; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0009582 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0009582
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
Genome locationLG04:65603279..65603680
RNA-Seq ExpressionTan0009582
SyntenyTan0009582
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7990634.1 hypothetical protein I3843_02G035100 [Carya illinoinensis]3.3e-2546.21Show/hide
Query:  MPKGRTAGLHPFDPEIERTYRRLLREGRAEPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPNFHLKI
        M + R+  + P DPEIERT R L R    +   MA+++    P+ +++Y +PV N   + I+  PIN NNFELK  LI MV++  F G   +DPN HL +
Subjt:  MPKGRTAGLHPFDPEIERTYRRLLREGRAEPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPNFHLKI

Query:  FLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK
        FLEIC T K+NG++ ++IRLRLFPFSL+ +A+
Subjt:  FLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK

WP_217833153.1 retrotransposon gag domain-containing protein, partial [Synechococcus sp. PCC 7002]1.3e-3460.9Show/hide
Query:  MPKGRTAGLHPFDPEIERTYRRLLREGRAEPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPNFHLKI
        MP+  T  L P DPEI+RTYRR LR    +  EMA++     PK IR+YFQP   + Q GI++ PINVNNFELK GLIQM RE AFRG   EDP+ HL+ 
Subjt:  MPKGRTAGLHPFDPEIERTYRRLLREGRAEPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPNFHLKI

Query:  FLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAKE
        FLEICGT KMNG+S ++I+LRLFPFSLQ RAK+
Subjt:  FLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAKE

XP_012833448.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC105954320 [Erythranthe guttata]3.4e-2245.03Show/hide
Query:  RTAGLHPFDPEIERTYRRL----------LREGRAEPQEMA---DQEL---INNPKP-------IREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMV
        R   + P+DPEIERT RRL          + E +  P+ +A   DQE       P+P       +REY  P  N   +GI    I  NNFELKTGLI MV
Subjt:  RTAGLHPFDPEIERTYRRL----------LREGRAEPQEMA---DQEL---INNPKP-------IREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMV

Query:  REGAFRGLATEDPNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK
            F G AT DPN HL  FLEIC T K+NG+S ++IRL+LF FS++ +AK
Subjt:  REGAFRGLATEDPNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK

XP_022157708.1 uncharacterized protein LOC111024361 [Momordica charantia]1.2e-2259.41Show/hide
Query:  EPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQG
        +P E    E  NN   IR+Y QP F     GI++ PIN NN ELK GLIQMVRE  FRG ATEDPN HL IFL++CGT KMNG+  ++IRLRLFP SLQ 
Subjt:  EPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQG

Query:  R
        +
Subjt:  R

XP_022843226.1 uncharacterized protein LOC111366761 [Olea europaea var. sylvestris]3.6e-2448.18Show/hide
Query:  MPKGRTAGLHPFDPEIERTYRRLLREGRAEPQEMADQEL-----INNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPN
        M + R   L   DPE ERT+R L    R E + MA+Q++      N  + IR+Y +PV N   +GI    I   NFELK GLI MV++  F G A EDPN
Subjt:  MPKGRTAGLHPFDPEIERTYRRLLREGRAEPQEMADQEL-----INNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPN

Query:  FHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK
         HL  FLEIC T KMNG++ ++IRLRLF FSL+ +AK
Subjt:  FHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1U8Q202 uncharacterized protein LOC1091142084.8e-2247.62Show/hide
Query:  PFDPEIERTY---RRLLREGRAEPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGA-FRGLATEDPNFHLKIFLEICG
        P+DPEIERT     R  R+ RAE +EMA+      P+ + +Y +P        IV   I+ NNFE+K  +IQM++    F G+A EDPN H+  FLEIC 
Subjt:  PFDPEIERTY---RRLLREGRAEPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGA-FRGLATEDPNFHLKIFLEICG

Query:  TFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK
        TFK NG+S + +RLRLFPFSL+ +AK
Subjt:  TFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK

A0A2H9ZY12 Uncharacterized protein6.3e-2241.5Show/hide
Query:  MPKGRTAGLHPFDPEIERTYRRLLREGRAEP-------------QEMADQELINNP-KPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGA-
        M +     L PFDPEIERT  ++ R+ + +               +M DQ  I    + +REY  P  N     +V   +  NNFE+K  LIQM+++   
Subjt:  MPKGRTAGLHPFDPEIERTYRRLLREGRAEP-------------QEMADQELINNP-KPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGA-

Query:  FRGLATEDPNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK
        F GL ++DPN H+  FLEIC TFK NG+S ++IRLRLFPFSL+ +AK
Subjt:  FRGLATEDPNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK

A0A6J1DU19 uncharacterized protein LOC1110243615.7e-2359.41Show/hide
Query:  EPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQG
        +P E    E  NN   IR+Y QP F     GI++ PIN NN ELK GLIQMVRE  FRG ATEDPN HL IFL++CGT KMNG+  ++IRLRLFP SLQ 
Subjt:  EPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQG

Query:  R
        +
Subjt:  R

A0A6P6W382 uncharacterized protein LOC1137297694.1e-2144.2Show/hide
Query:  PFDPEIERTYRRLLRE-GRAEPQEM------------ADQELINNP---KPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDP
        PFDPEIER  RR  R     E QE+             ++E+  N    + +R++  P     Q  I    +N NNFE+K  LIQMV++  + G ATEDP
Subjt:  PFDPEIERTYRRLLRE-GRAEPQEM------------ADQELINNP---KPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDP

Query:  NFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK
        N HL  FLEIC T K NG+S ++I+LRLFPFSL+ +AK
Subjt:  NFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK

A0A803PJA6 Uncharacterized protein2.4e-2143.88Show/hide
Query:  DPEIERTYRRLLREGRAEPQEMADQELINN-------------------PKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATED
        +PEIERT    L++ +A+ +       INN                   P+ +R+Y  PV N    GI +  I  NNFELK  LI MV++  F GLAT+D
Subjt:  DPEIERTYRRLLREGRAEPQEMADQELINN-------------------PKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATED

Query:  PNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK
        PN HL IFLE+C T KMNG+  ++I+LRLFPFSL+ +AK
Subjt:  PNFHLKIFLEICGTFKMNGISANSIRLRLFPFSLQGRAK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCCAAGGGGAGAACTGCAGGCTTGCACCCTTTTGATCCTGAGATTGAAAGGACCTATAGGAGACTCCTAAGGGAAGGAAGAGCAGAACCTCAGGAGATGGCTGATCA
GGAGCTCATCAACAACCCTAAACCTATCAGGGAGTATTTCCAGCCTGTGTTTAATTCTGAGCAGGCTGGAATAGTCCATGCCCCTATCAATGTTAATAACTTTGAACTCA
AAACAGGGCTAATACAAATGGTTAGGGAAGGTGCTTTCAGAGGCCTAGCCACAGAAGATCCTAACTTTCATCTTAAAATTTTTTTGGAAATCTGTGGTACATTTAAAATG
AATGGTATCTCTGCTAATAGTATTCGCTTACGTCTCTTTCCTTTTTCCTTGCAGGGTAGAGCCAAAGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCCAAGGGGAGAACTGCAGGCTTGCACCCTTTTGATCCTGAGATTGAAAGGACCTATAGGAGACTCCTAAGGGAAGGAAGAGCAGAACCTCAGGAGATGGCTGATCA
GGAGCTCATCAACAACCCTAAACCTATCAGGGAGTATTTCCAGCCTGTGTTTAATTCTGAGCAGGCTGGAATAGTCCATGCCCCTATCAATGTTAATAACTTTGAACTCA
AAACAGGGCTAATACAAATGGTTAGGGAAGGTGCTTTCAGAGGCCTAGCCACAGAAGATCCTAACTTTCATCTTAAAATTTTTTTGGAAATCTGTGGTACATTTAAAATG
AATGGTATCTCTGCTAATAGTATTCGCTTACGTCTCTTTCCTTTTTCCTTGCAGGGTAGAGCCAAAGAATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPKGRTAGLHPFDPEIERTYRRLLREGRAEPQEMADQELINNPKPIREYFQPVFNSEQAGIVHAPINVNNFELKTGLIQMVREGAFRGLATEDPNFHLKIFLEICGTFKM
NGISANSIRLRLFPFSLQGRAKE