; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0011050 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0011050
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionIsoleucine--tRNA ligase
Genome locationLG08:71577707..71581600
RNA-Seq ExpressionTan0011050
SyntenyTan0011050
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137799.1 uncharacterized protein LOC101211971 [Cucumis sativus]7.3e-6486.71Show/hide
Query:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY
        ML+GTIIAPRSFFSRNKQK    S SS SSSSSS         SPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSP+KY
Subjt:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY

Query:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        VSWNPRRS+YPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+I+TFLLVYTILAPINK
Subjt:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
XP_008442626.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486442 [Cucumis melo]1.4e-6285.44Show/hide
Query:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY
        ML+GTIIAPRSFFS NK+KSSS SSSS SSS            SPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKT+FSDFSPDKY
Subjt:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY

Query:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        VSWNPRRS+YPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+I+ FLLVYTILAPINK
Subjt:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
XP_022145494.1 uncharacterized protein LOC111014931 [Momordica charantia]7.8e-6688.46Show/hide
Query:  IGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKYVS
        IGTIIAP SFFSRNKQKSSS      S SSSSSSSSS YNCSPV+PLC GRRPKDP KDDDNDDQTRDK STDWDKAWSKF+KRGKKT+FSDFSPDKYVS
Subjt:  IGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKYVS

Query:  WNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        WNPRRS+YPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+IVTFLLVYTILAPINK
Subjt:  WNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
XP_022983966.1 uncharacterized protein LOC111482428 [Cucurbita maxima]7.6e-6179.75Show/hide
Query:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY
        MLIGT+IAPR FFSRNKQK               SS+SS ++ SPV+PLCSGRRP+DPRKDDDNDDQ RDK STDWDKAWSKF+KRGKKT+FSDFSP+KY
Subjt:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY

Query:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        VSWNPRRS+YPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+IVTFLLVYTILAPINK
Subjt:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
XP_038906326.1 uncharacterized protein LOC120092168 [Benincasa hispida]1.1e-6488.61Show/hide
Query:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY
        MLIGTIIAPRSFFSRNKQK         SSSSSSSSSSS    SPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKF+KRGKKT+FSDFSP+KY
Subjt:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY

Query:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+IVTFLLVYTILAPINK
Subjt:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAB4 Uncharacterized protein3.5e-6486.71Show/hide
Query:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY
        ML+GTIIAPRSFFSRNKQK    S SS SSSSSS         SPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSP+KY
Subjt:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY

Query:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        VSWNPRRS+YPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+I+TFLLVYTILAPINK
Subjt:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
A0A1S3B6W3 uncharacterized protein LOC1034864426.7e-6385.44Show/hide
Query:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY
        ML+GTIIAPRSFFS NK+KSSS SSSS SSS            SPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKT+FSDFSPDKY
Subjt:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY

Query:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        VSWNPRRS+YPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+I+ FLLVYTILAPINK
Subjt:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
A0A6J1CVE7 uncharacterized protein LOC1110149313.8e-6688.46Show/hide
Query:  IGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKYVS
        IGTIIAP SFFSRNKQKSSS      S SSSSSSSSS YNCSPV+PLC GRRPKDP KDDDNDDQTRDK STDWDKAWSKF+KRGKKT+FSDFSPDKYVS
Subjt:  IGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKYVS

Query:  WNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        WNPRRS+YPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+IVTFLLVYTILAPINK
Subjt:  WNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
A0A6J1F162 uncharacterized protein LOC111441439 isoform X19.0e-6079.75Show/hide
Query:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY
        MLIGT+IAPR FFSRNK KSS+ S SS                SP +PLCSGRRP+DPRKDDDNDDQ RDK STDWDKAWSKF+KRGKKT+FSDFSP+KY
Subjt:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY

Query:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+IVTFLLVYTILAPINK
Subjt:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
A0A6J1J3V4 uncharacterized protein LOC1114824283.7e-6179.75Show/hide
Query:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY
        MLIGT+IAPR FFSRNKQK               SS+SS ++ SPV+PLCSGRRP+DPRKDDDNDDQ RDK STDWDKAWSKF+KRGKKT+FSDFSP+KY
Subjt:  MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKY

Query:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
        VSWNPRRS+YPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTL GAI+IVTFLLVYTILAPINK
Subjt:  VSWNPRRSDYPLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53470.1 unknown protein9.3e-3359.56Show/hide
Query:  SSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKYVSWNPRRSDYPLSEEVDPIK
        S   SS+    +   SSSS + CS   P         PRK ++++    DK STDWDKAW  FKK+ KK++FS F+ DKYV+WNP RS++ LSEEVDPIK
Subjt:  SSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKYVSWNPRRSDYPLSEEVDPIK

Query:  RTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPI
        RTERSNLMLWTSPRFTLVGAI+IV+FLL+YTILAP+
Subjt:  RTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPI
AT3G53470.2 unknown protein1.0e-3159.85Show/hide
Query:  SSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRK-DDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKYVSWNPRRSDYPLSEEVDPI
        S   SS+    +   SSSS + CS   P         PRK ++ N     DK STDWDKAW  FKK+ KK++FS F+ DKYV+WNP RS++ LSEEVDPI
Subjt:  SSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRK-DDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKYVSWNPRRSDYPLSEEVDPI

Query:  KRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPI
        KRTERSNLMLWTSPRFTLVGAI+IV+FLL+YTILAP+
Subjt:  KRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPI

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTAATCGGAACTATAATCGCACCTCGTAGCTTTTTCTCGAGAAACAAACAAAAATCATCTTCGCCCTCATCGTCATCGTTTTCTTCCTCGTCTTCTTCCTCGTCTTC
TTCTTCTGCATATAACTGCTCGCCGGTGATTCCTCTGTGCTCGGGGAGAAGGCCTAAAGATCCGCGAAAAGACGACGATAATGATGACCAGACACGTGATAAGCTCTCAA
CAGATTGGGACAAGGCTTGGTCGAAGTTCAAAAAGCGAGGAAAAAAGACGATGTTCTCTGATTTCTCGCCCGACAAATACGTAAGCTGGAATCCGCGAAGATCAGATTAT
CCTTTGTCTGAAGAAGTAGATCCCATAAAAAGAACAGAGAGATCAAACCTGATGCTGTGGACTAGTCCAAGATTTACACTAGTAGGTGCAATTATAATTGTCACATTCTT
GTTGGTCTATACAATTCTTGCACCAATTAATAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGACGAACTGAGAGGTGGCCAGTCAGGTTGGTGGATCGGTGGATGCAGACCAGGGTCGAATTCCTTGTTTCAATCTGGAATTGGAATCCTCGCCGCGATGCTAATCGGAA
CTATAATCGCACCTCGTAGCTTTTTCTCGAGAAACAAACAAAAATCATCTTCGCCCTCATCGTCATCGTTTTCTTCCTCGTCTTCTTCCTCGTCTTCTTCTTCTGCATAT
AACTGCTCGCCGGTGATTCCTCTGTGCTCGGGGAGAAGGCCTAAAGATCCGCGAAAAGACGACGATAATGATGACCAGACACGTGATAAGCTCTCAACAGATTGGGACAA
GGCTTGGTCGAAGTTCAAAAAGCGAGGAAAAAAGACGATGTTCTCTGATTTCTCGCCCGACAAATACGTAAGCTGGAATCCGCGAAGATCAGATTATCCTTTGTCTGAAG
AAGTAGATCCCATAAAAAGAACAGAGAGATCAAACCTGATGCTGTGGACTAGTCCAAGATTTACACTAGTAGGTGCAATTATAATTGTCACATTCTTGTTGGTCTATACA
ATTCTTGCACCAATTAATAAGTGATTTTTTCTGGGGTATTATTGAAGTTTCTGGTCCTAACTATCTTCTTCTTCTAATGATGTTAATGATTGTAAAAATGGGGGATTCAG
TTGAGGAAGGTCTGTAAATTTGTTTGGAAATTCAATGGAATTTGGGTTTTCTGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLIGTIIAPRSFFSRNKQKSSSPSSSSFSSSSSSSSSSSAYNCSPVIPLCSGRRPKDPRKDDDNDDQTRDKLSTDWDKAWSKFKKRGKKTMFSDFSPDKYVSWNPRRSDY
PLSEEVDPIKRTERSNLMLWTSPRFTLVGAIIIVTFLLVYTILAPINK