAACACAGCTACTTCTTGCCTGGTGTGGATGTCCATTTACAGTGCAAATTCAGAGCTGTTGCTCCCAAAAT
GGCTGAGCAGATGACCTTTTCTGTCAACAGAACAACAGATAAATATGGAGTATATAGATTGGAAATTCCCTCTGTGGATGGAATTAATTGTGTTGATGGTATGACAATGC
AGTCATTCTGCCAGGCAAGCTTAATAGGAAGCTCATCTAAAGTCTGCAATGTCCCGGGTTTAAAAACTACATCAGAAGAGATATCGGTGAAATCTAAGCAAGATAATCTC
TGTATATTCAGCTTAAGCGCTTTGAGTTACAGGCCATTGAAGAAGAATGCAACCTTATGTGGAGAAAACAAAGAGAAAATTCCAGATCCCTTGACCTCCTCAAAGTTTTT
TCTCCCTTTCTTCCCTCCTTATACCTTCCCTTTCCCCTTTCCTCCTCTGCCACCATTCTCTTCCTTTCCTTTGCCTCCTCTTCCTCCATTGCCTCCACTTCCTCCATTCC
CCCCTGTTCCATATTTTCCTCTCCCTACTTGTCCCAACCCATCATCTTTACCATTTCCTTTCCCACCTTCGCCACCTTTATTTCCTTCACCTCCAAGTCCACCTCCGCCA
TCTACACCGCCTCCGCCACCTCCATTTAGTCTCAGTGATCCAAGGACCTGGATACCCTACATTCCTCCATTTTCTCCTCCACTGCCTCCACCATCTCCGCCACCTCCATT
CAGTCTCGATGATCCAAGGACCTGGATACCCCATGTTCCACCATTTTCCCCTCCCCCACCTCCTGCTTTTGATCCTCAAGACCCAAGAACTTGGATTCCCCACATCCCTC
AATTTTCTCCTCCCCCACCTCCTGCATTTGATCCTAGAGACCCCAGAACATGGATTCCCAATATTCCTCCATTTTCTCCTTCTCCACCTCCTCCATTTGACCCTAGAGAC
CCTAGAACATGGATTCCCCATATTCCTCCATTTTTCCCTCCCCCACCTCCTGCATTCGACCTTAGAGACCCCAGAACATGGATACCCCATTTCCCCCCATCCCCTCCACA
GGGTGCTCAAAATCAAAAGCCCTAATATTGTTCTTTGTCTTCCCTCCTCTTTACCTCTACAAATTTTCTTTCAATATGATATTGTTTGATGTGTGCTTATGTATTTATCC
GGCGCCATGCCCATTCAGGCAAAACCACAAACACCTTGTGTGCCCATTGTTTTTTCTAGCTAAAACCACTATAATTCATGTACAGAAAACTACGGGAATTTATCCGTTTA
TATGAATCAAGAAGAAGCTGGATATCATCACTGTATTGTTTCATTAATCTTCAAATTTGCAAGAAAGCTTACATTCTCAAGTACTTAGTGAATTATGCTAAAAGGAAAAA
ACAAGTAAGAAAAACTTTGATCGTCCGTACCTTTCTTCTGGATTATACCACCGCAACGAAACAATGCCAAAGGAATTGAATGGTCTTCAATACAGAATACCTTTCTACCT
AATTTGAGCGGTGACAATGACAGATGATATCATTCAGTTCCTGTTTAGTTTTCACTTTTCTTTTTCTGATTCTGATGCTTTTTTGATGTGGTTGTCAGAGGAAAACCTGA
AGTTCGTTTTACGAATTCACCATGCCAAACGAAACTCCATAAAGTTGGCCGTTTTTCCTCTTCATCTTTCTTCTAATGGATCAATTCTTCTCCGAAGAAAAATGAAAGTC
ATAGATGGAACGAGTGGTAAACATAGCAATGTTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDSIISLLLLLFTTSFFTNLFGLTAETPTSVTRITVVGAVYCDTCLSNSISKHSYFLPGVDVHLQCKFRAVAPKMAEQMTFSVNRTTDKYGVYRLEIPSVDGINCVDGMT
MQSFCQASLIGSSSKVCNVPGLKTTSEEISVKSKQDNLCIFSLSALSYRPLKKNATLCGENKEKIPDPLTSSKFFLPFFPPYTFPFPFPPLPPFSSFPLPPLPPLPPLPP
FPPVPYFPLPTCPNPSSLPFPFPPSPPLFPSPPSPPPPSTPPPPPPFSLSDPRTWIPYIPPFSPPLPPPSPPPPFSLDDPRTWIPHVPPFSPPPPPAFDPQDPRTWIPHI
PQFSPPPPPAFDPRDPRTWIPNIPPFSPSPPPPFDPRDPRTWIPHIPPFFPPPPPAFDLRDPRTWIPHFPPSPPQGAQNQKP