| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7018652.1 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 1.0e-61 | 63.87 | Show/hide |
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MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+RESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG E R
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Query: VMKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQ-GW----ILFYSLIEHN--SQNRGARDEYFSPARSRSISQSHSP
+ R +E AEA + + + +I + A ++ + W F S + S +RGARDEY SPARSRSIS+SHSP
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Query: RDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRS
RDRRDYSRSP+PKENGRSPR VDIARSRSRS RA SRS
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|
|
| XP_022137875.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Momordica charantia] | 2.4e-63 | 64.44 | Show/hide |
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MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDR+ ESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTG F
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+ K++L ++ R EIRI +E + + + G + P + + S H+S+NRGARDEY SPARSRSIS+S S
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Query: PRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRS
P DRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI RSRSRSLRA SRS
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|
|
| XP_022955785.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita moschata] | 2.1e-62 | 63.18 | Show/hide |
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MA+YRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+RESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG F
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+ K++L ++ R EIRI +E + + + G + P + S H+S++RGARDEY SPARSRSIS+SHS
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PRDRRDYSRSP+PKENGRSPR VD ARSRSRS RA SRS
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|
|
| XP_022979912.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita maxima] | 2.4e-63 | 64.02 | Show/hide |
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MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+RESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG F
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+ K++L ++ R EIRI +E + + + G + P + S H+S++RGARDEY SPARSRSIS+SHS
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PRDRRDYSRSP+PKENGRSPR VDIARSRSRS RA SRS
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|
|
| XP_023527505.1 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.4e-63 | 64.02 | Show/hide |
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MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+RESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG F
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+ K++L ++ R EIRI +E + + + G + P + S H+S++RGARDEY SPARSRSIS+SHS
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PRDRRDYSRSP+PKENGRSPR VDIARSRSRS RA SRS
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|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1S3AXW0 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 9.3e-61 | 61.92 | Show/hide |
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MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+RESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG F
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+ K++L ++ R EIRI +E + + + G + P + + S H+S++RGARDEY SPARSRSIS S S
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Query: PRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRS
PRDR+DYSRSP+PK+NGRSPREVD ARSRSRS + SRS
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|
|
| A0A5D3CXM8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 9.3e-61 | 61.92 | Show/hide |
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MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+RESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG F
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+ K++L ++ R EIRI +E + + + G + P + + S H+S++RGARDEY SPARSRSIS S S
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Query: PRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRS
PRDR+DYSRSP+PK+NGRSPREVD ARSRSRS + SRS
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|
|
| A0A6J1C7W4 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.2e-63 | 64.44 | Show/hide |
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MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDR+ ESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLR PFERFGPVKDVYLPKNYYTG F
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+ K++L ++ R EIRI +E + + + G + P + + S H+S+NRGARDEY SPARSRSIS+S S
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Query: PRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRS
P DRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI RSRSRSLRA SRS
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|
|
| A0A6J1GW11 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 9.9e-63 | 63.18 | Show/hide |
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MA+YRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+RESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG F
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+ K++L ++ R EIRI +E + + + G + P + S H+S++RGARDEY SPARSRSIS+SHS
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Query: PRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRS
PRDRRDYSRSP+PKENGRSPR VD ARSRSRS RA SRS
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|
|
| A0A6J1IQ05 serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 1.2e-63 | 64.02 | Show/hide |
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MARYRSRSRSYSPRRRSR+PPRGRKRYDDDPRDR+RESRS+RDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG F
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Query: VLATSVMKEKLRKSIFFFRLICEIRI--SEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLT-QGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSISQSHS
+ K++L ++ R EIRI +E + + + G + P + S H+S++RGARDEY SPARSRSIS+SHS
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Query: PRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRS
PRDRRDYSRSP+PKENGRSPR VDIARSRSRS RA SRS
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q09511 Probable splicing factor, arginine/serine-rich 4 | 7.5e-07 | 30.34 | Show/hide |
Query: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGVFTLENRVLATSVMKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHL
+ L + NL P DLR FER+G + DV++P++ Y+ + K F R E R +EH + T+G L +G ++ +T A
Subjt: SGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGVFTLENRVLATSVMKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHL
Query: HQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSP---ARSRSISQSHSPRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRS
+P +G G R SP +RS S+S SPR R +RSP ++ SP D +RSRSRS
Subjt: HQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSP---ARSRSISQSHSPRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRS
|
|
| Q1PDV2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL28 | 5.0e-27 | 42.8 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGV-----FTLENR
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTG F
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGV-----FTLENR
Query: VLATSVMKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLP--DGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGAR-DEYFSP-ARSRSISQSH
+ +++ + R I + E+ E G GD T +H + S S++ R D+ +SP RSRSIS+S
Subjt: VLATSVMKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLP--DGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGAR-DEYFSP-ARSRSISQSH
Query: SPRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI---------ARSRSRSL
PR+ R+Y N RSPRE + +RSRSRSL
Subjt: SPRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI---------ARSRSRSL
|
|
| Q8L3X8 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30 | 1.3e-11 | 33.02 | Show/hide |
Query: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSVMKEK
YSP RR RGR PR + RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G F +
Subjt: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSVMKEK
Query: LRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSISQSHSPR-------DRRD
+ + F R I + SE P+ V T +P G+RD +RSRSIS+S SPR R
Subjt: LRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSISQSHSPR-------DRRD
Query: YSRSPSPKENGRSPR
S SP+P+ G PR
Subjt: YSRSPSPKENGRSPR
|
|
| Q9LHP2 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL30A | 1.0e-11 | 34.85 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSV
R RSY+P SPPRG R P R R S R S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG F +
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSV
Query: MKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDE---YFSPARSRSISQSHSPRDRR-
K ++ + R + + E+ + TE ++ G P YS + R +R Y SP R S+S SP+DRR
Subjt: MKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDE---YFSPARSRSISQSHSPRDRR-
Query: --DYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRSILPFK
+ S S SP NG R R +S S R+ RS+ P K
Subjt: --DYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRSILPFK
|
|
| Q9SEU4 Serine/arginine-rich SC35-like splicing factor SCL33 | 3.5e-12 | 33.88 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSV
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG F +
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSV
Query: MKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQE--GLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSISQSHSPRD----
K + + R + + E+ + TE +E G D T + S ++R +Y+SP R +S SPR+
Subjt: MKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQE--GLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSISQSHSPRD----
Query: -RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSL-----RAVSRS
RR YSRSP+ +G R + R +SRSL R++SRS
Subjt: -RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSL-----RAVSRS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 2.5e-13 | 33.88 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSV
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG F +
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSV
Query: MKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQE--GLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSISQSHSPRD----
K + + R + + E+ + TE +E G D T + S ++R +Y+SP R +S SPR+
Subjt: MKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQE--GLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSISQSHSPRD----
Query: -RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSL-----RAVSRS
RR YSRSP+ +G R + R +SRSL R++SRS
Subjt: -RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSL-----RAVSRS
|
|
| AT1G55310.3 SC35-like splicing factor 33 | 3.2e-13 | 32.28 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGVFTLENRVLATSVMKEKL
R RSY+P SPPRG R P R R Y R P+ LLVRNL D R EDLR FE+FGPVKD+YLP++YYTG L T K
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGVFTLENRVLATSVMKEKL
Query: RKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQG-------------------WILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSI
F F + + +G L G + +V + +P + + S ++R +Y+SP R
Subjt: RKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQG-------------------WILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSI
Query: SQSHSPRD-----RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSL-----RAVSRS
+S SPR+ RR YSRSP+ +G R + R +SRSL R++SRS
Subjt: SQSHSPRD-----RRDYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSL-----RAVSRS
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 7.1e-13 | 34.85 | Show/hide |
Query: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSV
R RSY+P SPPRG R P R R S R S P+ LLVRNL D R EDLR PFE+FGPVKD+YLP++YYTG F +
Subjt: RSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSV
Query: MKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDE---YFSPARSRSISQSHSPRDRR-
K ++ + R + + E+ + TE ++ G P YS + R +R Y SP R S+S SP+DRR
Subjt: MKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDE---YFSPARSRSISQSHSPRDRR-
Query: --DYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRSILPFK
+ S S SP NG R R +S S R+ RS+ P K
Subjt: --DYSRSPSPKENGRSPREVDIARSRSRSLRAVSRSILPFK
|
|
| AT3G55460.1 SC35-like splicing factor 30 | 9.3e-13 | 33.02 | Show/hide |
Query: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSVMKEK
YSP RR RGR PR + RR + LLVRN+PLD RPE+LR PFERFGPV+DVY+P++YY+G F +
Subjt: YSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTG-----VFTLENRVLATSVMKEK
Query: LRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSISQSHSPR-------DRRD
+ + F R I + SE P+ V T +P G+RD +RSRSIS+S SPR R
Subjt: LRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLPDGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGARDEYFSPARSRSISQSHSPR-------DRRD
Query: YSRSPSPKENGRSPR
S SP+P+ G PR
Subjt: YSRSPSPKENGRSPR
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 3.5e-28 | 42.8 | Show/hide |
Query: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGV-----FTLENR
MAR RSRSRSYSPR R RSPPR RK YDD +R RE S RD S PSGLL+RNLPLDARP DLR FERFGP+KD+YLP+NYYTG F
Subjt: MARYRSRSRSYSPRRRSRSPPRGRKRYDDDPRDRHRESRSYRDRRSPAPSGLLVRNLPLDARPEDLRIPFERFGPVKDVYLPKNYYTGV-----FTLENR
Query: VLATSVMKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLP--DGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGAR-DEYFSP-ARSRSISQSH
+ +++ + R I + E+ E G GD T +H + S S++ R D+ +SP RSRSIS+S
Subjt: VLATSVMKEKLRKSIFFFRLICEIRISEHLAEATEGVLQEGLP--DGDIVLTHAHLHQPGLTQGWILFYSLIEHNSQNRGAR-DEYFSP-ARSRSISQSH
Query: SPRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI---------ARSRSRSL
PR+ R+Y N RSPRE + +RSRSRSL
Subjt: SPRDRRDYSRSPSPKENGRSPREVDI---------ARSRSRSL
|
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