; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0011181 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0011181
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description30S ribosomal protein S11, chloroplastic
Genome locationContig00034:103305..103808
RNA-Seq ExpressionTan0011181
SyntenyTan0011181
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR019981 - Ribosomal protein S11, bacterial-type
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AHM89651.1 ribosomal protein S11 [Lagenaria siceraria]2.3e-69100Show/hide
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YP_009753907.1 ribosomal protein S11 [Trichosanthes lobata]5.0e-6999.28Show/hide
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A0A1S4EU37 30S ribosomal protein S11, chloroplastic1.1e-69100Show/hide
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A0A249RZ89 30S ribosomal protein S11, chloroplastic1.1e-69100Show/hide
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A0A410HFC3 30S ribosomal protein S11, chloroplastic1.1e-69100Show/hide
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A0A6M3RVL4 30S ribosomal protein S11, chloroplastic1.1e-69100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0ZZ68 30S ribosomal protein S11, chloroplastic4.7e-7095.65Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein6.7e-1136.97Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S111.0e-6792.75Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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