; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0008996 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0008996
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1
Genome locationLG03:78671535..78675127
RNA-Seq ExpressionTan0008996
SyntenyTan0008996
Gene Ontology termsGO:0033615 - mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0009570 - chloroplast stroma (cellular component)
InterPro domainsIPR010591 - ATP11


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7034627.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.6e-12691.13Show/hide
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XP_022925840.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Cucurbita moschata]1.1e-12792.34Show/hide
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XP_022978750.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Cucurbita maxima]7.3e-12791.94Show/hide
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XP_023544293.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.3e-12791.53Show/hide
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XP_038883536.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 1 [Benincasa hispida]5.6e-12791.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AZK5 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 17.4e-12590.73Show/hide
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A0A5A7UBA1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 13.7e-12490.32Show/hide
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A0A6J1CLK5 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 15.6e-12590.08Show/hide
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A0A6J1EJC6 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 15.4e-12892.34Show/hide
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A0A6J1IR42 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 13.5e-12791.94Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P87127 Protein atp11, mitochondrial1.2e-1027.07Show/hide
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        L+  ID+E+ K+     +  +W   ++G   + A +  ++Y  +  RA    YFV+PL RG  G  + F+Q   P     H+L T L +YK +G+ AAP+
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Query:  FTVSYYKEFAESKDLVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFY-------LNDARYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALEM
          + ++ +    K + L+R       KL+  + + L+   Q FY       L   R  L+  F++   DF+   V   ++M
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Q5TC12 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 11.9e-1631.46Show/hide
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        GFT  + K L SI ++E  K+++ E++  IW  Y   +  + A + A+ + L+  RA  C  F+  L R  GY     Q     + FT L + + RG  A
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Query:  APYFTVSYYKEFAESKDLVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFYLNDAR--YKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALE
        A    + +Y E  E K +VL+  ++  T  L   EA+ +    Q FY  D +  Y LVE FN +  +F++  V+  LE
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Q66JD1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 16.0e-1530.41Show/hide
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        K LDSI+++E  KD+  +++  IW  Y   R  + A +  + + L+ +RA  C  F+  L R  GY     Q     + FT L + +  G  A     + 
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Query:  YYKEFAESKDLVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFYLNDA--RYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALE
        +Y EF + K +VL+  +I  T  L   +A+ L    Q FY +D    + LVE+FN ++ +F++  V+  LE
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Q811I0 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 17.1e-1630.9Show/hide
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        GFT  + K L S+ ++E  KD++ E++  IW  Y   +  + A +  + + L+  RA  C  F+  L R  GY     Q     + FT L + + RG  A
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Query:  APYFTVSYYKEFAESKDLVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFYLNDAR--YKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALE
        A    + +Y E  E K +VL+  ++  T  L   EA+ +    Q FY  D +  Y LVE FN +  +F++  V+  LE
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34050.1 INVOLVED IN: protein complex assembly; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATP11 (InterPro:IPR010591); Has 304 Blast hits to 304 proteins in 167 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 101; Fungi - 112; Plants - 39; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 52 (source: NCBI BLink).2.0e-9064.66Show/hide
Query:  RTLRTIAGSAKILLTSTSPAVRQSSRSYFANVS-------LEKLLREAIPCDFLRWCSLGFFRTSRFATGFTPLQPKPLDSIIDMERAKDRSPEDLASIW
        R + +I+  AK  L+S+S     SSR  F   S         KL   ++P + ++W SLG  R SRFA+GFTPLQ KPLDSI+D+ RAK +SPE+L SIW
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Query:  DDYHLGRGHIGASMKAKLYHLLEQRAADCRYFVIPLWRGSGYTTMFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDLVLIRGDIVFTSKL
        DDYHLGRGHIG +MKA+LY LLEQRA++CRYFVIPLWRG+GY TMF QV+ PH++FTGLEDYKARGTQAAPY T ++Y E +E+KDLV IRGD+VFTSKL
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Query:  TDPEAEWLLETTQSFYLNDARYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALEMPIL
        TD EA+W++ET QSFYLND+RYKL+ERFN+ T DFEFKDVLQAL+MP+L
Subjt:  TDPEAEWLLETTQSFYLNDARYKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALEMPIL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGAAGCTCTTCGTTACGAACATTGAGGACCATTGCTGGTTCTGCGAAAATTCTTCTCACTAGTACTTCGCCTGCGGTTCGACAATCTTCTCGTTCCTATTTTGCTAA
TGTGAGCCTTGAGAAACTGCTAAGGGAAGCAATTCCTTGTGATTTCCTCAGATGGTGTTCGCTTGGTTTCTTTCGGACTTCAAGATTCGCTACTGGGTTCACCCCATTGC
AACCAAAGCCGTTGGATTCGATCATTGATATGGAGAGAGCGAAAGATCGATCACCGGAGGACCTCGCTTCCATCTGGGATGATTATCATTTGGGAAGAGGTCATATTGGG
GCATCAATGAAAGCTAAACTATATCATTTATTGGAGCAACGAGCAGCAGATTGCCGATACTTTGTTATTCCTTTGTGGCGTGGAAGTGGTTATACTACCATGTTTGTTCA
AGTACAAATGCCGCATATCCTTTTCACTGGCCTTGAAGATTACAAGGCAAGAGGAACTCAAGCAGCTCCCTACTTCACCGTGTCCTATTATAAAGAATTTGCAGAGAGCA
AGGATTTGGTGCTTATTCGAGGTGATATTGTGTTTACAAGTAAGCTCACCGACCCAGAGGCAGAATGGCTTTTAGAGACCACTCAATCCTTCTATCTGAACGATGCTCGG
TACAAGCTGGTTGAACGGTTTAACAGACAAACACGTGATTTTGAGTTCAAGGATGTCTTACAAGCGCTGGAAATGCCCATTTTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTAATTGCATAACATTTGCTCGGAACATTGAGCTGGGTTTTCACAGCAGGGACCCCATTTTCTTGCCATCGTCGCTGGAAGTGTAAAAGACGGTCGATGCGATCAAAA
GATTGTTTACCTAATTGATTACTGAGTTTTACTTGTCCGCGATGCGAAGCTCTTCGTTACGAACATTGAGGACCATTGCTGGTTCTGCGAAAATTCTTCTCACTAGTACT
TCGCCTGCGGTTCGACAATCTTCTCGTTCCTATTTTGCTAATGTGAGCCTTGAGAAACTGCTAAGGGAAGCAATTCCTTGTGATTTCCTCAGATGGTGTTCGCTTGGTTT
CTTTCGGACTTCAAGATTCGCTACTGGGTTCACCCCATTGCAACCAAAGCCGTTGGATTCGATCATTGATATGGAGAGAGCGAAAGATCGATCACCGGAGGACCTCGCTT
CCATCTGGGATGATTATCATTTGGGAAGAGGTCATATTGGGGCATCAATGAAAGCTAAACTATATCATTTATTGGAGCAACGAGCAGCAGATTGCCGATACTTTGTTATT
CCTTTGTGGCGTGGAAGTGGTTATACTACCATGTTTGTTCAAGTACAAATGCCGCATATCCTTTTCACTGGCCTTGAAGATTACAAGGCAAGAGGAACTCAAGCAGCTCC
CTACTTCACCGTGTCCTATTATAAAGAATTTGCAGAGAGCAAGGATTTGGTGCTTATTCGAGGTGATATTGTGTTTACAAGTAAGCTCACCGACCCAGAGGCAGAATGGC
TTTTAGAGACCACTCAATCCTTCTATCTGAACGATGCTCGGTACAAGCTGGTTGAACGGTTTAACAGACAAACACGTGATTTTGAGTTCAAGGATGTCTTACAAGCGCTG
GAAATGCCCATTTTATGATTTCTCCAGAACTAAGCAGACAATAGTGCCCTCCAAGAGGTAATAAGAAATTTAGCAAAACATGTCAAGCCTTTGTAGGGCTATTATTTATA
GTTCCTCGTAACTTTGAATAGGCTGTTTTGACTTGTTTAGAGAGAATAATCAAATGCTTTATTCTTGGTAAGTTCCTATGATTTGAGAAGTGTTCCCTGCAGAGGAAGTA
TACCACTAATTAGTCAACAGAACTATTGTATTTTTACCTCATCCTAAAGAATGGGAGTTTTTTCCCGCATCCTGGAGTTGGCATTTCAATTCTTTTTCTTGGTGAAAGTT
GGGAAGGAGTTATGAATGGAAAAATGAGTTCTAGTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ASMKAKLYHLLEQRAADCRYFVIPLWRGSGYTTMFVQVQMPHILFTGLEDYKARGTQAAPYFTVSYYKEFAESKDLVLIRGDIVFTSKLTDPEAEWLLETTQSFYLNDAR
YKLVERFNRQTRDFEFKDVLQALEMPIL