; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0010298 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0010298
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationLG02:94510540..94512724
RNA-Seq ExpressionTan0010298
SyntenyTan0010298
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598794.1 hypothetical protein SDJN03_08572, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.7e-10678.01Show/hide
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XP_022131304.1 uncharacterized protein LOC111004568 [Momordica charantia]1.4e-10575.6Show/hide
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XP_022962078.1 uncharacterized protein LOC111462641 [Cucurbita moschata]1.5e-10778.69Show/hide
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XP_023545800.1 uncharacterized protein LOC111805127 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-10879.04Show/hide
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XP_038885578.1 uncharacterized protein LOC120075907 [Benincasa hispida]6.4e-11480.82Show/hide
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        T PL RKSNEIETAVASTPE+GG APS   PS GR++SLST SRDQ SK K   +SSFSLNELSSAISESEKTR CFSAI+AFLVVASYVGFPFLG S+M
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LP83 Uncharacterized protein2.1e-10274.74Show/hide
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        STAPLL KSNEIE+AVASTPE+ GRAP   + S+G+++ LST++RDQ SK K   +SSFS+NELS  ISESEKTR CFS I+AFLVVA YVGFPFLG S+
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        MRIVFG RPLYLVLLTN T+VLG+LLFTKQKG+RV++RG+GQV   E QSSVEQIGKV+EA LVAQKAMGA+FMDCSV+AVIVVSGLS VQ L
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A0A1S3BBA5 uncharacterized protein LOC1034882054.6e-10274.66Show/hide
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        TAPL+ KSNEIE+AVASTPE+ GRAP   +PS+G+++ LST +RDQ SK K   +SSFS+NELS AISESEKTR CFS I+AFLVVAS V FPFLG S+M
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        R +FG RPLYLVLLTN T+VLGRLLFTKQKGFRVSDR + QV   EGQSSVEQIGKV+EA LVAQKAMGA+ MDCSVFAVIVVSGLS +Q L
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A0A6J1BPV3 uncharacterized protein LOC1110045686.9e-10675.6Show/hide
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        APL  K   +ETAVAST E+ G+AP R+A S+G+NSSLSTL RDQC   K  P++SFSLNELSSAISESE TR CFSA +AFLVVASYVGFPFLG SL R
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A0A6J1HDN9 uncharacterized protein LOC1114626417.3e-10878.69Show/hide
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A0A6J1K4V4 uncharacterized protein LOC1114917151.2e-10578.35Show/hide
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        APLL KSNEIE AVASTP++GGRAPS V  S+GR+SSLST  RDQ SK KF  LSSFSL +LSSAISESE TR CFSAI+AFLVVASYVGFPFLG SLMR
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        IVFGSRP+YLVLLTN TVVLGRLLF KQKG RVSDRGEGQV   EGQSS EQIG V+EAGLVAQKAMGA+FMD SVFAVIVVSGLSFVQ L
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G52343.1 unknown protein2.5e-1529.03Show/hide
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        RE RRRRI+ERGSDRLALITGQ+ +L   PSSP        SSS +  S+ +     F  Q    H++ +   +   Q   ++ ARS             
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Query:  KSNEIETAVASTPENGGRAPSRVAPSQGRNSSLSTLSRDQCSKTKFLPLSSFSLNELSSAISESEKTRFCFSAIMAFLVVASYVGFPFLGLSLMRIVFGS
        +  ++ T +          P ++ P++   ++ S  S++Q       P+  FS  +L+++I  SE+TR   S  +A  VV      P L ++    +   
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Query:  RPLYLVLLTNVTVVLGRLLFTKQKGFRVSDRGEGQVTALEGQS--SVEQIGKVIEAGLVAQKAMGALFMDCSVFAVIVV
        RPL+L++LT+  +V+  L  T+  G  +S   E      +G +  +     +++E G+V  +A+  +F+DCS++ V+VV
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AT4G32680.1 unknown protein3.4e-2532.57Show/hide
Query:  MAANPREARRRRILERGSDRLALITGQIQSLPSPPSSPPLYDEIKDSSSQTLISNQQDLRPRFPDQPTV---------SHNKDMLVGTTLQQQDPQISAR
        MA+N REARRR+IL+RGSDRLA ITGQI  +PSPP S     +   S SQ+ +   Q L    P +  +         SH  ++     L+  D  I   
Subjt:  MAANPREARRRRILERGSDRLALITGQIQSLPSPPSSPPLYDEIKDSSSQTLISNQQDLRPRFPDQPTV---------SHNKDMLVGTTLQQQDPQISAR

Query:  SSAYYGTSTAPL--LRKSNEIETAVASTPENGGRAPSRVAPSQGRNSSLSTLSRDQCSKTKFLPLSSF----SLNELSSAISESEKTRFCFSAIMAFLVV
            + +   PL   R +  +  A AS P +          S  +N S+  L   Q     F+P+ SF    +   + +AI  SE  R   +  +A +V+
Subjt:  SSAYYGTSTAPL--LRKSNEIETAVASTPENGGRAPSRVAPSQGRNSSLSTLSRDQCSKTKFLPLSSF----SLNELSSAISESEKTRFCFSAIMAFLVV

Query:  ASYVGFPFLGLSLMRIVFGSRPLYLVLLTNVTVVLGRLLFTKQKGFRVSDRGEGQVTALEGQSSVEQIGKVIEAGLVAQKAMGALFMDCSVFAVIVVSGL
         S++GF  LG      +   RP++L++LT+ T+VLGR+L + +      D      T + GQ  V+Q+G  +E  ++ +K M AL MD S++AVI++ GL
Subjt:  ASYVGFPFLGLSLMRIVFGSRPLYLVLLTNVTVVLGRLLFTKQKGFRVSDRGEGQVTALEGQSSVEQIGKVIEAGLVAQKAMGALFMDCSVFAVIVVSGL

Query:  SFVQ
           Q
Subjt:  SFVQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCGAACCCGAGAGAAGCCCGACGGCGGCGGATCCTGGAGCGAGGCTCCGACCGTTTAGCCCTAATCACCGGTCAGATCCAGTCCCTTCCTTCTCCCCCCTCATC
TCCACCGCTGTACGATGAAATTAAGGATTCATCATCCCAGACGTTGATCTCGAATCAACAGGATCTCCGGCCTCGTTTTCCCGATCAACCCACCGTTTCTCATAATAAGG
ATATGCTGGTTGGAACTACATTGCAGCAGCAGGATCCTCAGATTAGTGCTAGGTCCTCTGCATATTATGGAACCAGTACAGCACCTCTGTTGAGAAAATCTAATGAAATA
GAAACTGCAGTAGCTTCTACTCCTGAAAACGGTGGAAGAGCACCATCCCGTGTCGCCCCATCTCAAGGTCGAAATTCATCTCTTTCTACATTGAGTAGAGATCAATGCTC
AAAAACAAAATTTCTACCCCTCAGTTCCTTCTCTCTAAATGAATTAAGTTCTGCGATTTCTGAATCTGAGAAGACCCGTTTTTGTTTTTCGGCCATTATGGCCTTTCTAG
TAGTTGCTTCATATGTAGGATTTCCTTTCTTAGGCCTGAGTCTCATGAGAATTGTTTTTGGATCTAGACCACTCTATCTTGTCTTGCTCACTAATGTAACAGTTGTACTT
GGGAGACTACTTTTCACCAAACAGAAGGGTTTTAGAGTATCTGATAGAGGAGAGGGTCAAGTAACTGCACTTGAAGGACAAAGTTCAGTTGAACAAATTGGTAAGGTTAT
AGAGGCAGGTTTAGTAGCTCAGAAGGCAATGGGTGCACTTTTCATGGACTGCAGTGTGTTTGCAGTAATCGTCGTTTCGGGACTTTCGTTTGTGCAGTGGCTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAGTTTTACCTCACGACACGTGGTGTATTTGGGAAACCTCCATCTCCCTTCCTTCAACACTGCAAATTGAATGAAAACAAGTTACCTGGGGAATGGATTGGGATAATCTT
TGAATCTTCCAGAAACTGAACAAAACCCCTCCCATTTCCGGCGGTGTTTTGAACTTTCATGGCGGCGAACCCGAGAGAAGCCCGACGGCGGCGGATCCTGGAGCGAGGCT
CCGACCGTTTAGCCCTAATCACCGGTCAGATCCAGTCCCTTCCTTCTCCCCCCTCATCTCCACCGCTGTACGATGAAATTAAGGATTCATCATCCCAGACGTTGATCTCG
AATCAACAGGATCTCCGGCCTCGTTTTCCCGATCAACCCACCGTTTCTCATAATAAGGATATGCTGGTTGGAACTACATTGCAGCAGCAGGATCCTCAGATTAGTGCTAG
GTCCTCTGCATATTATGGAACCAGTACAGCACCTCTGTTGAGAAAATCTAATGAAATAGAAACTGCAGTAGCTTCTACTCCTGAAAACGGTGGAAGAGCACCATCCCGTG
TCGCCCCATCTCAAGGTCGAAATTCATCTCTTTCTACATTGAGTAGAGATCAATGCTCAAAAACAAAATTTCTACCCCTCAGTTCCTTCTCTCTAAATGAATTAAGTTCT
GCGATTTCTGAATCTGAGAAGACCCGTTTTTGTTTTTCGGCCATTATGGCCTTTCTAGTAGTTGCTTCATATGTAGGATTTCCTTTCTTAGGCCTGAGTCTCATGAGAAT
TGTTTTTGGATCTAGACCACTCTATCTTGTCTTGCTCACTAATGTAACAGTTGTACTTGGGAGACTACTTTTCACCAAACAGAAGGGTTTTAGAGTATCTGATAGAGGAG
AGGGTCAAGTAACTGCACTTGAAGGACAAAGTTCAGTTGAACAAATTGGTAAGGTTATAGAGGCAGGTTTAGTAGCTCAGAAGGCAATGGGTGCACTTTTCATGGACTGC
AGTGTGTTTGCAGTAATCGTCGTTTCGGGACTTTCGTTTGTGCAGTGGCTTTAGATTCAGGGTGTGTCAATGTCTTACCGTTCGTTTCGTTTCTTTTCTTTTCTTCTCAG
TTTTGCACCTATTCTGAAAATTTTGTACTGTATATTTGATCTTTGTGTTTACTGTTGAATGGCATTAAGAGGGTTGTATTTCTTTCGCTTAGCCAACTTTGTATAGCTCA
ACTGGTTAAAACTTATACTATTGATCCAGAAGTTATAGATTCGAATCTCTCTCCTCCCACAAATGTTGAACTTAAAAATATGTATATTTCTTTAGTTCAACTTCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAANPREARRRRILERGSDRLALITGQIQSLPSPPSSPPLYDEIKDSSSQTLISNQQDLRPRFPDQPTVSHNKDMLVGTTLQQQDPQISARSSAYYGTSTAPLLRKSNEI
ETAVASTPENGGRAPSRVAPSQGRNSSLSTLSRDQCSKTKFLPLSSFSLNELSSAISESEKTRFCFSAIMAFLVVASYVGFPFLGLSLMRIVFGSRPLYLVLLTNVTVVL
GRLLFTKQKGFRVSDRGEGQVTALEGQSSVEQIGKVIEAGLVAQKAMGALFMDCSVFAVIVVSGLSFVQWL