; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0009583 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0009583
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionagamous-like MADS-box protein AGL19
Genome locationLG07:68595332..68601993
RNA-Seq ExpressionTan0009583
SyntenyTan0009583
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR002487 - Transcription factor, K-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008437191.1 PREDICTED: agamous-like MADS-box protein AGL19 [Cucumis melo]1.1e-8986.45Show/hide
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XP_022156217.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Momordica charantia]2.9e-8785.12Show/hide
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XP_038906882.1 agamous-like MADS-box protein AGL19 [Benincasa hispida]1.0e-9288.64Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3AT26 agamous-like MADS-box protein AGL195.1e-9086.45Show/hide
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A0A6J1DRG2 agamous-like MADS-box protein AGL191.4e-8785.12Show/hide
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A0A6J1E382 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X29.3e-8480.93Show/hide
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A0A6J1E6F6 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X17.6e-8681.4Show/hide
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        FIG PERR++ NGFL
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A0A6J1I258 agamous-like MADS-box protein AGL19 isoform X13.8e-8580.93Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64645 MADS-box protein SOC12.4e-5257.14Show/hide
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        VET+LFIG P
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O82743 Agamous-like MADS-box protein AGL191.3e-5861.68Show/hide
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        K++ LE+ KRKLLG+G+D CSIEELQQLE Q++RSLS+IR++K+QLL+EEI KLK EE+ L++EN +L+ K   + T +    +++   SE N  + M+V
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        ET LFIGPPE R S
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Q38838 Agamous-like MADS-box protein AGL142.2e-5357.87Show/hide
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        +K++HLE+  RK++G+GLD  SIEELQQLE Q++RSL KIR++K+QLL+EE  KLKE+E+ L+ EN  L  K   +        S    TS    + N+ 
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         M+V T+LFIGPPE R
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Q9FIS1 MADS-box protein AGL421.8e-4753.59Show/hide
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        MVRGK +MK+IENATSRQVTFSKRRNGLLKKA+ELSVLCDA+++LIIFS RG+LYEFS+  M KTI+RY+  TK+   SN+ +   +Q  K+  S  +T 
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        K++ LE  KRKLLG G+  CS+EELQ+++ Q++RSL K+R RK QL KE++ KLK +EK LLEEN +L  K  +        +    + +     ++VET
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Query:  ELFIGPPER
        +LFIG P R
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Q9XJ60 MADS-box transcription factor 503.4e-5156.11Show/hide
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        MVRGKTQMKRIEN TSRQVTFSKRRNGLLKKAFELSVLCDAEVALI+FSPRGKLYEF++ S  KTI+RY+  TKE +  N    +D++  K  D+  + K
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        KL+ LE  KRKLLG+ LD CSIEEL  LE ++ERSL  IR RK +LL+E++ KL+E+E  L ++N EL+ K + +           + E       +  +
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Query:  TMDVETELFIGPPERRSSNNG
         MDVETELFIG P R  S+ G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45660.1 AGAMOUS-like 201.7e-5357.14Show/hide
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        K++ LE  KRKLLG+G+  CSIEELQQ+E+Q+E+S+  IR+RK Q+ KE+I +LK++EK L  EN +L  K  +      S+K  E++    E +  + +
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Query:  VETELFIGPP
        VET+LFIG P
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AT4G11880.1 AGAMOUS-like 141.5e-5457.87Show/hide
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        +K++HLE+  RK++G+GLD  SIEELQQLE Q++RSL KIR++K+QLL+EE  KLKE+E+ L+ EN  L  K   +        S    TS    + N+ 
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Query:  TMDVETELFIGPPERR
         M+V T+LFIGPPE R
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AT4G22950.1 AGAMOUS-like 199.3e-6061.68Show/hide
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Query:  ETELFIGPPERRSS
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