; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0009233 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0009233
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionPMD domain-containing protein
Genome locationLG06:61316505..61316945
RNA-Seq ExpressionTan0009233
SyntenyTan0009233
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0047478.1 hypothetical protein E6C27_scaffold498G00950 [Cucumis melo var. makuwa]5.4e-2947.59Show/hide
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KAA0050516.1 hypothetical protein E6C27_scaffold175G001600 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-2848.28Show/hide
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KAA0053734.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]3.2e-2948.63Show/hide
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KAA0061098.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-2948.28Show/hide
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TYK00336.1 hypothetical protein E5676_scaffold1923G00140 [Cucumis melo var. makuwa]7.0e-2948.28Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TX42 Uncharacterized protein2.6e-2947.59Show/hide
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A0A5A7U8L3 PMD domain-containing protein7.6e-2948.28Show/hide
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A0A5A7UET3 Putative mitochondrial protein1.5e-2948.63Show/hide
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A0A5D3BQ12 PMD domain-containing protein3.4e-2948.28Show/hide
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A0A5D3BXQ4 Putative mitochondrial protein2.0e-2948.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTATACTTCGTCGAGCACATTTCATCGAGACAAAAACATCTCGTCATCCTAAAAGATAGGACTCAGTCCATTAAGAGTGAGCTTACTCTATTAGCTGAAGAACCATT
GACCGGTCTTCTTTCACCCACGTGGCCTAATTTAAGTTTTAATTTTCTATCTCCATGCTCAACAGAAATACCCTTGAATCTTGATGATAAAGTATGGATTTTGAAATCTT
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TTCACTTCCTGTTATTGGGAGTGGATGAAGTTTGTGGTTGGTCGAAACGAGACATTACTTTACGAGAATTACCTATTTAATGGGGTGATTGTTAGGATTTATGCCCCATA
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTATACTTCGTCGAGCACATTTCATCGAGACAAAAACATCTCGTCATCCTAAAAGATAGGACTCAGTCCATTAAGAGTGAGCTTACTCTATTAGCTGAAGAACCATT
GACCGGTCTTCTTTCACCCACGTGGCCTAATTTAAGTTTTAATTTTCTATCTCCATGCTCAACAGAAATACCCTTGAATCTTGATGATAAAGTATGGATTTTGAAATCTT
CCATCCATGACAAAGCCTACGATCGAAGTCTAGAGTTAACCTTGGGGCGCCGTTTGATTGAAGGCAAGACTCGTCAGAACCCCGTAATGAAGATACTTGGGGAATTTACT
TTCACTTCCTGTTATTGGGAGTGGATGAAGTTTGTGGTTGGTCGAAACGAGACATTACTTTACGAGAATTACCTATTTAATGGGGTGATTGTTAGGATTTATGCCCCATA
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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