; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0008247 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0008247
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionribonucleoside-diphosphate reductase small chain
Genome locationLG11:1567862..1568973
RNA-Seq ExpressionTan0008247
SyntenyTan0008247
Gene Ontology termsGO:0009263 - deoxyribonucleotide biosynthetic process (biological process)
GO:0004748 - ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor (molecular function)
InterPro domainsIPR000358 - Ribonucleotide reductase small subunit family
IPR009078 - Ferritin-like superfamily
IPR012348 - Ribonucleotide reductase-like
IPR030475 - Ribonucleotide reductase small subunit, acitve site
IPR033909 - Ribonucleotide reductase small subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578369.1 hypothetical protein SDJN03_22817, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-17994.55Show/hide
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XP_022939079.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like [Cucurbita moschata]2.9e-17994.85Show/hide
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XP_022993124.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like [Cucurbita maxima]2.2e-17994.55Show/hide
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XP_023550668.1 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-18095.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BWR9 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain3.9e-18295.15Show/hide
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A0A6J1FG17 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like1.4e-17994.85Show/hide
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A0A6J1JZC2 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain-like1.1e-17994.55Show/hide
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A0A6P4AGQ7 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain2.7e-17591.21Show/hide
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A0A6P9ES09 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain1.8e-17490.61Show/hide
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        RVGEYQKASVMSSLN NGGG H FK+DEDF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P07201 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain1.3e-12968.92Show/hide
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        EPLLA NP RF + PI+Y  IW+MYKKA ASFWTAEEVDLS+D+ HWE L  +EKHFI+HVLAFFAASDGIV ENL  RF KEVQV EAR FYGFQIA+E
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        NIHSEMYSLL++TYIKD  E++ LF+AIET+PC+++KA+WA++WI D S S+AER++AFA VEGIFFSGSF +IFWLKKRG+MPGLTFSNELISRDEGLH
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        CDFACL++S +  K S+E++  I+ +AV IE+ F+ +ALPC L+GMN DLM +YIEFVADRL++ L   K+YN +NPFD+ME ISL+GKTNFFEKRVGEY
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        QK  VMS  N   G  H F +D DF
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P0DKH3 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain B4.6e-15678.68Show/hide
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        MP++P+EP+L P PDRFCMFPI+YPQIWEMYKKA ASFWTAEEVDLSQD R WE  LT DE+HFI HVLAFFAASDGIVLENL+ RFM +VQ++EARAFY
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        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LF AIET+PC+ KKAEWA+KWI+GS+SFAER++AFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
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Query:  KRVGEYQKASVMSSLNVNG--GGIHEFKMDEDF
        KRVGEYQKAS+MSS++ N      H FK+DEDF
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P49730 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain6.2e-16986.67Show/hide
Query:  MPAIPKEPLLAPNPDRFCMFPIEYPQIWEMYKKAVASFWTAEEVDLSQDLRHWEGLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYG
        MP IP+EPLLA +PDRFCMFPI+YPQIWEMYKKA+ASFWTAEEVDLS D RHWE LT  E+HFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYG
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        DEGLHCDFACLLYSL+R KL+EE+V+GIV  AV+IEREFVCDALPCALVGMNGDLMS+YIEFVADRL+ ALG+ K+YN QNPFDWMELISLQGKTNFFEK
Subjt:  DEGLHCDFACLLYSLMRKKLSEEKVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSEYIEFVADRLVVALGHRKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEK

Query:  RVGEYQKASVMSSLNVNGGGIHEFKMDEDF
        RVGEYQKASVMSSLN N G  HEFK+DEDF
Subjt:  RVGEYQKASVMSSLNVNGGGIHEFKMDEDF

P50651 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A1.7e-14275.69Show/hide
Query:  KEPLLAPNPDRFCMFPIEYPQIWEMYKKAVASFWTAEEVDLSQDLRHWEGLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQIAI
        +EPLL     RF MFPI Y  IWEMYKKA ASFWTAEEVDLS D++ WE LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV EARAFYGFQIA+
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Query:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSVEKNRLFHAIETVPCIRKKAEWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK+RLF+AIET+PCI KKA+W L WI    SFA RL+AFACVEGIFFSGSFCAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
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Query:  CDFACLLYSLMRKKLSEEKVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSEYIEFVADRLVVALGHRKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY
        CDFACLLYSL++K+L  EKV  IV +AV+IE EFVC ALPC L+GMN +LMS+YI+FVADRL+V LG  + Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGEY
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Query:  QKASVMSSLNVNGGGIHEFKMDEDF
        QKASVMS+L  NG   +EF  +EDF
Subjt:  QKASVMSSLNVNGGGIHEFKMDEDF

Q9LSD0 Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain C4.2e-15780.42Show/hide
Query:  MPAIPKEPLLAPNPDRFCMFPIEYPQIWEMYKKAVASFWTAEEVDLSQDLRHWE-GLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFY
        MP++P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKA ASFWTAEEVDLSQD R WE  L   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQV+EARAFY
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Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVEKNRLFHAIETVPCIRKKAEWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCAIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LF AIET+PC+ KKA+WA+KWIDGS++FAER+IAFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
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Query:  RDEGLHCDFACLLYSLMRKKLSEEKVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSEYIEFVADRLVVALGHRKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+L++ KLSEE+V+ IV  AV+IEREFVCDALPCALVGMN DLMS+YIEFVADRL+ ALG+ K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
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Query:  KRVGEYQKASVMSSLNVNGG-GIHEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMSS+N NG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSSLNVNGG-GIHEFKMDEDF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23580.1 ribonucleotide reductase 2A1.2e-14375.69Show/hide
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        +EPLL     RF MFPI Y  IWEMYKKA ASFWTAEEVDLS D++ WE LT  EKHFI+H+LAFFAASDGIVLENLA RF+ +VQV EARAFYGFQIA+
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Query:  ENIHSEMYSLLLETYIKDSVEKNRLFHAIETVPCIRKKAEWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
        ENIHSEMYSLLLET+IKDS EK+RLF+AIET+PCI KKA+W L WI    SFA RL+AFACVEGIFFSGSFCAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLH
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Query:  CDFACLLYSLMRKKLSEEKVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSEYIEFVADRLVVALGHRKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEY
        CDFACLLYSL++K+L  EKV  IV +AV+IE EFVC ALPC L+GMN +LMS+YI+FVADRL+V LG  + Y  +NPFDWME ISLQGKTNFFEKRVGEY
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Query:  QKASVMSSLNVNGGGIHEFKMDEDF
        QKASVMS+L  NG   +EF  +EDF
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AT3G27060.1 Ferritin/ribonucleotide reductase-like family protein3.0e-15880.42Show/hide
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        MP++P+EPLL P PDRFCMFPI YPQIWEMYKKA ASFWTAEEVDLSQD R WE  L   E+HFI HVLAFFAASDGIVLENLA RFM +VQV+EARAFY
Subjt:  MPAIPKEPLLAPNPDRFCMFPIEYPQIWEMYKKAVASFWTAEEVDLSQDLRHWE-GLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFY

Query:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVEKNRLFHAIETVPCIRKKAEWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCAIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
        GFQIAIENIHSEMYSLLL+TYIKD+ E++ LF AIET+PC+ KKA+WA+KWIDGS++FAER+IAFACVEGIFFSGSFC+IFWLKKRGLMPGLTFSNELIS
Subjt:  GFQIAIENIHSEMYSLLLETYIKDSVEKNRLFHAIETVPCIRKKAEWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCAIFWLKKRGLMPGLTFSNELIS

Query:  RDEGLHCDFACLLYSLMRKKLSEEKVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSEYIEFVADRLVVALGHRKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE
        RDEGLHCDFACLLY+L++ KLSEE+V+ IV  AV+IEREFVCDALPCALVGMN DLMS+YIEFVADRL+ ALG+ K+Y V NPFDWMELISLQGKTNFFE
Subjt:  RDEGLHCDFACLLYSLMRKKLSEEKVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSEYIEFVADRLVVALGHRKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFE

Query:  KRVGEYQKASVMSSLNVNGG-GIHEFKMDEDF
        KRVG+YQKASVMSS+N NG    H F +DEDF
Subjt:  KRVGEYQKASVMSSLNVNGG-GIHEFKMDEDF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCGGCAATTCCAAAGGAGCCGTTGCTCGCCCCTAATCCCGATAGATTCTGCATGTTCCCAATTGAATATCCTCAGATTTGGGAAATGTATAAGAAAGCGGTGGCCTC
ATTCTGGACCGCCGAGGAAGTTGATCTCTCTCAGGACCTTCGCCATTGGGAAGGTCTCACCGCGGACGAGAAGCACTTCATCACACATGTTCTAGCCTTCTTCGCCGCTT
CCGACGGGATTGTTCTGGAGAACCTTGCCGGCCGGTTCATGAAGGAGGTTCAGGTCGCGGAGGCGAGAGCGTTCTACGGCTTTCAAATTGCGATTGAGAATATTCACTCG
GAGATGTACAGTTTGTTGCTCGAAACCTACATCAAGGATTCAGTCGAGAAGAACAGGTTGTTCCACGCCATCGAGACTGTACCTTGCATTAGGAAGAAGGCCGAGTGGGC
GCTCAAATGGATCGACGGCTCCGAGTCCTTCGCGGAAAGGCTGATCGCATTCGCCTGCGTTGAAGGCATCTTCTTCTCCGGAAGTTTCTGCGCTATATTCTGGTTGAAGA
AACGCGGGCTGATGCCGGGATTGACATTCTCGAACGAATTGATTTCACGAGACGAAGGGCTGCACTGCGATTTCGCTTGCTTGTTGTATTCGCTGATGAGGAAGAAACTG
AGCGAGGAGAAAGTGCAGGGGATCGTCCGGCAGGCGGTGGATATCGAGAGGGAATTCGTTTGTGACGCATTGCCGTGCGCGTTGGTAGGGATGAACGGCGATCTGATGAG
CGAGTACATCGAGTTCGTCGCGGATCGGCTAGTGGTAGCGTTAGGGCACAGAAAGATTTACAATGTGCAGAATCCATTCGATTGGATGGAACTAATATCGCTGCAGGGGA
AAACGAACTTCTTCGAAAAGAGGGTGGGAGAGTATCAGAAGGCGTCTGTGATGTCGAGCTTGAATGTCAATGGAGGAGGGATTCATGAGTTCAAGATGGATGAGGATTTT
TAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCGCGCGTATATATAACTCTCAGTATTCTGAACTCCTCTGCGAAAGCCTCATCCCTCAATAGTCCGATCAATCAGTCCACCGAAATTCTCTCTTTCAATTCAATCGGAGG
TTTCTCAAAATGCCGGCAATTCCAAAGGAGCCGTTGCTCGCCCCTAATCCCGATAGATTCTGCATGTTCCCAATTGAATATCCTCAGATTTGGGAAATGTATAAGAAAGC
GGTGGCCTCATTCTGGACCGCCGAGGAAGTTGATCTCTCTCAGGACCTTCGCCATTGGGAAGGTCTCACCGCGGACGAGAAGCACTTCATCACACATGTTCTAGCCTTCT
TCGCCGCTTCCGACGGGATTGTTCTGGAGAACCTTGCCGGCCGGTTCATGAAGGAGGTTCAGGTCGCGGAGGCGAGAGCGTTCTACGGCTTTCAAATTGCGATTGAGAAT
ATTCACTCGGAGATGTACAGTTTGTTGCTCGAAACCTACATCAAGGATTCAGTCGAGAAGAACAGGTTGTTCCACGCCATCGAGACTGTACCTTGCATTAGGAAGAAGGC
CGAGTGGGCGCTCAAATGGATCGACGGCTCCGAGTCCTTCGCGGAAAGGCTGATCGCATTCGCCTGCGTTGAAGGCATCTTCTTCTCCGGAAGTTTCTGCGCTATATTCT
GGTTGAAGAAACGCGGGCTGATGCCGGGATTGACATTCTCGAACGAATTGATTTCACGAGACGAAGGGCTGCACTGCGATTTCGCTTGCTTGTTGTATTCGCTGATGAGG
AAGAAACTGAGCGAGGAGAAAGTGCAGGGGATCGTCCGGCAGGCGGTGGATATCGAGAGGGAATTCGTTTGTGACGCATTGCCGTGCGCGTTGGTAGGGATGAACGGCGA
TCTGATGAGCGAGTACATCGAGTTCGTCGCGGATCGGCTAGTGGTAGCGTTAGGGCACAGAAAGATTTACAATGTGCAGAATCCATTCGATTGGATGGAACTAATATCGC
TGCAGGGGAAAACGAACTTCTTCGAAAAGAGGGTGGGAGAGTATCAGAAGGCGTCTGTGATGTCGAGCTTGAATGTCAATGGAGGAGGGATTCATGAGTTCAAGATGGAT
GAGGATTTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPAIPKEPLLAPNPDRFCMFPIEYPQIWEMYKKAVASFWTAEEVDLSQDLRHWEGLTADEKHFITHVLAFFAASDGIVLENLAGRFMKEVQVAEARAFYGFQIAIENIHS
EMYSLLLETYIKDSVEKNRLFHAIETVPCIRKKAEWALKWIDGSESFAERLIAFACVEGIFFSGSFCAIFWLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLLYSLMRKKL
SEEKVQGIVRQAVDIEREFVCDALPCALVGMNGDLMSEYIEFVADRLVVALGHRKIYNVQNPFDWMELISLQGKTNFFEKRVGEYQKASVMSSLNVNGGGIHEFKMDEDF