; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0009759 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0009759
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionKH domain-containing protein
Genome locationLG01:87415090..87425161
RNA-Seq ExpressionTan0009759
SyntenyTan0009759
Gene Ontology termsGO:0048024 - regulation of mRNA splicing, via spliceosome (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004087 - K Homology domain
IPR032377 - STAR protein, homodimerisation region
IPR036612 - K Homology domain, type 1 superfamily
IPR045071 - KH domain-containing BBP-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038897899.1 KH domain-containing protein At5g56140 isoform X1 [Benincasa hispida]4.0e-15697.64Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3M6 KH domain-containing protein4.5e-15395.61Show/hide
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A0A1S3BI94 KH domain-containing protein At5g56140 isoform X23.8e-15295.27Show/hide
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A0A6J1CCS9 KH domain-containing protein At5g56140-like isoform X12.3e-15797.97Show/hide
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A0A6J1F952 KH domain-containing protein At5g56140-like7.1e-15194.97Show/hide
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A0A6J1IMS3 KH domain-containing protein At5g56140-like3.8e-15295Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0WLR1 KH domain-containing protein At4g264805.7e-11374.16Show/hide
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Q75GR5 KH domain-containing protein SPIN14.6e-7053.36Show/hide
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         W    Q  +       ++ +W  +  S S  +VK+ +R+DVPVD+YPN+NFVGR+LGPRGNSLKRVEAST CRV IRG+GSIKDP +E+ +RGK GYEH
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        L++PLHIL+EAE P  IIDARL  A+E++E+LLKP+DES DFYK+QQLRELAMLN TLRE+ SP   SVSPF N  GMKRAKT
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Q8GYR4 KH domain-containing protein At3g086209.2e-7153.29Show/hide
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        Y  FSPS +A      P +R+PSS          +Y+S+LLAE QKL PFM VLP   RLLNQEI R+T ++          L H   SP+AS  + SN 
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         G  + GW       + G      A  W  +  S S   VKR +R+D+PVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +EE ++G
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        K GYEHLNE LHIL+EA+LP++I+D +L QA+EI+E+L+KP+DES D+ K+QQLRELA+LN  LRE     S SVSPF NS  MKR KT
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Q9FKT4 KH domain-containing protein At5g561401.1e-11676.27Show/hide
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        GG +M +S S    PSAP SP+   GLRS SS      +EQEKYLSELLAER KL+PF+PVLP+++RLLNQEILRVTTLL  A+VL QSGL+H SPLASG
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        E+MRGK GYEHLNEPLHILVEAELP+EI+DARLMQAREIL+DLL P++E+HD YKKQQLRELA+LNGTLREEGSPMS SVSP+ NSLGMKRAKTR
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Q9ZVI3 KH domain-containing protein At2g386105.0e-6953.43Show/hide
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        SP+ A++  +     ++  +YL+ELLAE QKL+PFM VLP   RLLNQE+ RV+ ++          L H   SP+AS  + SN     + GW    Q  
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Query:  MSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREELMRGKAGYEHLNEPLHILV
        +SG   P    +W  + GS S   VKR +R+++PVDNYPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +E+ +RG+ GYEHLNE LHIL+
Subjt:  MSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREELMRGKAGYEHLNEPLHILV

Query:  EAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKT
        EA+LP  I++ RL QA+EI+E+LLKP+DES DF K+QQLRELA+LN   LREE  G     SVSPF++S   KR KT
Subjt:  EAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKT

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G38610.1 RNA-binding KH domain-containing protein3.6e-7053.43Show/hide
Query:  SPSSASAAAL-----LEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-GGADMNGWPSRFQSE
        SP+ A++  +     ++  +YL+ELLAE QKL+PFM VLP   RLLNQE+ RV+ ++          L H   SP+AS  + SN     + GW    Q  
Subjt:  SPSSASAAAL-----LEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-GGADMNGWPSRFQSE

Query:  MSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREELMRGKAGYEHLNEPLHILV
        +SG   P    +W  + GS S   VKR +R+++PVDNYPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +E+ +RG+ GYEHLNE LHIL+
Subjt:  MSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREELMRGKAGYEHLNEPLHILV

Query:  EAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKT
        EA+LP  I++ RL QA+EI+E+LLKP+DES DF K+QQLRELA+LN   LREE  G     SVSPF++S   KR KT
Subjt:  EAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKT

AT2G38610.2 RNA-binding KH domain-containing protein3.6e-7053.43Show/hide
Query:  SPSSASAAAL-----LEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-GGADMNGWPSRFQSE
        SP+ A++  +     ++  +YL+ELLAE QKL+PFM VLP   RLLNQE+ RV+ ++          L H   SP+AS  + SN     + GW    Q  
Subjt:  SPSSASAAAL-----LEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-GGADMNGWPSRFQSE

Query:  MSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREELMRGKAGYEHLNEPLHILV
        +SG   P    +W  + GS S   VKR +R+++PVDNYPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +E+ +RG+ GYEHLNE LHIL+
Subjt:  MSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREELMRGKAGYEHLNEPLHILV

Query:  EAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKT
        EA+LP  I++ RL QA+EI+E+LLKP+DES DF K+QQLRELA+LN   LREE  G     SVSPF++S   KR KT
Subjt:  EAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLN-GTLREE--GSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKT

AT3G08620.1 RNA-binding KH domain-containing protein6.5e-7253.29Show/hide
Query:  YMAFSPSPSAPHSPHLPGLRSPSSASAAALLEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-
        Y  FSPS +A      P +R+PSS          +Y+S+LLAE QKL PFM VLP   RLLNQEI R+T ++          L H   SP+AS  + SN 
Subjt:  YMAFSPSPSAPHSPHLPGLRSPSSASAAALLEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEH--ASPLASGGIFSN-

Query:  GGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREELMRG
         G  + GW       + G      A  W  +  S S   VKR +R+D+PVD YPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEA+T CRV IRG+GSIKDP +EE ++G
Subjt:  GGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREELMRG

Query:  KAGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKT
        K GYEHLNE LHIL+EA+LP++I+D +L QA+EI+E+L+KP+DES D+ K+QQLRELA+LN  LRE     S SVSPF NS  MKR KT
Subjt:  KAGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKT

AT4G26480.1 RNA-binding KH domain-containing protein4.0e-11474.16Show/hide
Query:  SAGGMYMAFSP----SPSAPHSPHLP-GLRSPSSASAAALLEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLA
        S GG ++ + P     PSAP SP+   GLRS  S     L+EQEKYLSELLAER KL+PF+PVLP+  RL+NQEILRVTTLL  A  L QS  +H SPLA
Subjt:  SAGGMYMAFSP----SPSAPHSPHLP-GLRSPSSASAAALLEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLA

Query:  SGGIFSNGGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPA
        SGGIF N  ADMNGW S+F SE S  +  S A NWL+S GSSSGLIVKRTIRVD+PVD YPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDP 
Subjt:  SGGIFSNGGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPA

Query:  REELMRGKAGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKTRG
        +E++MRGK GYEHLNEPLHILVEAELP+EI+DARLMQAREIL+DLL P++E+HDFYKKQQLRELA+LNG+LREEGSPMS S+SP+ NSLGMKRAKTRG
Subjt:  REELMRGKAGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKTRG

AT5G56140.1 RNA-binding KH domain-containing protein7.9e-11876.27Show/hide
Query:  GGMYMAFSPS----PSAPHSPHLP-GLRSPSSASAAALLEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLASG
        GG +M +S S    PSAP SP+   GLRS SS      +EQEKYLSELLAER KL+PF+PVLP+++RLLNQEILRVTTLL  A+VL QSGL+H SPLASG
Subjt:  GGMYMAFSPS----PSAPHSPHLP-GLRSPSSASAAALLEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLASG

Query:  GIFSNGGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPARE
        GIF N  ADMNGW S+F SE S  +  S   NWL+S GSSSGLI KRTIRVD+PVDNYPN+NFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDP +E
Subjt:  GIFSNGGADMNGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPARE

Query:  ELMRGKAGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKTR
        E+MRGK GYEHLNEPLHILVEAELP+EI+DARLMQAREIL+DLL P++E+HD YKKQQLRELA+LNGTLREEGSPMS SVSP+ NSLGMKRAKTR
Subjt:  ELMRGKAGYEHLNEPLHILVEAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKTR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGTCGTCTGCAGGCGGGATGTACATGGCTTTCTCTCCCTCTCCTTCGGCTCCTCACTCTCCTCATCTTCCTGGTCTTCGCTCTCCGTCCTCTGCATCTGCTGCTGC
TCTACTCGAGCAAGAAAAGTATCTCTCTGAGTTGTTGGCAGAGCGGCAGAAACTTAGTCCCTTTATGCCTGTGCTCCCTAATAGTTATCGCTTGCTGAACCAAGAAATAT
TGCGTGTAACCACACTATTGGGGAAGGCATCAGTTTTAGGTCAAAGTGGGCTTGAACATGCCAGCCCCCTGGCTTCTGGAGGAATATTTTCAAATGGAGGTGCTGACATG
AATGGATGGCCATCACGGTTTCAATCAGAAATGTCAGGTTTATTACAACCCTCATCAGCACAAAATTGGCTAAGTTCCCAAGGTAGTTCATCAGGTCTTATTGTGAAGAG
AACCATCAGAGTAGACGTTCCTGTTGACAACTACCCTAATTATAACTTTGTTGGGCGCCTCCTTGGACCTAGGGGAAACTCTCTCAAGCGAGTGGAGGCAAGTACTGATT
GTCGAGTTTTGATTAGAGGGCGTGGTAGCATTAAGGATCCAGCTAGGGAAGAATTGATGAGAGGAAAAGCAGGTTACGAGCATTTGAATGAGCCTCTCCACATCCTAGTT
GAGGCAGAATTGCCAGTTGAAATTATTGATGCTCGCCTTATGCAAGCCCGGGAGATTCTCGAGGACTTGCTCAAACCAATAGATGAATCTCATGACTTCTACAAGAAGCA
ACAGCTACGAGAACTAGCCATGCTCAATGGCACACTTCGTGAGGAGGGTTCGCCTATGTCTAGTTCTGTGTCGCCCTTCCACAATAGCCTCGGAATGAAGAGAGCCAAAA
CTAGGGGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAAATATTCCAATTCCAATATATTATGTAACACAAATAATTTACATATATATATATATTTTTATATTTTTATATATCTGTAAAATTAAATACATATTGATATAGATAGA
CAAAGAAGAAGGCCAGCAGGTAGTGTGCATAATTTTTCCACCGACGCCAGATTGATAGAGCGGTCTGGTCGGGATCGCCATCGCCGCCGTCGTCACCACCGCCATCGCCG
CCACTGACTTCGAATCCTGGCCGTATCCATATCCACTCACGTCTCCGGAGGGAGAGAAATGACGTCGTCTGCAGGCGGGATGTACATGGCTTTCTCTCCCTCTCCTTCGG
CTCCTCACTCTCCTCATCTTCCTGGTCTTCGCTCTCCGTCCTCTGCATCTGCTGCTGCTCTACTCGAGCAAGAAAAGTATCTCTCTGAGTTGTTGGCAGAGCGGCAGAAA
CTTAGTCCCTTTATGCCTGTGCTCCCTAATAGTTATCGCTTGCTGAACCAAGAAATATTGCGTGTAACCACACTATTGGGGAAGGCATCAGTTTTAGGTCAAAGTGGGCT
TGAACATGCCAGCCCCCTGGCTTCTGGAGGAATATTTTCAAATGGAGGTGCTGACATGAATGGATGGCCATCACGGTTTCAATCAGAAATGTCAGGTTTATTACAACCCT
CATCAGCACAAAATTGGCTAAGTTCCCAAGGTAGTTCATCAGGTCTTATTGTGAAGAGAACCATCAGAGTAGACGTTCCTGTTGACAACTACCCTAATTATAACTTTGTT
GGGCGCCTCCTTGGACCTAGGGGAAACTCTCTCAAGCGAGTGGAGGCAAGTACTGATTGTCGAGTTTTGATTAGAGGGCGTGGTAGCATTAAGGATCCAGCTAGGGAAGA
ATTGATGAGAGGAAAAGCAGGTTACGAGCATTTGAATGAGCCTCTCCACATCCTAGTTGAGGCAGAATTGCCAGTTGAAATTATTGATGCTCGCCTTATGCAAGCCCGGG
AGATTCTCGAGGACTTGCTCAAACCAATAGATGAATCTCATGACTTCTACAAGAAGCAACAGCTACGAGAACTAGCCATGCTCAATGGCACACTTCGTGAGGAGGGTTCG
CCTATGTCTAGTTCTGTGTCGCCCTTCCACAATAGCCTCGGAATGAAGAGAGCCAAAACTAGGGGGTAAATGGAACTGCTCCTTCATAGGAGGTTCTTTTGGAGATCGTT
TTCTAGTGTCTGGGAGTAATCAGCAGTCCCATTCCAAGGTGTTGCCTGCAGCCAATGCCTTCAACTGCAATCGGGGCACTCGCACTCTTACGTGCAGGTTCTTACTAAAA
TTTATATGGTGTGTTTATGTAATATTTGGAAGAGAAGGTAATGTAATGACATGAAAATGTCAAGCAGTTAAGGATTACTAGCGATTGGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTSSAGGMYMAFSPSPSAPHSPHLPGLRSPSSASAAALLEQEKYLSELLAERQKLSPFMPVLPNSYRLLNQEILRVTTLLGKASVLGQSGLEHASPLASGGIFSNGGADM
NGWPSRFQSEMSGLLQPSSAQNWLSSQGSSSGLIVKRTIRVDVPVDNYPNYNFVGRLLGPRGNSLKRVEASTDCRVLIRGRGSIKDPAREELMRGKAGYEHLNEPLHILV
EAELPVEIIDARLMQAREILEDLLKPIDESHDFYKKQQLRELAMLNGTLREEGSPMSSSVSPFHNSLGMKRAKTRG