; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0008446 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0008446
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionTaste receptor type 1 member 1 like
Genome locationLG05:8278477..8285529
RNA-Seq ExpressionTan0008446
SyntenyTan0008446
Gene Ontology termsGO:0010228 - vegetative to reproductive phase transition of meristem (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7010788.1 hypothetical protein SDJN02_27584 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-16584.97Show/hide
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XP_004139994.1 uncharacterized protein LOC101218059 [Cucumis sativus]2.3e-16384.81Show/hide
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XP_022943893.1 uncharacterized protein LOC111448482 [Cucurbita moschata]2.7e-16484.39Show/hide
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XP_023511914.1 uncharacterized protein LOC111776784 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.4e-16584.39Show/hide
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XP_038901494.1 uncharacterized protein LOC120088343 [Benincasa hispida]5.5e-16584.94Show/hide
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        YNDM+ARKWY QGSWLLP +LVPFLGPALYLVLRPLP TTP PLNPAASEP+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KA76 Uncharacterized protein1.1e-16384.81Show/hide
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        MITN NLISCNFFSPSLP R+SKL I H  QT TRNP+ +R P ITPFK    +  N N    SSSSKMGL +KWR ASGSQT GDPV    SPVE E G
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        GS  GGNGGEGRDWTTSILLF LWAGLMFY+FN APNQTPSTD+YFLKKLLNLKSDDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPLVY MLLLPSGRSSNSNVPVWPFL
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        M+ARKWY QGSWLLP +LVPFLGPALYLVLRPLP  TP PLN AASEPK
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A0A1S3CKU4 uncharacterized protein LOC1035021033.2e-16385.3Show/hide
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        MITN NLISCNFFSPSLP R+SKL I H  QT TRNP+ LR P I PFK+  P   N      SSSSKMGL +KWR ASGSQT GDP  EK SPVE E G
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        G GGNGGEGRDWTTSILLF LWAGLMFY+FNLAPNQTPSTD+YFLKKLLNLKSDDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPLVY MLLLPSGRSSNSNVPVWPFLVL
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        ARKWY QGSWLLP +LVPFLGP+LYLVLRPLP  TP PLN AASEPK
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A0A6J1CIN4 uncharacterized protein LOC1110113181.2e-15782.56Show/hide
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        MITN NLISCNF SPSLPLRI KLGIAHQ  T   QKLR QI PFK+ I    N N  R SSSS+M LLQK R      TAGDP  EK++ VE+E G  G
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        GNGGEGRDWTTSILLF  WA LM+Y+FNLAPNQTPSTD+YFLKKLL LKSDDGFKMNEVLVSLWY+MGLWPLVYGMLLLPSGRSSNSNVPVWPFLVLS F
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        WY QGSWLLPF+L+P LGPALYLVLRP PTTTP P+N A SEPK
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A0A6J1FXH1 uncharacterized protein LOC1114484821.3e-16484.39Show/hide
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        MI N NLISCN FSPS P R SKLGI H+T TRN     PQI PFKY    C   N  R SS  K+GLLQKWR ASG+Q AGDPV EKA+PVESE GGS 
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Query:  -GGNGGEGRDWTTSILLFALWAGLMFYIFNLAPNQTPSTDIYFLKKLLNLKSDDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPLVYGMLLLPSGRSSNSNVPVWPFLVLS
         GGNGGEGRDWTTSILLF LWAGLMFY+F LAPNQTPSTD+YFLKKLLNLK+DDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPL+Y MLLLPSGRSSNSNVPVWPFL LS
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        RKWY QGSWLLPF+LVPFLGPALYLVLRP+PTTTP PL+ AASEPK
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A0A6J1J5P7 uncharacterized protein LOC1114836927.2e-16383.53Show/hide
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        MI+N NLISCN FSPS P R SKLGI H+T TRN     PQI PFKY    C   N  R SS  K+GLLQKWR AS S  AG PV EKA+PVESE GGS 
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         GGNGGEGRDWTTSILLF LWAGLMFY+F LAPNQTPSTD+YFLKKLLNLK+DDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPL+Y MLLLPSGRSSNSNVPVWPFL LS
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Query:  FFLGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEEDELKRWPLNFLESKFTAGITFAAGLGILFYAGLAGESAWKEFYQYFRESRFIHAMSIDFMLLSSFAPFWVYNDMTA
        FFLGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEE+EL+RWPLNFLESKFTAGITFAAGLG+LFYAGLAGESAWKEFYQYFRESRFIHA SIDFMLLSSFAPFWVYNDM+A
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        RKWY QGSWLLP +LVPFLGPALYLVLRP+PTTTP PL+PAASEPK
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04360.1 unknown protein2.1e-9853.64Show/hide
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        M+ + +LISCNF    LP R+ K       P+  PQ L  Q +    L+ + ++ + HR++   K      +     S ++ +P E + + ++       
Subjt:  MITNANLISCNFFSPSLPLRISKLGIAHQTPTRNPQKLRPQITPFKYLIPACSNCNIHRVSSSSKMGLLQKWRRASGSQTAGDPVEEKASPVESEGGGSG

Query:  GNGGEGRDWTTSILLFALWAGLMFYIFNLAPNQTPSTDIYFLKKLLNLKSDDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPLVYGMLLLPSGRSSNSNVPVWPFLVLSFF
            EGRDW++SILLFALW  L++Y FNLAP+QTP+ D+YFLKKLLNLK DDGF+MN++LV LWYIMGLWPLVY MLLLP+G    S  P WPF+VLSFF
Subjt:  GNGGEGRDWTTSILLFALWAGLMFYIFNLAPNQTPSTDIYFLKKLLNLKSDDGFKMNEVLVSLWYIMGLWPLVYGMLLLPSGRSSNSNVPVWPFLVLSFF

Query:  LGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEEDELKRWPLNFLESKFTAGITFAAGLGILFYAGLAGESAWKEFYQYFRESRFIHAMSIDFMLLSSFAPFWVYNDMTARK
         G Y LLPYF LW PP PPV E EL++WPLN LESK TAG+T  AGLGI+ Y+ +     W EFYQYFRES+FIH  S+DF LLS+FAPFWVYNDMT RK
Subjt:  LGAYGLLPYFVLWKPPPPPVEEDELKRWPLNFLESKFTAGITFAAGLGILFYAGLAGESAWKEFYQYFRESRFIHAMSIDFMLLSSFAPFWVYNDMTARK

Query:  WYGQGSWLLPFTLVPFLGPALYLVLRPLPTTTPAPLNPAASEP
        W+ +GSWLLP +++PFLGP+LYL+LRP  + T AP + A+S+P
Subjt:  WYGQGSWLLPFTLVPFLGPALYLVLRPLPTTTPAPLNPAASEP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAACCAATGCCAATCTTATCTCCTGCAACTTCTTCTCACCATCTCTTCCTTTAAGAATCTCGAAGCTTGGAATTGCCCACCAAACCCCAACTCGAAACCCCCAAAA
ATTACGCCCCCAAATCACTCCCTTCAAGTATTTGATTCCAGCCTGCTCCAATTGCAACATTCATCGAGTTTCAAGCTCCAGTAAAATGGGTCTGCTCCAAAAATGGCGGA
GAGCATCGGGAAGTCAGACTGCGGGAGACCCAGTTGAGGAAAAAGCGAGCCCAGTAGAAAGTGAGGGCGGCGGTAGCGGCGGAAATGGTGGGGAGGGAAGAGACTGGACG
ACTTCGATTTTACTGTTTGCTTTGTGGGCTGGTCTAATGTTTTATATTTTCAATCTCGCTCCAAATCAGACTCCGTCAACGGACATATATTTCTTGAAGAAGCTTTTGAA
CTTGAAAAGTGACGACGGTTTCAAAATGAATGAAGTGCTTGTGTCTCTTTGGTATATTATGGGCTTGTGGCCCCTTGTTTATGGCATGCTCCTGCTTCCTTCTGGCAGAA
GTTCAAATAGTAATGTTCCTGTCTGGCCTTTCCTAGTACTGTCATTCTTTTTGGGTGCTTATGGTCTTCTTCCATATTTTGTACTTTGGAAGCCACCGCCACCTCCTGTC
GAAGAAGATGAACTAAAGAGATGGCCTTTGAATTTTCTTGAGTCGAAATTTACTGCTGGGATAACATTTGCTGCAGGACTAGGTATATTATTTTATGCTGGATTAGCTGG
TGAGAGTGCGTGGAAGGAATTTTACCAGTACTTCAGAGAAAGCAGATTTATCCATGCCATGAGCATTGATTTCATGTTACTATCTTCATTTGCTCCATTTTGGGTTTACA
ATGACATGACTGCTCGAAAATGGTATGGCCAAGGTTCTTGGCTCCTTCCGTTTACGTTGGTGCCGTTCTTGGGTCCGGCCTTGTATCTCGTCCTACGACCGTTGCCAACG
ACGACTCCCGCCCCACTCAACCCAGCTGCATCTGAACCAAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AACAAAAAGCTCTTCAGCTAAGAGCTAACAAACCAGGGGAGCAAATGAAATGACATCTGTAAATAGAGGAACTCACTCAGGCTGCAATGGATCAGTGTGGTTCGACACTT
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GGAGAGCATCGGGAAGTCAGACTGCGGGAGACCCAGTTGAGGAAAAAGCGAGCCCAGTAGAAAGTGAGGGCGGCGGTAGCGGCGGAAATGGTGGGGAGGGAAGAGACTGG
ACGACTTCGATTTTACTGTTTGCTTTGTGGGCTGGTCTAATGTTTTATATTTTCAATCTCGCTCCAAATCAGACTCCGTCAACGGACATATATTTCTTGAAGAAGCTTTT
GAACTTGAAAAGTGACGACGGTTTCAAAATGAATGAAGTGCTTGTGTCTCTTTGGTATATTATGGGCTTGTGGCCCCTTGTTTATGGCATGCTCCTGCTTCCTTCTGGCA
GAAGTTCAAATAGTAATGTTCCTGTCTGGCCTTTCCTAGTACTGTCATTCTTTTTGGGTGCTTATGGTCTTCTTCCATATTTTGTACTTTGGAAGCCACCGCCACCTCCT
GTCGAAGAAGATGAACTAAAGAGATGGCCTTTGAATTTTCTTGAGTCGAAATTTACTGCTGGGATAACATTTGCTGCAGGACTAGGTATATTATTTTATGCTGGATTAGC
TGGTGAGAGTGCGTGGAAGGAATTTTACCAGTACTTCAGAGAAAGCAGATTTATCCATGCCATGAGCATTGATTTCATGTTACTATCTTCATTTGCTCCATTTTGGGTTT
ACAATGACATGACTGCTCGAAAATGGTATGGCCAAGGTTCTTGGCTCCTTCCGTTTACGTTGGTGCCGTTCTTGGGTCCGGCCTTGTATCTCGTCCTACGACCGTTGCCA
ACGACGACTCCCGCCCCACTCAACCCAGCTGCATCTGAACCAAAATAATCTTGTTTCTAAAGTGAACCAGAAAAAGGGAACTTAGCTGCAATGGTGGCAAAGAGAAGGTT
TCAGGTAAAGGAAGAAGTTTTGTATCTCACACTCGGTAGATTTAGGAAAAAGTGACAGTCAAATGATTTGTGAAGTGTTGTTATGTTAATATGTTTATTTGATAAAAAAA
GTGTCTCAATGTATTATGCTTCCAACAAGGTTAATTTTGTTAATTCCACACTTGAGGTTTTTTAATTTTCAATAACAGTCCTATGTATGAAGAACCTGACAAAATGATTC
GCAGCATTTATGACCCGGCGGGACCATTTCTCTACGAAGTTAAAGGTTCAAATTTAAATTTTCGCCTAAGGTAAGGCTAAGGACGTGCGGGGCGAGTGACAGAGGCGTGT
TGTCAGAACCATGGGAATAGTCATATTTTTCCGCATATTTTCCTTAAATAACTGATGTCGTCGTTTTATGATTTCAAAGTTTAAGTTTAAATTTCGTGGATTTTAAGTAG
GCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EEDELKRWPLNFLESKFTAGITFAAGLGILFYAGLAGESAWKEFYQYFRESRFIHAMSIDFMLLSSFAPFWVYNDMTARKWYGQGSWLLPFTLVPFLGPALYLVLRPLPT
TTPAPLNPAASEPK