CuGenDBv2

Gene ID	Tan0008187
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	Unknown protein
Genome location	LG07:69471369..69473453
RNA-Seq Expression	Tan0008187
Synteny	Tan0008187
Gene Ontology terms	GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

XP_008437135.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103482648 [Cucumis melo]

3.9e-109

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4.3e-116

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XP_022996178.1 uncharacterized protein LOC111491485 [Cucurbita maxima]

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XP_023532969.1 uncharacterized protein LOC111794981 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

4.8e-115

92.12

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XP_038874696.1 uncharacterized protein LOC120067243 [Benincasa hispida]

1.7e-112

90.46

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KKI9 Uncharacterized protein

1.8e-107

88.38

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A0A1S3AT96 uncharacterized protein LOC103482648

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A0A5A7TDT6 Uncharacterized protein

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A0A6J1H2V9 uncharacterized protein LOC111459862

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A0A6J1KA41 uncharacterized protein LOC111491485

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G62780.1 unknown protein

7.4e-82

67.92

Show/hide

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        MA LSFG  A A  V +   + R       ITC  WDP+G+ GP QTGHIAR EFKRRLERD+EAREAF++Q+REEKERR+ALR+SRVVP     LIEYF
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        LDTEAQ+IE+EIARLR RL +EFF+ ++LE+G++RFAV KT  +EDR+IELE LQKALEEGIEAYDKMQ EL+ A   LTK+LTS DIK TLL+MVE+N+
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        +NRSLLALLDENI+NA KGNQKEA  +MEKIR +VLKY+T
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCGCTCTTAGCTTCGGCTTCACCGCCACCGCCATCCACGTTTCATCTACATCGATTCTCACCCGCTCTCGCCCCAACCCCAAGACCATAACCTGCGTCGGATGGGA
CCCAGAAGGCCTCTTCGGACCGCCTCAGACCGGCCACATCGCCCGAAGAGAGTTCAAGAGGCGGCTGGAGAGGGACGCCGAAGCTCGCGAGGCTTTCGAGCGCCAAATCC
GGGAAGAGAAAGAGCGCCGCAAAGCGCTTCGGGAGTCTCGTGTAGTTCCGAGCAATGTGACTGGCCTTATTGAGTATTTTCTTGATACCGAAGCTCAGGATATTGAATTT
GAAATCGCCCGGTTGAGGCCCAGGCTGACCGAGGAGTTTTTTTCGAATTTAAAACTTGAGCTGGGTGAGCTTAGATTTGCTGTTAACAAAACCGAGGCCATGGAAGATAG
AGTGATTGAGTTAGAAGCATTACAGAAAGCACTTGAAGAAGGAATAGAAGCCTATGATAAAATGCAAGGTGAACTGGTAAAGGCAAGGGAAGGCTTAACCAAAATTTTAA
CATCAAAGGATATAAAAGCTACTTTGTTAGAGATGGTAGAGCGAAACGAGCTCAATAGATCGTTACTGGCCCTTCTCGACGAAAACATATCCAATGCACAAAAGGGTAAC
CAGAAAGAAGCTGCTGCTTTCATGGAAAAGATTCGAGGGGCTGTTCTCAAGTATATGACAGCTTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

ATTCCCGCCACGGCTAGCTCTTCACTCGCATACGGATAATGCTGCTGCAGAGTACTACAGAGTGAGACGAGGACCCAAAAACCAGTGGCTGAGAAATTCCGACCTTTTCA
TTTTCACCATTTCACAGCGCCCATCCATGGCCGCTCTTAGCTTCGGCTTCACCGCCACCGCCATCCACGTTTCATCTACATCGATTCTCACCCGCTCTCGCCCCAACCCC
AAGACCATAACCTGCGTCGGATGGGACCCAGAAGGCCTCTTCGGACCGCCTCAGACCGGCCACATCGCCCGAAGAGAGTTCAAGAGGCGGCTGGAGAGGGACGCCGAAGC
TCGCGAGGCTTTCGAGCGCCAAATCCGGGAAGAGAAAGAGCGCCGCAAAGCGCTTCGGGAGTCTCGTGTAGTTCCGAGCAATGTGACTGGCCTTATTGAGTATTTTCTTG
ATACCGAAGCTCAGGATATTGAATTTGAAATCGCCCGGTTGAGGCCCAGGCTGACCGAGGAGTTTTTTTCGAATTTAAAACTTGAGCTGGGTGAGCTTAGATTTGCTGTT
AACAAAACCGAGGCCATGGAAGATAGAGTGATTGAGTTAGAAGCATTACAGAAAGCACTTGAAGAAGGAATAGAAGCCTATGATAAAATGCAAGGTGAACTGGTAAAGGC
AAGGGAAGGCTTAACCAAAATTTTAACATCAAAGGATATAAAAGCTACTTTGTTAGAGATGGTAGAGCGAAACGAGCTCAATAGATCGTTACTGGCCCTTCTCGACGAAA
ACATATCCAATGCACAAAAGGGTAACCAGAAAGAAGCTGCTGCTTTCATGGAAAAGATTCGAGGGGCTGTTCTCAAGTATATGACAGCTTAGTAGTGTCTGGTGGTACAG
ATTTAGAACTCTTTCTGTTTCTTCTCCTTTTACTTCAATTTTGTTGGGAAATACTTATAAAGTTTAGTGTCACACATTTATTTAAATGATAGAAAATAGACGAGTAATTG
TTGTTGAGTCGGCCCATGTTCTTTCATTTTGTTGTAAATTTTTGTCTGAAATATGAAAATTTTGATGCTTATAAGGAAGATTTGGTGTTGGTTGTGTTGGTATTTTCTAC
TGTATGTGTCTGTGTTGTATGGGACTCTTAAGTCTTATGAAGTTTATTTAAGGAACTTATATTAGGAGAGGCA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAALSFGFTATAIHVSSTSILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHIARREFKRRLERDAEAREAFERQIREEKERRKALRESRVVPSNVTGLIEYFLDTEAQDIEF
EIARLRPRLTEEFFSNLKLELGELRFAVNKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDIKATLLEMVERNELNRSLLALLDENISNAQKGN
QKEAAAFMEKIRGAVLKYMTA

Tan0008187 (gene) of Snake gourd v1 genome