; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0010667 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0010667
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1-like
Genome locationLG09:62389079..62394336
RNA-Seq ExpressionTan0010667
SyntenyTan0010667
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
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GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
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GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008450979.1 PREDICTED: transcription factor Pur-alpha 1 isoform X2 [Cucumis melo]7.2e-16197.03Show/hide
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XP_023531642.1 transcription factor Pur-alpha 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.0e-15996.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZP1 Uncharacterized protein3.2e-16297.69Show/hide
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A0A1S3BPW8 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X23.5e-16197.03Show/hide
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A0A6J1D0R2 transcription factor Pur-alpha 12.1e-15896.07Show/hide
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A0A6J1EUL9 transcription factor Pur-alpha 1-like7.3e-15996.07Show/hide
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A0A6J1HVP1 transcription factor Pur-alpha 1-like3.3e-15995.77Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha3.5e-1730.14Show/hide
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        L DD G                           +EE + L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha2.7e-1730.14Show/hide
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        L DD G                           +EE + L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q6PAC9 Transcriptional activator protein Pur-beta-A2.5e-1527.93Show/hide
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         L DD G     G          + +              L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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Q8AVS4 Transcriptional activator protein Pur-beta-B5.6e-1527.93Show/hide
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        G   GG +GG  G            EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  +    F D    +I          PE    
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                        + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++        R TI      NR  G++        + ++ +   LP Q   E  + LA
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         L DD G     G    +G +                   L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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Q9SKZ1 Transcription factor Pur-alpha 17.8e-12678.62Show/hide
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AT2G32080.2 purin-rich alpha 12.3e-12878.88Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTGCAAAACTCTGCAGGTGGAGCATAAGCTGTTCTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGCCGATATCTGAAGATTTCGGAGAAGACGTCGGCTACAAGGTCAACGA
TCATTGTTCCCTTCTCTGGGATTCCTTGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAGGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTCGACACAAAGGTG
TTTTACTTTGACATTGGCGAAAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCTGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCCGGAAGCAACCGGGA
TGAGGGATGGACCGCATTCAGAAACATTTTGGCAGAGATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTGAACATTCCGAACGTCTTGCCGGAC
TTTCAGACGATGTAGGTGCTGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAAACTGGTCCAACCTCTGACTTGAATGTAGACAGGCAAGTAGACTTGTCAGCTCAAGAGGAAATG
AGCAATCTGGGGGTATCAAAAGTTATCCGAGCTGATCAGAAGAGATTCTTTTTCGATCTCGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTCTTGAGGATATCTGAGGTTGCAGGGGC
AGATCGTTCTTCGATCATTCTCCCATTGTCGGGGCTTAAGCAGTTTTATGAAATAGTGGGACATTTTGTGGAGATCACAAAAGACAGGATTGAAGGAATGACAGGTGTGA
ATGTTAGGACCGTGGATCCGCCTCAGAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGCCATTGGCCACTGCAATCAGAAAGCCCAGTCTTTGACCGAAAATTGACTTCGAAGATTGTCAATATTACCATACAGTGCCGGTAACACAGGTATAGGACTCTGTGAA
AATCTTCTTCGAAAATTGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCATTGTCGTTTAATTTCCATTTCCAACAGTTAAAAAGCAAAAAAATCCCATCACAAATCGTTGATGTGAT
CTTTTTTCCCAACCCTAATTTTGCAGAATCCCCCTTTTCTCTCTCTCGCTCTCTCACTCTCTCTCATGGGGCTCACTTCTTAGATCTGCCATCTCTAGGTTTCTGCTTCG
TTTCTGTTATCGTGTTTGTCTTGAAGGCATTTGGCGGGTTTTTTCGTCGATTTCTGTTCGAATCAGGGCTCGTTCGCTTCAATTTCTGTGGGTTTTATTTGTTTGTTGTT
TTTTTTTGTATACCCAATTGGCGTAGGGAAGAGATAAGAGATGCCGATTATTTGAATCAAAATTCTGACGCCGAAATCGTGGGGAATTATAAGTAGAATCCGATTCAGAG
CTGGGAGTGGGAGATGGAGGGGAATTCCGGCGGAGGTGGAGTGGGAATTGGGGGAACGGCGGCGGGCGGCGTGGCGGCGGGAGGAGTGACGGGCGGCGGCGGAGGGAATG
ACGTTGAGTTGATGTGCAAAACTCTGCAGGTGGAGCATAAGCTGTTCTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGCCGATATCTGAAGATTTCGGAGAAGACGTCGGCT
ACAAGGTCAACGATCATTGTTCCCTTCTCTGGGATTCCTTGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAGGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCT
CGACACAAAGGTGTTTTACTTTGACATTGGCGAAAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCTGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCCG
GAAGCAACCGGGATGAGGGATGGACCGCATTCAGAAACATTTTGGCAGAGATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTGAACATTCCGAA
CGTCTTGCCGGACTTTCAGACGATGTAGGTGCTGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAAACTGGTCCAACCTCTGACTTGAATGTAGACAGGCAAGTAGACTTGTCAGC
TCAAGAGGAAATGAGCAATCTGGGGGTATCAAAAGTTATCCGAGCTGATCAGAAGAGATTCTTTTTCGATCTCGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTCTTGAGGATATCTG
AGGTTGCAGGGGCAGATCGTTCTTCGATCATTCTCCCATTGTCGGGGCTTAAGCAGTTTTATGAAATAGTGGGACATTTTGTGGAGATCACAAAAGACAGGATTGAAGGA
ATGACAGGTGTGAATGTTAGGACCGTGGATCCGCCTCAGAGATGAACTATATATATGGCCCCGGGGTTTGTGTTCCAAGTCTGAATAATCCATCCTGCTAGATTAGCAGA
GGCTATGGAAAATGCTTGAGAAGCTTAATTCTTCTTCTTCCATGAATAACAAAAAGAGAGAGGGGAAAGAGATGGCTTGTAATTGTCACTTTATAATAATGGTGAGTTCA
GGTGTGTTTTGTTTATTTCAGCTGCATTGCAATTACCAATGATGCTTTGTTAGAAAGTTCACTGACTGTTACTGTAGCTTCTGGAGAGAGGGTTTCAGTTTTAGGATTTT
ACAAAAGACCATTGGTTGAGTTGTGGACTGAAATGTAGATAATTTTTCATTTTGAAAACATATTGCATCTGTTTTTTTTTTTTTTAGTTCAATCCTATCTAGATATGGAG
ATTCGAGTCTCTAACTTTTTGTTTAGAAATGTCTTATTCTGTTAAACTATACTCAGGTTGACTATGTTTAGAAATGTCTTTTTCAGTTAAACTATACTCAGGTTGACTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEGNSGGGGVGIGGTAAGGVAAGGVTGGGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEVFSKELQLDTKV
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SNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR