; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0009287 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0009287
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionMannan endo-1,4-beta-mannosidase 4-like
Genome locationLG11:6709262..6709477
RNA-Seq ExpressionTan0009287
SyntenyTan0009287
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058710.1 protein RALF-like 7 [Cucumis melo var. makuwa]4.1e-0652.11Show/hide
Query:  MATST-KILAMCIIMIMVCSFLVETINAT-TLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR
        MA++T KILA+ I MIMVCS +V   NA  +L Y AI  D   +C  G C+ L  PAN YNRGCE    CR
Subjt:  MATST-KILAMCIIMIMVCSFLVETINAT-TLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR

KAE8648219.1 hypothetical protein Csa_018424, partial [Cucumis sativus]2.2e-0750.75Show/hide
Query:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR
        T+  +  + + MIMVCS +    NAT+L Y AI   G  RC+ GKC ILG PAN Y RGCE  E CR
Subjt:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR

KAE8648222.1 hypothetical protein Csa_023891, partial [Cucumis sativus]2.2e-0750.75Show/hide
Query:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR
        T+  +  + + MIMVCS +    NAT+L Y AI   G  RC+ GKC ILG PAN Y RGCE  E CR
Subjt:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR

KAG6603811.1 hypothetical protein SDJN03_04420, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.2e-1154.29Show/hide
Query:  MATSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCRG
        MA STK+ A+CIIM++V SF+V    A +L Y A+  D   +C  GKC  LG PAN YNRGCEA + CRG
Subjt:  MATSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCRG

KGN49664.1 hypothetical protein Csa_018501 [Cucumis sativus]2.2e-0750.75Show/hide
Query:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR
        T+  +  + + MIMVCS +    NAT+L Y AI   G  RC+ GKC ILG PAN Y RGCE  E CR
Subjt:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KJT5 Uncharacterized protein4.0e-0749.25Show/hide
Query:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR
        T+  ++ + I MIM CS +    NAT+L Y  I   G  RC+ GKC ILG PAN Y RGCE  E CR
Subjt:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR

A0A0A0KLD0 Uncharacterized protein1.0e-0750.75Show/hide
Query:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR
        T+  +  + + MIMVCS +    NAT+L Y AI   G  RC+ GKC ILG PAN Y RGCE  E CR
Subjt:  TSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR

A0A200RBE7 Lipid-A-disaccharide synthase4.9e-0544.78Show/hide
Query:  TKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCRGD
        +++L +CI + +VCS L+E+  ATTL Y  +  DG P C   KC       N YNRGCE + RCR D
Subjt:  TKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCRGD

A0A5A7UUI8 Protein RALF-like 72.0e-0652.11Show/hide
Query:  MATST-KILAMCIIMIMVCSFLVETINAT-TLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR
        MA++T KILA+ I MIMVCS +V   NA  +L Y AI  D   +C  G C+ L  PAN YNRGCE    CR
Subjt:  MATST-KILAMCIIMIMVCSFLVETINAT-TLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCR

A0A650ERE4 Rapid alkalinization factor 71.1e-0437.88Show/hide
Query:  TKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCRG
        +K   +CI+ ++VCS  +ET++  ++ Y A+  D    CR  +C  L  P++ Y+RGCE  E+CRG
Subjt:  TKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCRG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAACCTCGACTAAAATATTGGCAATGTGCATCATTATGATAATGGTGTGCTCATTTCTAGTAGAGACAATAAATGCAACTACTCTTCATTATGACGCCATCGCTCT
GGATGGAAGACCAAGATGTAGATCAGGTAAGTGCAGAATACTAGGACGTCCAGCCAACAAATATAATAGAGGATGTGAGGCTATTGAAAGGTGCAGAGGCGACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAACCTCGACTAAAATATTGGCAATGTGCATCATTATGATAATGGTGTGCTCATTTCTAGTAGAGACAATAAATGCAACTACTCTTCATTATGACGCCATCGCTCT
GGATGGAAGACCAAGATGTAGATCAGGTAAGTGCAGAATACTAGGACGTCCAGCCAACAAATATAATAGAGGATGTGAGGCTATTGAAAGGTGCAGAGGCGACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATSTKILAMCIIMIMVCSFLVETINATTLHYDAIALDGRPRCRSGKCRILGRPANKYNRGCEAIERCRGD