; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0008953 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0008953
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionprotein SAMBA-like isoform X2
Genome locationLG07:71700192..71703327
RNA-Seq ExpressionTan0008953
SyntenyTan0008953
Gene Ontology termsGO:0046621 - negative regulation of organ growth (biological process)
GO:0010997 - anaphase-promoting complex binding (molecular function)
InterPro domainsIPR037547 - Protein SAMBA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136198.1 protein SAMBA isoform X2 [Cucumis sativus]1.2e-4089.9Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM ALKS+IMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGG FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
XP_008466003.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503566 isoform X2 [Cucumis melo]7.9e-4088.89Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM ALKS+IMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGG FLKKT+EKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
XP_022131248.1 protein SAMBA isoform X2 [Momordica charantia]2.2e-4295.96Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAM+ALKS+IMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGG FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
XP_022149251.1 protein SAMBA-like isoform X2 [Momordica charantia]9.9e-4395.96Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE M+ALKS+IMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQGGPFLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
XP_038888368.1 protein SAMBA isoform X2 [Benincasa hispida]1.9e-4192.93Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MN+SSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMS+DDFRFPANLIS+PERKDEAM ALKS+IMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMS+QGG FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK11 Uncharacterized protein5.9e-4189.9Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MN+ SPANSS+STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM ALKS+IMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGG FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
A0A1S3CQ76 uncharacterized protein LOC103503566 isoform X23.8e-4088.89Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MN+ SPANSS STTAVAGRCSTNAA+S+DDFRFP+NLIS+PERKDEAM ALKS+IMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGG FLKKT+EKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
A0A6J1BST3 protein SAMBA isoform X21.1e-4295.96Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAM+ALKS+IMAALNKEVKSLDDD+WMFEGPRSRINLMSRQGG FLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
A0A6J1D7T9 protein SAMBA-like isoform X24.8e-4395.96Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDE M+ALKS+IMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRS INLMSRQGGPFLKKTEEKRR
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
A0A6J1HGF1 protein SAMBA isoform X27.2e-3987.88Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
        MN+SSPANSSISTT VAGRC+TNAAMS+DDFRFPANL+S+ ERKDEAM+ALKS+IMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQG  FLKKTEEK R
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR
SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9C613 Protein SAMBA5.3e-2361.86Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEE
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+D+M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G  FLKK  E
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEE
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32310.1 unknown protein3.8e-2461.86Show/hide
Query:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEE
        MN +SPA+S +STTAVA G  S+ AA  +DDF FP ++ S+ ERKDEAM  LK+D+M  L+KEVKSL++D+WMFEGPRSRI+L+SR+G  FLKK  E
Subjt:  MNSSSPANSSISTTAVA-GRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEE

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATAGCTCGTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAAGATGTAGCACCAATGCCGCAATGTCCGTTGACGATTTTCGCTTCCCGGCTAATTT
AATATCTATACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGGCCGCTCTTAAATCTGATATAATGGCTGCACTGAACAAGGAAGTAAAATCCTTGGATGATGATAACTGGATGTTTG
AAGGTCCTCGCTCTCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGGTCCTTTCCTCAAAAAGACAGAAGAGAAAAGAAGATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAATCGGGTCGGAATTGTCGGTTGCCGCCGATTTCTTCCTTCTGTGAAGGGAGTGAGAATCCCAATTCCACAAATTGGTCTTGTCTCTGAAAATTCCTCAAGGCACT
TCAAATTTATAGCAGAAAATCCGAACTTCCTCTGCTTCATCGCTGAATTTTTCCGTCTCAAACCTGGTCGCTGTATTTGGCGCTTTCGTTGTTTCTACACATTGATCAGA
CTTCTGATTCTGTGTGCATTTCTAGGGCTTAGTTCATCGGAAAATTGGGAACACCATGAATAGCTCGTCACCAGCTAATTCTTCCATTTCTACCACAGCGGTTGCCGGAA
GATGTAGCACCAATGCCGCAATGTCCGTTGACGATTTTCGCTTCCCGGCTAATTTAATATCTATACCAGAGCGCAAGGACGAGGCCATGGCCGCTCTTAAATCTGATATA
ATGGCTGCACTGAACAAGGAAGTAAAATCCTTGGATGATGATAACTGGATGTTTGAAGGTCCTCGCTCTCGTATCAACCTTATGTCACGACAAGGTGGTCCTTTCCTCAA
AAAGACAGAAGAGAAAAGAAGATAATGAGCAGGGTTGATAAGAAAAGAATGACTAGAGATCTTCAGCCTGGAGAAATCTTGTGATCATGGTGGCTGGCACTCGGACAACA
CCCGCTTTCGTTTATCCGATCAGATCAAGTAATCATTCTTCTTTTCAAGTTATTATTTTTCTTTAGGTGTAAAGGGTTTGCTAATGCTGGTCCAAATGAAATCTTGCTTA
CATAGGATTGCCAGAAAAACTACTTCTGACATCTTCGAGAGTAAGAGCAGGAATCCATTAATGACTTACTGGTTTGGCTATAAATTTACAATAGCTTGGTTTAGTCGTAG
TCCATTATTACTTAGAAAATTTGAAACATCCAAAGATGAATATAACTGACCGATTCAACCCATCCATTAGACATTTAATGCTATAGGGCATGATAATTGACAATAATTCA
AGACTAGCTACTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNSSSPANSSISTTAVAGRCSTNAAMSVDDFRFPANLISIPERKDEAMAALKSDIMAALNKEVKSLDDDNWMFEGPRSRINLMSRQGGPFLKKTEEKRR