; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0009369 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0009369
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationLG02:4753585..4754995
RNA-Seq ExpressionTan0009369
SyntenyTan0009369
Gene Ontology termsGO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG4209026.1 hypothetical protein ERO13_A03G169300v2 [Gossypium hirsutum]4.4e-2546.92Show/hide
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KAG6589096.1 AP-1 complex subunit sigma-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-3375.79Show/hide
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KAG7022803.1 AP-1 complex subunit sigma-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.4e-3276.92Show/hide
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MBA0556883.1 hypothetical protein [Gossypium lobatum]2.6e-2547.69Show/hide
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XP_012481249.1 PREDICTED: RING-H2 finger protein ATL18-like [Gossypium raimondii]6.8e-2646.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K513 RING-type domain-containing protein1.6e-4160.9Show/hide
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         EEE CSVCL EFT E LVSQLHRC HVFH ECIE+WL    FTCPLCRSF+F  L
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A0A0D2SLB9 RING-type domain-containing protein3.3e-2646.92Show/hide
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        C+HVFH  CIE W+   HFTCPLCRS LF+
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A0A1U8JQC4 RING-H2 finger protein ATL18-like3.3e-2646.92Show/hide
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A0A5D2M180 RING-type domain-containing protein3.3e-2646.92Show/hide
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A0A5J5SGF9 RING-type domain-containing protein3.3e-2646.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q7XLY8 E3 ubiquitin-protein ligase Os04g05909001.2e-0946.97Show/hide
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Q9SI09 Probable E3 ubiquitin-protein ligase XERICO2.1e-0940Show/hide
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        + P  RF  L R     +  CSVCL++F G+  +++L +C H+FH  C+E W+  ++ TCPLCR+
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Q9SZL4 RING-H2 finger protein ATL182.5e-1536.76Show/hide
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        V+ L RC H+FH  CIE WL   H TCPLCRSF+ +
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Q9XF92 Brassinosteroid-responsive RING protein 11.3e-1146.88Show/hide
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Q9ZT50 E3 ubiquitin-protein ligase RHA2A2.1e-0952.63Show/hide
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        GGG +   C VCL++    + V +L  CRHVFH +C+E WLH ++FTCPLCRS L S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24580.1 RING/U-box superfamily protein3.0e-1133.03Show/hide
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        + +  LK  V  +  I+   T   + ++  P       ++ + +F+ L      EEE     C VCL  F  E+ VS+L  C+H FH  C++NW    H 
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Query:  TCPLCRSFL
        TCPLCRS L
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AT1G63840.1 RING/U-box superfamily protein1.2e-1246.15Show/hide
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        LPV RF +++R    E E C+VCL +F  +D + +L  CRH+FH  C++ W+ GY+  TCPLCR+
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AT3G61460.1 brassinosteroid-responsive RING-H29.2e-1346.88Show/hide
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        LPV +F EL   G    E C+VCL EF GE  +  L  CRH+FH  C++ W+     TCPLCR+
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AT4G38140.1 RING/U-box superfamily protein1.8e-1636.76Show/hide
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Query:  VSQLHRCRHVFHFECIENWLHGYHFTCPLCRSFLFS
        V+ L RC H+FH  CIE WL   H TCPLCRSF+ +
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AT5G41400.1 RING/U-box superfamily protein3.2e-1348.48Show/hide
Query:  LPVCRFRELHRGG-GLEEETCSVCLAEFTGEDLVSQLHRCRHVFHFECIENWLHGYH-FTCPLCRS
        LPV RF EL R G G   + C+VCL EF  +D + +L  C+H+FH  C++ W+ GY+  TCPLCR+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAAAGAAAGCCCATGTTGCAAGAATGATAAGCTTGGCGTTAGGTCGAGGTCGAATGTGCATGGCTGCCATTGTCTTCTTCACTTGTGTGTGGATCCCTCTGTGTCA
ACTGAAGGTGTTCGTCGAGAGGATGATCGGCATTCTGTTGGGCAGGACATATCAGCCACTCACAATGGAGTCGCCACCGTGCGAGGTAAAACTTCCAGTTTGTAGGTTCA
GAGAGCTGCACCGTGGGGGCGGATTGGAGGAGGAGACTTGCTCCGTTTGCTTGGCGGAGTTCACCGGAGAAGATCTGGTGAGCCAACTGCATAGATGTCGCCATGTCTTT
CATTTTGAATGTATTGAGAATTGGCTCCATGGGTATCACTTTACCTGCCCTCTGTGCAGATCCTTCCTCTTCTCAGCACTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAAAGAAAGCCCATGTTGCAAGAATGATAAGCTTGGCGTTAGGTCGAGGTCGAATGTGCATGGCTGCCATTGTCTTCTTCACTTGTGTGTGGATCCCTCTGTGTCA
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CATTTTGAATGTATTGAGAATTGGCTCCATGGGTATCACTTTACCTGCCCTCTGTGCAGATCCTTCCTCTTCTCAGCACTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRKKAHVARMISLALGRGRMCMAAIVFFTCVWIPLCQLKVFVERMIGILLGRTYQPLTMESPPCEVKLPVCRFRELHRGGGLEEETCSVCLAEFTGEDLVSQLHRCRHVF
HFECIENWLHGYHFTCPLCRSFLFSAL