; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0008777 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0008777
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionras-related protein RABC2a-like
Genome locationLG11:7555459..7559664
RNA-Seq ExpressionTan0008777
SyntenyTan0008777
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150373.1 ras-related protein RABC2a [Cucumis sativus]3.6e-10691.16Show/hide
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XP_008456546.1 PREDICTED: ras-related protein RABC2a-like [Cucumis melo]2.6e-10993.49Show/hide
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XP_022952871.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita moschata]2.0e-10995.28Show/hide
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XP_022990456.1 ras-related protein RABC2a-like [Cucurbita maxima]5.9e-10995.28Show/hide
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XP_038885704.1 ras-related protein RABC2a-like [Benincasa hispida]1.8e-11095.31Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN27 Uncharacterized protein1.7e-10691.16Show/hide
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A0A1S3C3K9 ras-related protein RABC2a-like1.3e-10993.49Show/hide
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A0A6J1BW00 ras-related protein RABC2a-like1.5e-10589.67Show/hide
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A0A6J1GLE8 ras-related protein RABC2a-like9.8e-11095.28Show/hide
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A0A6J1JMZ9 ras-related protein RABC2a-like2.8e-10995.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23657 Ras-related protein RABC11.9e-7064.45Show/hide
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        MGSSS G+   +DY FK+LLIGDSGVGKSS+LLS+ SN   DLSPTIGVDFK+K +TIG K+LKL IWDTAGQERF TLTSSYYRGA GII+VYDVTRR+
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        TFTNL ++WAKE++LY TN +CIK+LVGNKVD+ SERAV+ +EG+  A+E+  LFLECSA+TR NV++CF EL  KILE PSL   GS   K+ I  +  
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        A   +     C
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O49841 Ras-related protein RABC2a3.2e-8172.04Show/hide
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        TFTNL++VW KE+ELY TN EC+++LVGNKVDR SER V+ EEG+A+AKE   +FLECSARTR+NV++CF EL  KI+EVPSLLE GS  VK+ IL +  
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         H+     GCC
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P36862 GTP-binding protein yptV33.8e-5057.22Show/hide
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        S+DY+FK+LL+GDSGVGKS IL  + S  F    + TIGVDFK+K +T  GKR KLTIWDTAGQERF TLTSSYYRGA GII VYDVTRR+TF +L   W
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         +E ++Y T    IK++V NKVD  ++R V++EEG   A+ H  LF+E SAR    V + F EL  KIL+ P LLE  +V
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Q5ZLG1 Ras-related protein Rab-182.1e-4850.51Show/hide
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        + KIL+IG+SGVGKSS+LL +  + F  +L+ TIGVDFK+K +++ G + KL IWDTAGQERF TLT SYYRGA G+ILVYDVTRR+TF  L N W  E+
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        E Y T ++ +K+LVGNK+D+   R V   EG+  A++H  LF+E SA+T + V   F EL  KI++ P L E+ S     K+ +K   H     GG C
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Q9SF92 Ras-related protein RABC2b1.5e-7571.09Show/hide
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        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + + GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
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        TF NL ++WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGMA+AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL  KI+EVPSLLE GS  VK+K     R
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        AH+    G CC
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G43890.1 RAB GTPASE HOMOLOG B181.4e-7164.45Show/hide
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        TFTNL ++WAKE++LY TN +CIK+LVGNKVD+ SERAV+ +EG+  A+E+  LFLECSA+TR NV++CF EL  KILE PSL   GS   K+ I  +  
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        A   +     C
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AT3G09910.1 RAB GTPase homolog C2B1.1e-7671.09Show/hide
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        TF NL ++WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGMA+AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL  KI+EVPSLLE GS  VK+K     R
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        AH+    G CC
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AT3G09910.2 RAB GTPase homolog C2B1.1e-7671.09Show/hide
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        TF NL ++WAKE+ELY TNH+CIK+LVGNKVDR SER V+ EEGMA+AK+   LF ECSARTRENV+ CF EL  KI+EVPSLLE GS  VK+K     R
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        AH+    G CC
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AT3G09910.3 RAB GTPase homolog C2B1.1e-7671.09Show/hide
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        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+LLS+IS+ V DL+PTIGVDFKIK + + GKRLKLTIWDTAGQE+F TLTSSY+RG+ GIILVYDVT+RE
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Query:  AHKEANDGGCC
        AH+    G CC
Subjt:  AHKEANDGGCC

AT5G03530.1 RAB GTPase homolog C2A2.2e-8272.04Show/hide
Query:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTIGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE
        MGSSS G+ S YD SFKILLIGDSGVGKSS+L+S+IS+ V DL+PTIGVDFKIK +T+GGKRLKLTIWDTAGQERF TLTSSYYRGA GIILVYDVTRRE
Subjt:  MGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTIGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRE

Query:  TFTNLMNVWAKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMAVAKEHQSLFLECSARTRENVDRCFRELCSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTR
        TFTNL++VW KE+ELY TN EC+++LVGNKVDR SER V+ EEG+A+AKE   +FLECSARTR+NV++CF EL  KI+EVPSLLE GS  VK+ IL +  
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Query:  AHKEANDGGCC
         H+     GCC
Subjt:  AHKEANDGGCC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGGTTCTTCTTCAAAAGGAAGATGCAGTAGTTACGATTACTCTTTCAAGATATTGTTGATCGGGGATTCTGGTGTTGGAAAAAGCAGTATTCTCCTCAGTTACAT
CTCCAATTTTGTTCATGATCTTTCTCCCACAATCGGTGTGGATTTCAAGATCAAGATGGTAACAATTGGTGGAAAAAGATTGAAGCTAACAATTTGGGACACAGCTGGAC
AAGAGAGGTTTGGAACATTGACAAGCTCTTACTACAGAGGTGCACATGGAATCATCCTAGTGTACGATGTTACCCGACGGGAGACATTTACAAACTTGATGAATGTATGG
GCAAAGGAAGTAGAGCTGTATTTAACTAATCATGAGTGCATAAAAATTCTAGTCGGAAATAAAGTGGATCGGGGCAGTGAAAGAGCTGTAACAACAGAAGAAGGTATGGC
AGTTGCCAAGGAGCATCAAAGTTTGTTTCTTGAGTGCAGTGCTAGAACTCGAGAAAACGTCGATAGATGCTTTAGAGAACTCTGTTCGAAGATCCTGGAAGTTCCAAGTC
TACTGGAAAATGGATCTGTTGTCGTGAAACAGAAAATTTTGGACAAAACACGAGCACACAAAGAAGCGAACGATGGAGGTTGTTGCCACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTCACTGTTACATTTCCATTTCTCATAGCTCACGAACTTCTTTTATTTTCTCTGATGGTTTTGATTTCTTCTTCTTCTTTGTGCAAAAGGGTTGTTCTCAGAGAGTTGA
AAAGGGGGAAAAAGAGGGGTTAAGAGAAGAGGCTGCCTGTTTTGCTTGTTTATGAAGTAGAAAAAAATGATGGGTTCTTCTTCAAAAGGAAGATGCAGTAGTTACGATTA
CTCTTTCAAGATATTGTTGATCGGGGATTCTGGTGTTGGAAAAAGCAGTATTCTCCTCAGTTACATCTCCAATTTTGTTCATGATCTTTCTCCCACAATCGGTGTGGATT
TCAAGATCAAGATGGTAACAATTGGTGGAAAAAGATTGAAGCTAACAATTTGGGACACAGCTGGACAAGAGAGGTTTGGAACATTGACAAGCTCTTACTACAGAGGTGCA
CATGGAATCATCCTAGTGTACGATGTTACCCGACGGGAGACATTTACAAACTTGATGAATGTATGGGCAAAGGAAGTAGAGCTGTATTTAACTAATCATGAGTGCATAAA
AATTCTAGTCGGAAATAAAGTGGATCGGGGCAGTGAAAGAGCTGTAACAACAGAAGAAGGTATGGCAGTTGCCAAGGAGCATCAAAGTTTGTTTCTTGAGTGCAGTGCTA
GAACTCGAGAAAACGTCGATAGATGCTTTAGAGAACTCTGTTCGAAGATCCTGGAAGTTCCAAGTCTACTGGAAAATGGATCTGTTGTCGTGAAACAGAAAATTTTGGAC
AAAACACGAGCACACAAAGAAGCGAACGATGGAGGTTGTTGCCACTGACACGATCGTGTATTACATCATACGACACAAAACAGAAGTCGAAGAAACAGATTTAGATGTAA
ACATACTGCTGATGGAAATTCTTGATCAGAACAGCCCTCCCCAGAAAGGACACAAATGTGCTATCCAAGGTGATTACATGCTCTTTTGCAATTTCATTTGGCTGTCACTG
TTTTCATCAGTTTTTTCTTTCTTCATAAAGAATAAAAATGCATTTCAATTTTTACTTTGAGATCACTGTAAAAAGTGTGGCTGAATTTTGTTGGGGTAATGATTTTCAGT
AACAAAATGTATTAAAATCTCTGTAGATAATGTGAATACAGCCATAGAAATACAGTATTTTCCACTATAATGCTCTAGAAACTTCCTTTTACTTTGGTTTTAATCTCTAG
AATGGTTGAAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMGSSSKGRCSSYDYSFKILLIGDSGVGKSSILLSYISNFVHDLSPTIGVDFKIKMVTIGGKRLKLTIWDTAGQERFGTLTSSYYRGAHGIILVYDVTRRETFTNLMNVW
AKEVELYLTNHECIKILVGNKVDRGSERAVTTEEGMAVAKEHQSLFLECSARTRENVDRCFRELCSKILEVPSLLENGSVVVKQKILDKTRAHKEANDGGCCH