; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0008546 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0008546
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionTPRXL protein
Genome locationLG11:2529092..2529781
RNA-Seq ExpressionTan0008546
SyntenyTan0008546
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]1.4e-8481.14Show/hide
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]3.3e-8681.39Show/hide
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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]6.6e-8782.33Show/hide
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        FP  TPRKSRT  SFS SSGSSSSSSSLASW    SSSSSSPSPFVRPKF KRRR   D PSLPFEY+F   DGDE V  S   +SPTS LCFGG SS R
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]3.4e-7574.67Show/hide
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        MQS NYDQISQK LQIKH+ DRFFTR    LSK+ NS ANSSFRVYYGGA+GAIPFRWESRPGTPKH++S+TSIPPLTPPPSYY+SSHS SKASSKPTLL
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        SSIFP   PR+SR +PSSFS    S+S SSS +SWSSS SS S   +  F KRRR   D+PSLPFEY+F   DGDEP G+S+SPTSTLCFGG+SS RAS 
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        F GCYQLVSVKNA LSMVGHGSA RGT+N
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]1.8e-8481.82Show/hide
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        MQ+ NYDQISQKS Q  KHEDRFF RALSKD NS  NSSFRVYYGGA GAIPFRWESRPGTPKH FSDTSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKASSKPTLLSSI
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        FP  TPRKSRT SSFS SSGSSSSSSS ASW    SSSSSSPS FVRPKF KRRR   +S SLPFEY+FD    DE V   T +SPTSTLCFGG SS RA
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        S FGGCYQLVSVKNALLS+VGHGSASRGTLN
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein1.6e-8681.39Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein3.2e-8782.33Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein3.2e-8782.33Show/hide
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        AS FGGCYQLVSVK ALLS+VGHGSASRGTLN
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein1.6e-7574.67Show/hide
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        MQS NYDQISQK LQIKH+ DRFFTR    LSK+ NS ANSSFRVYYGGA+GAIPFRWESRPGTPKH++S+TSIPPLTPPPSYY+SSHS SKASSKPTLL
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Query:  SSIFPWFTPRKSR-TPSSFSFSSGSSSSSSSLASWSSSSSSPSPFVRPKFLKRRRCSFDSPSLPFEYNF---DGDEPVGTSDSPTSTLCFGGSSSGRASF
        SSIFP   PR+SR +PSSFS    S+S SSS +SWSSS SS S   +  F KRRR   D+PSLPFEY+F   DGDEP G+S+SPTSTLCFGG+SS RAS 
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        F GCYQLVSVKNA LSMVGHGSA RGT+N
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A0A6J1K022 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like3.2e-7173.09Show/hide
Query:  MQSGNYDQISQKSLQIKHEDRFFTRALSKDPNSVANSSFRVYYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHTFSDTSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKASSKPTLLSSIF
        M++GNY QIS                  K+ NS ANSSFRVYYGGA GAIPFRWESRPGTPKHT+SDTSIPPLTPPPSYYSSSHSTSK S KPT  +SIF
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Query:  PWFTPRKSRTPSSFSFSSGSSSSSSSLASWSSSSSSPSPFVRPKFLKRRRCSFDSPSLPFEYNFD---GDEPVGTSDSPTSTLCF-GGSSSGRASFFGGC
             RKSRT SSFSFSS SSSSSSS  SWSSS SSPS FVRPKF K RRC  +SPSLPFE +FD   GDE VG+ DSPTSTLCF GGSSS RAS F GC
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Query:  YQLVSVKNALLSMVGHGSASRGT
        YQLVSVKNALLS+VGHGSASRGT
Subjt:  YQLVSVKNALLSMVGHGSASRGT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein1.4e-0740.6Show/hide
Query:  YYGGAAGAIPFRWESRPGTPK-----------HTFSDTSIP---PLTPPPSYYSSSHSTSKASSKPTLLSSIFPWFTPRKSRTPSSFSFSSGSSSSSSSL
        YYGG++ A+PF+WES+PGTP+           ++ SD + P   PLTPPPSY+ +S S++K  S             P+K+ T  S   S   S  SS  
Subjt:  YYGGAAGAIPFRWESRPGTPK-----------HTFSDTSIP---PLTPPPSYYSSSHSTSKASSKPTLLSSIFPWFTPRKSRTPSSFSFSSGSSSSSSSL

Query:  ASWSSSSSS-PSPFVRPKFLKRRRCS--FDSPS
        +S SSSSSS PS  +R   L  RR S  F+S S
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AT2G40475.1 unknown protein1.8e-1844.44Show/hide
Query:  NSVANSSFRVYYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHT-FSDT-SIPPLTPPPSYYSSSHST-SKASSKPTLLSSIFPWFTPRKSRTPSSFSFSSGSSSSSSSLA
        +S  NSS R+YY G A ++PF WE+RPGTPKH  FS++  +PPLTPPPSYYSSS S+ +K S   T+  + F      +  +  SFS+SS SSSSSSS  
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Query:  SWSSSSSSPSPFVRPKFLKRRRCSFDSPSLPFEYNFDGDEPVGTSDSPTSTLCFGGSSSGRASFFGGCYQLVSVKNALLSMVGHGSASR
           SSSS PS        + R+C   S S    Y  + DE    S SPTSTLC+     G +S  G      S+K AL S++ HGS+ +
Subjt:  SWSSSSSSPSPFVRPKFLKRRRCSFDSPSLPFEYNFDGDEPVGTSDSPTSTLCFGGSSSGRASFFGGCYQLVSVKNALLSMVGHGSASR

AT3G56260.2 unknown protein2.7e-1445.29Show/hide
Query:  YYGGAAGAIPFRWESRPGTPK-HTFSDTSIP-PLTPPPSYYSSS-HSTSKASSKPTLLSSIFPWFTPRKSRTPSSFSFSSGSSSSSSSLASWSSSSSSPS
        YYGGA  +IPF WESRPGTPK H  SD+S+P PLTPPPSYYSS   ST +  SK     S F  F+       S    + GS  ++SS  SWSS+SSS S
Subjt:  YYGGAAGAIPFRWESRPGTPK-HTFSDTSIP-PLTPPPSYYSSS-HSTSKASSKPTLLSSIFPWFTPRKSRTPSSFSFSSGSSSSSSSLASWSSSSSSPS

Query:  PFVRPKFLKRRRCSFDSPSLPFEYNFDGDEPVGTSDSPTSTLCFGGSSSGRASFFGGCYQLVSVKNALLS
            P    ++R S D  S     N++ DE      SPTSTLC   S+ GR    G    + SV  AL S
Subjt:  PFVRPKFLKRRRCSFDSPSLPFEYNFDGDEPVGTSDSPTSTLCFGGSSSGRASFFGGCYQLVSVKNALLS

AT5G01790.1 unknown protein1.0e-0838.36Show/hide
Query:  SVANSSFRV-YYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHTFSD-TSIPPLTPPPSYYSSS----HSTSKASSKP--TLLSSIFPWFTPRKSRTPSSFSFSSGSSSSS
        S A  SFR+ YY GAAGA+PF WES PGTPKH  S+  ++PPLTPPPS++S S       SK S+K    L+ +   W +   +      S SS  S S 
Subjt:  SVANSSFRV-YYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHTFSD-TSIPPLTPPPSYYSSS----HSTSKASSKP--TLLSSIFPWFTPRKSRTPSSFSFSSGSSSSS

Query:  SSLASWSSSSSSPSPFVRPKFLKRRRCSFDSPSLPFEYNFDGDEPVGTSDSPTSTLCFG
          L     +      F   + + RR  SFDS           D P+  S    ST CFG
Subjt:  SSLASWSSSSSSPSPFVRPKFLKRRRCSFDSPSLPFEYNFDGDEPVGTSDSPTSTLCFG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAAGTGGAAACTACGACCAAATCTCTCAAAAATCTCTCCAAATCAAACATGAAGATAGATTCTTCACAAGGGCTCTATCCAAAGACCCTAATTCCGTCGCCAACTC
TTCTTTTAGAGTTTATTACGGCGGCGCCGCCGGTGCCATTCCCTTCAGATGGGAGTCACGGCCGGGAACTCCAAAGCATACTTTTTCAGATACTTCAATCCCTCCTCTTA
CTCCTCCTCCTTCTTACTACTCCTCTTCACATTCTACCTCTAAGGCCTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCCTGGTTCACGCCGAGGAAATCTCGAACT
CCCTCGTCCTTCTCTTTCTCTTCTGGCTCCTCTTCCTCTTCCTCGTCCTTAGCCTCATGGTCATCGTCAAGCTCGTCGCCATCGCCTTTTGTTCGACCGAAATTCCTCAA
GCGTCGTCGCTGCTCCTTCGATTCTCCGAGCTTGCCTTTTGAGTATAATTTCGACGGGGACGAGCCGGTGGGGACCTCCGATTCTCCGACATCAACTCTATGCTTTGGTG
GTTCTTCAAGTGGTAGGGCTTCATTTTTCGGAGGTTGCTACCAGTTAGTGAGTGTGAAGAATGCTTTGTTGTCTATGGTTGGCCATGGATCTGCAAGCCGAGGTACTCTT
AATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTTTCAAGAAGATGCAAAGTGGAAACTACGACCAAATCTCTCAAAAATCTCTCCAAATCAAACATGAAGATAGATTCTTCACAAGGGCTCTATCCAAAGACCCTAATTC
CGTCGCCAACTCTTCTTTTAGAGTTTATTACGGCGGCGCCGCCGGTGCCATTCCCTTCAGATGGGAGTCACGGCCGGGAACTCCAAAGCATACTTTTTCAGATACTTCAA
TCCCTCCTCTTACTCCTCCTCCTTCTTACTACTCCTCTTCACATTCTACCTCTAAGGCCTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCCTGGTTCACGCCGAGG
AAATCTCGAACTCCCTCGTCCTTCTCTTTCTCTTCTGGCTCCTCTTCCTCTTCCTCGTCCTTAGCCTCATGGTCATCGTCAAGCTCGTCGCCATCGCCTTTTGTTCGACC
GAAATTCCTCAAGCGTCGTCGCTGCTCCTTCGATTCTCCGAGCTTGCCTTTTGAGTATAATTTCGACGGGGACGAGCCGGTGGGGACCTCCGATTCTCCGACATCAACTC
TATGCTTTGGTGGTTCTTCAAGTGGTAGGGCTTCATTTTTCGGAGGTTGCTACCAGTTAGTGAGTGTGAAGAATGCTTTGTTGTCTATGGTTGGCCATGGATCTGCAAGC
CGAGGTACTCTTAATTAGTTGACATAATTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQSGNYDQISQKSLQIKHEDRFFTRALSKDPNSVANSSFRVYYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHTFSDTSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKASSKPTLLSSIFPWFTPRKSRT
PSSFSFSSGSSSSSSSLASWSSSSSSPSPFVRPKFLKRRRCSFDSPSLPFEYNFDGDEPVGTSDSPTSTLCFGGSSSGRASFFGGCYQLVSVKNALLSMVGHGSASRGTL
N