; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0009162 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0009162
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionhistone H1-like
Genome locationLG08:3810433..3811862
RNA-Seq ExpressionTan0009162
SyntenyTan0009162
Gene Ontology termsGO:0006334 - nucleosome assembly (biological process)
GO:0000786 - nucleosome (cellular component)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR005818 - Linker histone H1/H5, domain H15
IPR005819 - Linker histone H1/H5
IPR036388 - Winged helix-like DNA-binding domain superfamily
IPR036390 - Winged helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063593.1 histone H1-like [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-9085.87Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAA-PAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKL
        M+SAADPVV SDAPAAA  AVAQP END+KSKKAAASKASKA+KPSGAKKA+SSPTHPPF QMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLP+NFRKL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAA-PAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAK-AAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAA--KPKTVAKSKVVSKPKAAGAAK
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS+QAK AAAAPVA KKP SSKLKA AS+KK AVAKPKAKTA KPKPK  A  KPKTV KSK V+KPK   AAK
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAK-AAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAA--KPKTVAKSKVVSKPKAAGAAK

Query:  SKAAEKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        +KAAEKVKK APKPK  AK  KVAKTLSRTSPGKRAA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  SKAAEKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

KAG6599320.1 Histone H1.2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-9587.55Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL
        M+SAADPV  SDAPA   AVAQPVEND+KSKKAAASKASKA+KPSGAK+ +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLP+NFRKLL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKPASSKLKAA SVKKAAVAKPKAKTAVKPKPK  AKPK  AKSKVV+KPKA   AK KAA
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA

Query:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKK APKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGK+AA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_022946127.1 histone H1-like [Cucurbita moschata]3.5e-9587.17Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL
        M+SAADPV  SDAPA   AVAQPVEND+KSKKAAASKASKA+KPSGAK+ +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LP+NFRKLL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKPASSKLKAA SVKKAAVAKPKAKTAVKPKPK  AKPK+ AKSKVV+KPKA   AK KAA
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA

Query:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKK APKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGK+AA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_022999095.1 histone H1-like [Cucurbita maxima]3.9e-9486.79Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL
        M+SAADPV  SDAPA    VA PVEND+KSKKAAASKASKA+KPSGAK+ +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLP+NFRKLL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKPASSKLKAA SVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKV AKPK  AKSKVV KPKA   AK KAA
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA

Query:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKK APKPKPAAKPAKVAKTLSR SPGK+AA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

XP_023521173.1 histone H1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.6e-9587.17Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL
        M+SAADPV  SDAPA    VAQP END+KSKKAAASKASKA+KPSGAK+ +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLP+NFRKLL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKPASSKLKAA SVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKV AKPK  AKSKVV+KPKA   AK KAA
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA

Query:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKK APKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGK+AA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C278 histone H1-like8.2e-9085.5Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAA-PAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKL
        M+SAADPVV SDAPAAA  AVAQP END+KSKKAAASKASKA+KPSGAKKA+SSPTHPPF QMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLP+NFRKL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAA-PAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAK-AAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAA--KPKTVAKSKVVSKPKAAGAAK
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS+QAK AAAAPVA KKP SSKLKA AS+KK AVAKPKAKTA K KPK  A  KPKTV KSK V+KPK   AAK
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAK-AAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAA--KPKTVAKSKVVSKPKAAGAAK

Query:  SKAAEKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        +KAAEKVKK APKPK  AK  KVAKTLSRTSPGKRAA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  SKAAEKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A5D3D4H1 Histone H1-like9.7e-9185.87Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAA-PAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKL
        M+SAADPVV SDAPAAA  AVAQP END+KSKKAAASKASKA+KPSGAKKA+SSPTHPPF QMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF EEKHKQLP+NFRKL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAA-PAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKL

Query:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAK-AAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAA--KPKTVAKSKVVSKPKAAGAAK
        LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS+QAK AAAAPVA KKP SSKLKA AS+KK AVAKPKAKTA KPKPK  A  KPKTV KSK V+KPK   AAK
Subjt:  LLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAK-AAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAA--KPKTVAKSKVVSKPKAAGAAK

Query:  SKAAEKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        +KAAEKVKK APKPK  AK  KVAKTLSRTSPGKRAA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  SKAAEKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1CNP7 histone H1-like3.1e-8985.39Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL
        MASAADP+VPSDAPAA  A    V NDAK KKAA+SKASKA+KPSGAK+ KSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLP+NFRKLL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASV-KKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPK-AAGAAKSK
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS+QAK AAAPVAAKKPASSKLKAAASV KKAAV KPKAKTAVKPKPK   KPKT++KSKVV+KPK AA AAK K
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASV-KKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPK-AAGAAKSK

Query:  AAEKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        AA KV K+A K KPAA+PAKVAKTL++TSPGKRAA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  AAEKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1G2W2 histone H1-like1.7e-9587.17Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL
        M+SAADPV  SDAPA   AVAQPVEND+KSKKAAASKASKA+KPSGAK+ +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHK+LP+NFRKLL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKPASSKLKAA SVKKAAVAKPKAKTAVKPKPK  AKPK+ AKSKVV+KPKA   AK KAA
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA

Query:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKK APKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGK+AA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

A0A6J1KEC3 histone H1-like1.9e-9486.79Show/hide
Query:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL
        M+SAADPV  SDAPA    VA PVEND+KSKKAAASKASKA+KPSGAK+ +SSPTHPPFF+MISEAIVSLKERTGSSQYAITKF+EEKHKQLP+NFRKLL
Subjt:  MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLL

Query:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA
        LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARS   KAAAAPV AKKPASSKLKAA SVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKV AKPK  AKSKVV KPKA   AK KAA
Subjt:  LVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAA

Query:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        EKVKK APKPKPAAKPAKVAKTLSR SPGK+AA AA  KAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
Subjt:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P08283 Histone H14.9e-3148.28Show/hide
Query:  DPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLK
        +P+V        P V +  E  A+ +K   +K +K  KP  A K ++  +HP + +MI +AIVSLKE+ GSSQYAI KF EEK KQLPANF+KLLL +LK
Subjt:  DPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLK

Query:  KLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVA--KSKVVSKPKAAGAAKSKAAEKV
        K VA+ KL+KVK S+KL         AAA   A  KP +     A SVK    AKPKAK  V  KPKVA+K K VA    K  +KPK   AAK+K     
Subjt:  KLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVA--KSKVVSKPKAAGAAKSKAAEKV

Query:  KKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK
         K+  KPK   KPAKVAKT  +T+PGK+ AA  K  AKKV  K  K K+VKSP +KV  ++
Subjt:  KKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARK

P23444 Histone H11.2e-3250.94Show/hide
Query:  ADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHK-QLPANFRKLLLVH
        A P  P+DAPAA  A A    N AK+KKA             A K ++SPTH P+ +M+SEAI SLKERTGSS YAI KF E+KHK +LP NFRKLL V 
Subjt:  ADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHK-QLPANFRKLLLVH

Query:  LKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAAEKV
        LKKLVA  KL KVKNSYKL SA     K  AAP   KKP +   K  A+ K  A    KAK A KPKP  AAKPK V K K  +KPKA  AAK+K     
Subjt:  LKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAAEKV

Query:  KKSAPKPKPAAKP---AKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
        K +  KPKP AK    AK AKT ++ +PGK+A A     +KK A        +P RK  +RK KK
Subjt:  KKSAPKPKPAAKP---AKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P26569 Histone H1.21.2e-3251.69Show/hide
Query:  DAPAAAPAVAQPVENDA----KSKKAAASKASKAR-KPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKK
        D+ AA   V  P +  A    KSKK   +KA+K   K +   K K++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV+LK+
Subjt:  DAPAAAPAVAQPVENDA----KSKKAAASKASKAR-KPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKK

Query:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKA---AGAAKSK---AA
        LVA++KLVKVK S+K+PSARS      AAPV  K    +K K   +   AAVA  KAK A K   K AA  K VAK+KV +KPKA   A   KSK   A 
Subjt:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKA---AGAAKSK---AA

Query:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKA--KKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
         K K  A KPK   +PAK ++T +RTSPGK+ AA AK  A  KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKA--KKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

P37218 Histone H11.0e-3650.88Show/hide
Query:  DPVVPSDA--PAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVH
        +PV+ ++     AAP   +  E +  +K   A K +KA+KP+  +K  ++PTHPP+F+MI +AIV+LKERTGSSQ+AITKF EEK K LP+NF+KLLL  
Subjt:  DPVVPSDA--PAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVH

Query:  LKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAA---PVAAK-KPASS-------KLKAAASVKKAAVAKP--KAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPK
        LKK VA++KLVKVKNSYKLPS     A A  A   P AAK KPA+        K K AA  K AA AKP  KAK A K KP   AKP   AK    +KPK
Subjt:  LKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAA---PVAAK-KPASS-------KLKAAASVKKAAVAKP--KAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPK

Query:  AAGAAKSKAAEKVKKSAPKPKPAAKP--------AKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK
        AA AAK KAA K K +  K K A KP        AKVAKT +RT+P ++AA  A T AKK   KK   K VKSPA+K   ++ +K
Subjt:  AAGAAKSKAAEKVKKSAPKPKPAAKP--------AKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKK--PKTVKSPARKVQARKVKK

Q9M5W4 Histone H12.3e-3656.13Show/hide
Query:  SDAPAAAPAVAQPVENDAK-SKKAAASKASKARKP-SGAKKAKSSPT--HPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKK
        +D P +AP V +  E  +K   KAAA K  K +K    AKK KS  T  HP FF+MIS+AI +LKERTGSSQYAI KF E+KHKQLP+NFRKLLL HLKK
Subjt:  SDAPAAAPAVAQPVENDAK-SKKAAASKASKARKP-SGAKKAKSSPT--HPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKK

Query:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAV-AKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAAEKVKK
        LVA+ KLVKVKNS+KLPSAR     AA AP  AKKP   K K AA  K A + AKPKAK  V  K K  A  KTVAK    +KPKA             K
Subjt:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAV-AKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAAEKVKK

Query:  SAPKPKP-AAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARK
        +A KPK  AAKPAKVAKT +  SPGK+         K V  KK KTVKSPA K
Subjt:  SAPKPKP-AAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06760.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein1.4e-2848.87Show/hide
Query:  SDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKP-SGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKKLVA
        +DAP    AV +  +  AK +K    K  K +K  + A K ++  +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEK K+LP  FRKLLL++LK+LVA
Subjt:  SDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKP-SGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKKLVA

Query:  ADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLK-AAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAAEKVKKSA-
        + KLVKVK S+KLPSA    AKA++   AA+K A +K K A  +V K   AK K   A K K  +A KPKT A  KV +K KA    ++ AA   +K+  
Subjt:  ADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLK-AAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAAEKVKKSA-

Query:  PKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAK------TKAKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARKVKK
         KPK  A+PAK AKT   TSP K+A AA K      TK K    K  KPKTVKSPA++  +R VKK
Subjt:  PKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAK------TKAKKVAAK--KPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G18050.1 histone H1-32.4e-0939.77Show/hide
Query:  KKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPANFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQ
        KK  A+K  K RKP        + THPP+FQMI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     + 
Subjt:  KKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPANFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQ

Query:  AKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAV-----KPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAA
         +        KK    + K      +++  +PK   +V     K K K A +PK++  S    K   A AA
Subjt:  AKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAV-----KPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAA

AT2G18050.2 histone H1-32.8e-0538.57Show/hide
Query:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPANFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAK
        MI EA++ LKE+ GSS YAI K  EEKHK  LP +FRK L + LK  VA  KLVK++ SYKL     +  +        KK    + K      +++  +
Subjt:  MISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQ-LPANFRKLLLVHLKKLVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAK

Query:  PKAKTAV-----KPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAA
        PK   +V     K K K A +PK++  S    K   A AA
Subjt:  PKAKTAV-----KPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAA

AT2G30620.1 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein8.2e-3451.69Show/hide
Query:  DAPAAAPAVAQPVENDA----KSKKAAASKASKAR-KPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKK
        D+ AA   V  P +  A    KSKK   +KA+K   K +   K K++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV+LK+
Subjt:  DAPAAAPAVAQPVENDA----KSKKAAASKASKAR-KPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKK

Query:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKA---AGAAKSK---AA
        LVA++KLVKVK S+K+PSARS      AAPV  K    +K K   +   AAVA  KAK A K   K AA  K VAK+KV +KPKA   A   KSK   A 
Subjt:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKA---AGAAKSK---AA

Query:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKA--KKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK
         K K  A KPK   +PAK ++T +RTSPGK+ AA AK  A  KK  AK  K VKSPA++   RK KK
Subjt:  EKVKKSAPKPKPAAKPAKVAKTLSRTSPGKRAAAAAKTKA--KKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK

AT2G30620.2 winged-helix DNA-binding transcription factor family protein4.2e-2248.7Show/hide
Query:  DAPAAAPAVAQPVENDA----KSKKAAASKASKAR-KPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKK
        D+ AA   V  P +  A    KSKK   +KA+K   K +   K K++ +HP + +MI +AIV+LKERTGSSQYAI KF EEKHK LP  FRKLLLV+LK+
Subjt:  DAPAAAPAVAQPVENDA----KSKKAAASKASKAR-KPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKK

Query:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKS-KVVSKPKAAGAAKSK
        LVA++KLVKVK S+K+PSARS      AAPV  K    +K KA+ +  + +  K  A     P  KVA   K  AKS KV S  K A   K+K
Subjt:  LVAADKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKS-KVVSKPKAAGAAKSK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCGCCGCCGATCCCGTTGTCCCCTCCGACGCGCCCGCCGCCGCCCCAGCAGTGGCTCAGCCGGTGGAGAACGATGCGAAGTCCAAGAAAGCTGCGGCCTCGAA
AGCTTCGAAGGCCAGAAAACCATCTGGTGCGAAGAAGGCCAAATCTTCGCCGACTCATCCTCCTTTCTTTCAGATGATTAGCGAAGCGATTGTATCGCTGAAGGAGAGGA
CTGGCTCCAGCCAGTACGCCATTACGAAGTTCAACGAAGAGAAGCACAAGCAATTGCCGGCGAATTTCAGGAAGCTCTTGCTCGTTCATCTGAAGAAACTAGTCGCCGCT
GATAAACTCGTTAAGGTCAAGAACTCGTACAAGCTTCCATCGGCGCGCTCCGTTCAGGCAAAAGCAGCAGCAGCGCCAGTCGCCGCCAAGAAGCCAGCGAGCTCAAAGCT
CAAAGCGGCCGCAAGCGTCAAGAAAGCCGCCGTCGCTAAACCGAAAGCGAAAACTGCTGTGAAACCTAAGCCGAAGGTTGCAGCGAAGCCAAAGACGGTCGCGAAATCCA
AGGTCGTTTCGAAGCCGAAGGCCGCCGGTGCGGCCAAGTCCAAGGCTGCCGAGAAGGTGAAGAAGTCCGCTCCGAAGCCAAAACCTGCAGCGAAGCCTGCTAAAGTTGCG
AAAACATTGTCGCGAACTTCACCAGGAAAGAGAGCCGCTGCGGCGGCGAAGACGAAGGCGAAGAAGGTAGCCGCGAAGAAGCCAAAGACTGTAAAGTCGCCGGCGAGGAA
AGTCCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCATTATTCTCGATACCGTTTCGAGCTCTTGCTTCTTTCAATTCCGATCATGGCTTCCGCCGCCGATCCCGTTGTCCCCTCCGACGCGCCCGCCGCCGCCCCAGCAGTGG
CTCAGCCGGTGGAGAACGATGCGAAGTCCAAGAAAGCTGCGGCCTCGAAAGCTTCGAAGGCCAGAAAACCATCTGGTGCGAAGAAGGCCAAATCTTCGCCGACTCATCCT
CCTTTCTTTCAGATGATTAGCGAAGCGATTGTATCGCTGAAGGAGAGGACTGGCTCCAGCCAGTACGCCATTACGAAGTTCAACGAAGAGAAGCACAAGCAATTGCCGGC
GAATTTCAGGAAGCTCTTGCTCGTTCATCTGAAGAAACTAGTCGCCGCTGATAAACTCGTTAAGGTCAAGAACTCGTACAAGCTTCCATCGGCGCGCTCCGTTCAGGCAA
AAGCAGCAGCAGCGCCAGTCGCCGCCAAGAAGCCAGCGAGCTCAAAGCTCAAAGCGGCCGCAAGCGTCAAGAAAGCCGCCGTCGCTAAACCGAAAGCGAAAACTGCTGTG
AAACCTAAGCCGAAGGTTGCAGCGAAGCCAAAGACGGTCGCGAAATCCAAGGTCGTTTCGAAGCCGAAGGCCGCCGGTGCGGCCAAGTCCAAGGCTGCCGAGAAGGTGAA
GAAGTCCGCTCCGAAGCCAAAACCTGCAGCGAAGCCTGCTAAAGTTGCGAAAACATTGTCGCGAACTTCACCAGGAAAGAGAGCCGCTGCGGCGGCGAAGACGAAGGCGA
AGAAGGTAGCCGCGAAGAAGCCAAAGACTGTAAAGTCGCCGGCGAGGAAAGTCCAGGCAAGGAAAGTCAAGAAATGAATCGTTTTAGGGTTTGATTAAATTCTAGGGTTT
GTTGTTACTTACTACTAGTTCGTAGCGATGTAAATTAGGGACGTGAGATTGCAATCGTTGCTATACACTATTTTTATTGAAATTCAGTTTGATAAATTCAAGGGTTTATC
AAATCAATCTTCTTCAGTTTCCATTTCCTTGTGCTTTTTTAAGAGTGCGATTTTCTTCAAGTATGTTTAGGGCCGAGAGTCTTTGAATCGTAGAGATGAGTAAAAAAAGC
TTCGAAGATAGCATTAATGGCGGATTTCCCGTTTCAGAAGCCTTGTTTCTCTCCCATAATCGCACATTTGTCTCTTATCTGTAACGTCGGTTTGAAATCTGAACGCCTCA
CGTGCGTTGCACGCGTTTACATTCCACGTTGGCAAGAGTTCCCGAATTTTAGGATCTATTTTTGATGAATTTGGGAAGAGGTTTAATTAATTTTTTGATTTTATTAAATG
TTTATGTAGCCGAAAAATAAAAAAAGAGCGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASAADPVVPSDAPAAAPAVAQPVENDAKSKKAAASKASKARKPSGAKKAKSSPTHPPFFQMISEAIVSLKERTGSSQYAITKFNEEKHKQLPANFRKLLLVHLKKLVAA
DKLVKVKNSYKLPSARSVQAKAAAAPVAAKKPASSKLKAAASVKKAAVAKPKAKTAVKPKPKVAAKPKTVAKSKVVSKPKAAGAAKSKAAEKVKKSAPKPKPAAKPAKVA
KTLSRTSPGKRAAAAAKTKAKKVAAKKPKTVKSPARKVQARKVKK