| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7022543.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 3.8e-132 | 91.81 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPG------------RRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S+SRGRSRSV+SASPG RRSLSPRRSLSP+RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTP SVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPG------------RRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_008455209.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35 [Cucumis melo] | 7.5e-128 | 93.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGD-GGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRS+SRGRSRSVDS SPGRRS SPRRS SPRRSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT SVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGD-GGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| XP_022927926.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita moschata] | 3.8e-132 | 91.81 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPG------------RRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S+SRGRSRSV+SASPG RRSLSPRRSLSP+RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTP SVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPG------------RRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_022988862.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita maxima] | 5.2e-129 | 88.96 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRD+YRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPR------------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S+SRGRSRSV+SASPGRRS SPRRSLSPR RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTP SVSPRGQ ADSRSPSPQNSDV+K
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPR------------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| XP_023529917.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.7e-130 | 87.87 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPG------------------------RRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQN
S+SRGRSRSV+SASPG RRSLSPRRSLSP+RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTP SVSPRGQP DSRSPSPQN
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPG------------------------RRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQN
Query: SDVDK
SDVDK
Subjt: SDVDK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K7C0 RRM domain-containing protein | 1.5e-126 | 92.17 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRR+RDDYRD+DYRR RSRSRSRSLD++DRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDG-GRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRS+SRGRSRSVDS SPGRRS SPRRS SPRRSLSPRRSPSPR ESPERNG+G GRSPT SVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDG-GRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A1S3C0I4 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 3.6e-128 | 93.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGT+VDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERD+RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGD-GGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
SRS+SRGRSRSVDS SPGRRS SPRRS SPRRSLSPRRSPSPR ESPERNG+ GGRSPT SVSPRG+PADSRSPSPQNSD
Subjt: SRSQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGD-GGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSD
|
|
| A0A6J1CKN2 serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 5.2e-127 | 92.28 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAV+RLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
IHKGKISEAF K RYRSRSRSPRRRYRDD RDRDYRR RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY+DERRSRSR
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRR--RSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: --SRSQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
SRSQSRG+SRSVDSASPG RRS SPRRSLSP+RSPSPRGESP RNGDGGR+PTP SVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: --SRSQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| A0A6J1EIV3 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.9e-132 | 91.81 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPG------------RRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S+SRGRSRSV+SASPG RRSLSPRRSLSP+RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTP SVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPG------------RRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| A0A6J1JE82 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 2.5e-129 | 88.96 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDITDT+SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
I KGKISE FPKSR+RSRSRSPRRRYRD+YRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRY DERR+RSRS
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPR------------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S+SRGRSRSV+SASPGRRS SPRRSLSPR RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTP SVSPRGQ ADSRSPSPQNSDV+K
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPR------------------RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 9.1e-28 | 45.04 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
+G + S Y RSRSPRR RRRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S S+ R + + SRSRSR
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
S+SR RSRS S R S S RS SP +SP G
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.0e-27 | 44.63 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S S+ R + + SRSRSR
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
S+SR RSRS +S R S S RS SP +SP G
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q06A98 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.2e-27 | 45.04 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S S+ R + + SRSRSR
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
S+SR RSRS A S R S S RS SP +SP G
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.0e-27 | 44.63 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F KYG+V D++IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG V+DGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYG--PNAERI
Query: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
+G + Y RSRSPRR RRRSRSRSRS RS R R R + R R R RSRS S S+ R + + SRSRSR
Subjt: HKGKISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRS-DRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSR
Query: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
S+SR RSRS +S R S S RS SP +SP G
Subjt: SQSRGRSRSVDSASPGRRSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 4.1e-68 | 60.26 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DT+SLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R S
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQSRG----RSRSVDSASPGR----------RSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSP-
PD K R RGRY++E RS SRS S S RS S SP R RS SPRRSLSPR + SPS + SPER + RSP+P S +P
Subjt: PDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQSRG----RSRSVDSASPGR----------RSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSP-
Query: RGQPADSRSPSP
R A SRS SP
Subjt: RGQPADSRSPSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 8.2e-16 | 40.22 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKGKISEAFPKSRYR
Query: SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQSRGRSRSV
+ R R R R RD RRR+ R S RS RRGR R R DY R RSISPR D + R D SR RS + RG+SRS+
Subjt: SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQSRGRSRSV
Query: DSASPGRR-SLSPRRSLSP----RRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S SP R S SPRRS SP RS+SPRRS S SP R+ RSP S S +PA SRS SP D+
Subjt: DSASPGRR-SLSPRRSLSP----RRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 2.6e-14 | 38.54 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TG D RGF FV++ +A A +DG ++ GRE+TV FA+ N ++
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTG------------DSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHKG
Query: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
+ R+R R R+RD RRR+ R S RS RRGR R R DY R RSISPR D + R D SR R
Subjt: KISEAFPKSRYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDY------RRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSR
Query: SRSQSRGRSRSVDSASPGRR-SLSPRRSLSP----RRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
S + RG+SRS+ S SP R S SPRRS SP RS+SPRRS S SP R+ RSP S S +PA SRS SP D+
Subjt: SRSQSRGRSRSVDSASPGRR-SLSPRRSLSP----RRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPSPQNSDVDK
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 7.7e-14 | 38.04 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
FG S D+ SLLV N+ +DL F ++G V DI++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG ++ GRE+TV FA+ N ++ +
Subjt: FGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAERIHK
Query: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQ
+ + +S R++ R RSP R R R RRSRSRSR + R +SRS+SP+ RYE E RS SRS
Subjt: GKISEAFPKS-RYRSRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPSPDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQ
Query: SRGRSRSVDSASPGR---RSLSPRRSLSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPS
SR V S SPGR S SPRRS+SPR RS +P ++ R +SP RSPTP PRG RSPS
Subjt: SRGRSRSVDSASPGR---RSLSPRRSLSPR--RSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSPRGQPADSRSPS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.9e-69 | 60.26 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DT+SLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R S
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQSRG----RSRSVDSASPGR----------RSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSP-
PD K R RGRY++E RS SRS S S RS S SP R RS SPRRSLSPR + SPS + SPER + RSP+P S +P
Subjt: PDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQSRG----RSRSVDSASPGR----------RSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSP-
Query: RGQPADSRSPSP
R A SRS SP
Subjt: RGQPADSRSPSP
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 2.9e-69 | 60.26 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
MSHFGRSGPPDI+DT+SLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVD+FIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KAV+RLDG VVDGREITVQFAKYGPNAE+
Subjt: MSHFGRSGPPDITDTFSLLVLNITFRTTADDLYPLFHKYGKVVDIFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAVDRLDGTVVDGREITVQFAKYGPNAER
Query: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
I KG++ E PKSR RSRSPRRR RDDYR++DYR+RSRSRS DRR R E++RD+RRR+RS R S
Subjt: IHKGKISEAFPKSRYR-----------------------SRSRSPRRRYRDDYRDRDYRRRSRSRSRSLDRSDRDRRGRERERERDYRRRSRSISPRRPS
Query: PDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQSRG----RSRSVDSASPGR----------RSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSP-
PD K R RGRY++E RS SRS S S RS S SP R RS SPRRSLSPR + SPS + SPER + RSP+P S +P
Subjt: PDYSKGRGRGRYEDERRSRSRSRSQSRG----RSRSVDSASPGR----------RSLSPRRSLSPRRSLSPRRSPSPRGESPERNGDGGRSPTPSSVSP-
Query: RGQPADSRSPSP
R A SRS SP
Subjt: RGQPADSRSPSP
|
|
