| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| XP_004135834.1 probable histone H2A variant 3 isoform X2 [Cucumis sativus] | 1.8e-63 | 99.25 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_010033915.1 probable histone H2A variant 3 [Eucalyptus grandis] | 3.1e-63 | 99.25 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSASN+KDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_022152569.1 probable histone H2A variant 3 [Momordica charantia] | 8.1e-64 | 100 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_022953233.1 probable histone H2A variant 3 [Cucurbita moschata] | 1.8e-63 | 99.25 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| XP_031406453.1 probable histone H2A variant 3 [Punica granatum] | 2.9e-61 | 98.51 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA NKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K6F6 Histone H2A | 8.7e-64 | 99.25 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A5D3CH66 Histone H2A | 8.7e-64 | 99.25 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSA+NNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1DGE3 Histone H2A | 3.9e-64 | 100 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1GMV1 Histone H2A | 8.7e-64 | 99.25 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| A0A6J1JQN2 Histone H2A | 8.7e-64 | 99.25 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLK+RVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O23628 Histone H2A variant 1 | 9.0e-58 | 84.56 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +A+ +KDKDKKKP+SRS+RAG+QFPVGR+HRQLK+RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q84MP7 Probable histone H2A variant 3 | 1.3e-56 | 86.13 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSA---SNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQ
M+GKG KGL+ K+ S KDK KK PVSRSSRAGLQFPVGR+HRQLK R ANGRVGATAAVY+AAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQ
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSA---SNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQ
Query: LAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
LAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
Subjt: LAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q8H7Y8 Probable histone H2A variant 1 | 1.3e-56 | 86.23 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSA---SNNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHL
M+GKG KGL+ K+ S +KDKDKKK PVSRSSRAGLQFPVGR+HRQLKSR +A+GRVGATAAVY+AAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHL
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSA---SNNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHL
Query: QLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
QLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK+SKE
Subjt: QLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q8S857 Probable histone H2A variant 2 | 9.9e-57 | 84.89 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKS----ASNNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRH
M+GKG KGL+ K+ A+ +KDKD+KK PVSRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+ANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRH
Subjt: MSGKGAKGLIMGKS----ASNNKDKDKKK-PVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRH
Query: LQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
LQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: LQLAIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Q9C944 Probable histone H2A variant 3 | 5.6e-60 | 89.55 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGK + ++KDKDKKKP++RSSRAGLQFPVGRVHR LK+R A+GRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRI+PRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKS+KE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G52740.1 histone H2A protein 9 | 4.0e-61 | 89.55 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
MSGKGAKGLIMGK + ++KDKDKKKP++RSSRAGLQFPVGRVHR LK+R A+GRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRI+PRHLQLAI
Subjt: MSGKGAKGLIMGKSASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQLAI
Query: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKS+KE
Subjt: RGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.1 histone H2A 8 | 5.1e-56 | 82.35 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +A+ NKD KKK +SRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.2 histone H2A 8 | 5.1e-56 | 82.35 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +A+ NKD KKK +SRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT2G38810.3 histone H2A 8 | 5.1e-56 | 82.35 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +A+ NKD KKK +SRSSRAG+QFPVGR+HRQLK RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSL+NK +K+
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
| AT3G54560.1 histone H2A 11 | 6.4e-59 | 84.56 | Show/hide |
Query: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
M+GKG KGL+ K +A+ +KDKDKKKP+SRS+RAG+QFPVGR+HRQLK+RV+A+GRVGATAAVYTA+ILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Subjt: MSGKGAKGLIMGK--SASNNKDKDKKKPVSRSSRAGLQFPVGRVHRQLKSRVAANGRVGATAAVYTAAILEYLTAEVLELAGNASKDLKVKRITPRHLQL
Query: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINK++KE
Subjt: AIRGDEELDTLIKGTIAGGGVIPHIHKSLINKSSKE
|
|
