; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0011217 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0011217
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionlate embryogenesis abundant protein-like
Genome locationLG05:13924577..13925858
RNA-Seq ExpressionTan0011217
SyntenyTan0011217
Gene Ontology termsGO:0009414 - response to water deprivation (biological process)
GO:0009631 - cold acclimation (biological process)
GO:0009737 - response to abscisic acid (biological process)
InterPro domainsIPR000167 - Dehydrin
IPR030513 - Dehydrin, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004150075.1 embryogenic cell protein 40 [Cucumis sativus]3.0e-4873.1Show/hide
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        DDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAG T EH++STT T+T  VEH E GKKGVMEKI+EKLPGHH
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XP_008460975.1 PREDICTED: late embryogenesis abundant protein-like [Cucumis melo]1.1e-4772.29Show/hide
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        MANVRDEHGNPVQLTDE GNPVQLTDEFGNPMHLTG V TT SKL+P   P  +  T     + G +V QTQ   E H+ SPRR  SSSSSSSSSEDDGQ
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Query:  GGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
        GGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKE G   H  + T T+   VEHQE GKKGVMEKI+EKLPGHH
Subjt:  GGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

XP_022986610.1 late embryogenesis abundant protein-like [Cucurbita maxima]1.5e-4763.46Show/hide
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        MANVRDE GNPVQLTDE GNPVQLTDEFGNP+ LTGVATT S                           +P+ N             P GV+TTGS+  S
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Query:  SGGD-VGQTQLVPE-HNGSPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATE----HYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKI
        SGGD VG+TQ + E H+ S  R  SSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLT  GKHKEAG T     H+QSTTVTSTVDVEHQEHGKKGV+EKI
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Query:  REKLPGHH
        +EKLPGHH
Subjt:  REKLPGHH

XP_038902143.1 embryogenic cell protein 40-like isoform X1 [Benincasa hispida]6.5e-5177.06Show/hide
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        MANVRDEHGNPVQLTDE GNPVQLTDEFGNPMHLTG VAT+ SKL+     P VS T   +    +G DV QTQL  E H+GSPRR  SSSSSSSSSEDD
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Query:  GQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGAT--EHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
        GQGG RRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAG T  EH+QSTTVT T  VEHQEHGKKGVMEKI+E+LPGHH
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XP_038902144.1 late embryogenesis abundant protein-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.9e-5074.01Show/hide
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        L  R+L   MANVRDEHGNPVQLTDE GNPVQLTDEFGNPMHLTG VAT+ SKL+     P           +G DV QTQL  E H+GSPRR  SSSSS
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Query:  SSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGAT--EHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
        SSSSEDDGQGG RRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAG T  EH+QSTTVT T  VEHQEHGKKGVMEKI+E+LPGHH
Subjt:  SSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGAT--EHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPB7 Uncharacterized protein1.5e-4873.1Show/hide
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        MANVRDEHGNPVQLTDE GNPVQLTDEFGNPM LTG V TT S L P     ++P  V+TTG        +V QTQ   E H+ SPRR  SSSSSSSSSE
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        DDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAG T EH++STT T+T  VEH E GKKGVMEKI+EKLPGHH
Subjt:  DDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGAT-EHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

A0A1S3CDP4 late embryogenesis abundant protein-like5.5e-4872.29Show/hide
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        MANVRDEHGNPVQLTDE GNPVQLTDEFGNPMHLTG V TT SKL+P   P  +  T     + G +V QTQ   E H+ SPRR  SSSSSSSSSEDDGQ
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Query:  GGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
        GGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKE G   H  + T T+   VEHQE GKKGVMEKI+EKLPGHH
Subjt:  GGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

A0A6J1CYY9 late embryogenesis abundant protein-like4.0e-4669.89Show/hide
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        MA+VRDE GNP+QLTDE GNPV+LTDEFGNPMHLTGVAT  SK                LES+GGDVGQTQL+    P+  GSPRR  S+SSSSSSSEDD
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Query:  GQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHK--EAGATEHYQSTTV----TSTVDVE--HQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
        GQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHK   A A   +Q TTV    TSTVDVE  HQ+  KKGVMEKIREKLPGHH
Subjt:  GQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHK--EAGATEHYQSTTV----TSTVDVE--HQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

A0A6J1FTT6 late embryogenesis abundant protein-like1.6e-4762.38Show/hide
Query:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLTDEFGNPMHLTGVATTESK-------------------------LEPIVN-------------PPGVSTTGSQLES
        MANVRDE GNPVQLTDE GNPVQLTDEFGNP+ LTGVATT S+                           P+ N             P GV+TTGS+  S
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Query:  SGGD-VGQTQLVPE-HNGSPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATE------HYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVME
        SGGD VG+TQ + E H+ S  R  SSSSSSSSSEDDGQGGRR+KKKGLTQKIKEKLT  GKHKEAG T       H+QSTTVTSTVDVEHQEHGKKGV+E
Subjt:  SGGD-VGQTQLVPE-HNGSPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATE------HYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVME

Query:  KIREKLPGHH
        KI+EKLPGHH
Subjt:  KIREKLPGHH

A0A6J1JEI1 late embryogenesis abundant protein-like7.2e-4863.46Show/hide
Query:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLTDEFGNPMHLTGVATTESK-------------------------LEPIVN-------------PPGVSTTGSQLES
        MANVRDE GNPVQLTDE GNPVQLTDEFGNP+ LTGVATT S                           +P+ N             P GV+TTGS+  S
Subjt:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLTDEFGNPMHLTGVATTESK-------------------------LEPIVN-------------PPGVSTTGSQLES

Query:  SGGD-VGQTQLVPE-HNGSPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATE----HYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKI
        SGGD VG+TQ + E H+ S  R  SSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLT  GKHKEAG T     H+QSTTVTSTVDVEHQEHGKKGV+EKI
Subjt:  SGGD-VGQTQLVPE-HNGSPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATE----HYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKI

Query:  REKLPGHH
        +EKLPGHH
Subjt:  REKLPGHH

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P21298 Late embryogenesis abundant protein3.8e-3048.63Show/hide
Query:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLTDEFGNPMHLTGVATTESKLEPIVN-----------PPGVS--TTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGS--PRRSSS
        MA+++DE GNP+ LTD +GNPVQL+DEFGNPMH+TGVA++  + +  V            P GV+  T  +   ++G    +T    EH+GS       S
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Query:  SSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKE----AGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
         SSSSSSSEDDGQGGRR  KK +  KIK+KL G GKHK+      AT    +TT T+T     Q H KKG++EKI+EKLPGHH
Subjt:  SSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKE----AGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

P25863 Dehydrin Xero 11.9e-1348.09Show/hide
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        +G   T  +L+   N P  +TTG+      G  G    V E  G S     S SSSSSSSEDDG GGRRRKKKG+T+KIKEKL G   H ++  T    S
Subjt:  TGVATTESKLEPIVNPPGVSTTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNG-SPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQS

Query:  TTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
        TT        H  H KKG+MEKI+EKLPG H
Subjt:  TTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

P30287 Dehydrin Rab252.1e-1249.18Show/hide
Query:  EPIVNPPGVSTTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGSPRRS-SSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVE
        E  V+  GV+    QL+ +  + G T L      + RRS  SSSSSSSSSEDDGQGG RRKKK + +KIKEKL GS K +E     H      T T    
Subjt:  EPIVNPPGVSTTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGSPRRS-SSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVE

Query:  HQ--EHGKKGVMEKIREKLPGH
        H   +H KKG++EKI+EKLPGH
Subjt:  HQ--EHGKKGVMEKIREKLPGH

Q07322 Embryogenic cell protein 403.7e-1731.91Show/hide
Query:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLTDEFGNPMHLTGVATT--------------------ESKLEPI---------------------------VNPPGV
        MA++RDE GNP+QLTD+ GNPVQLTDE+GNP+H+TGVATT                     + L  +                           V P GV
Subjt:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLTDEFGNPMHLTGVATT--------------------ESKLEPI---------------------------VNPPGV

Query:  --------STTG--------SQLESSG----------------------GDVGQTQ------------------------------------------LV
                +TTG         Q    G                      G +GQT                                             
Subjt:  --------STTG--------SQLESSG----------------------GDVGQTQ------------------------------------------LV

Query:  PEHNGSPRRSSS-------SSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVT------STVDVEHQEHGKKGVMEKIREKL
          H+ +P + ++       S+SSSSSSEDDGQGGRR  KKG T KIKEKL G GKHK+   T    + T T      + V VEH EH KK +++KI++KL
Subjt:  PEHNGSPRRSSS-------SSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVT------STVDVEHQEHGKKGVMEKIREKL

Query:  PGHH
        PGHH
Subjt:  PGHH

Q96261 Probable dehydrin LEA1.4e-2444.92Show/hide
Query:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNP-VQLTDEFGNPMHLTGV-------------------ATTESKLEPIVNPPGV-STTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGS
        MA++RDE GNP+ LTD  GNP V LTDE GNPM+LTGV                    +T  +  P   P G  + T +         G T    +H+GS
Subjt:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNP-VQLTDEFGNPMHLTGV-------------------ATTESKLEPIVNPPGV-STTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGS

Query:  --PRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
               S SSSSSSSEDDGQGGRR  KK + +KIKEK  GSGKHK+    E   +T  T+      Q H KKG++EKI++KLPGHH
Subjt:  --PRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G21490.1 dehydrin LEA1.0e-2544.92Show/hide
Query:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNP-VQLTDEFGNPMHLTGV-------------------ATTESKLEPIVNPPGV-STTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGS
        MA++RDE GNP+ LTD  GNP V LTDE GNPM+LTGV                    +T  +  P   P G  + T +         G T    +H+GS
Subjt:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNP-VQLTDEFGNPMHLTGV-------------------ATTESKLEPIVNPPGV-STTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGS

Query:  --PRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
               S SSSSSSSEDDGQGGRR  KK + +KIKEK  GSGKHK+    E   +T  T+      Q H KKG++EKI++KLPGHH
Subjt:  --PRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

AT3G50980.1 dehydrin xero 11.4e-1448.09Show/hide
Query:  TGVATTESKLEPIVNPPGVSTTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNG-SPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQS
        +G   T  +L+   N P  +TTG+      G  G    V E  G S     S SSSSSSSEDDG GGRRRKKKG+T+KIKEKL G   H ++  T    S
Subjt:  TGVATTESKLEPIVNPPGVSTTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNG-SPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQS

Query:  TTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
        TT        H  H KKG+MEKI+EKLPG H
Subjt:  TTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

AT4G39130.1 Dehydrin family protein3.4e-1338.95Show/hide
Query:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLTDEFGNPMHLTGVATTESKLE--------PIVNPPGVSTTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGSPRRSSSSSSSSSS
        MA+++DE GNP+ LTD  G P QL DEFGN MHLTGVATT   L+        PI  P  V+TT +   +    V    L  +H+            +SS
Subjt:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLTDEFGNPMHLTGVATTESKLE--------PIVNPPGVSTTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGSPRRSSSSSSSSSS

Query:  SEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH
        +E++G+G  R  K  +T + K KL   G  K + AT      T + +  V    H KKG  +KI+EKL GHH
Subjt:  SEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH

AT5G66400.1 Dehydrin family protein6.3e-1238.86Show/hide
Query:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLT-DEFGNPMHLTGVATTESKLEPIVNPPGVST----------------------TGSQLESSGGDV---GQTQLVP
        MA+ ++  G   Q TDE+GNP+Q   DE+GNPM   G  T            G  T                      TG++   +GG     GQ QL  
Subjt:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLT-DEFGNPMHLTGVATTESKLEPIVNPPGVST----------------------TGSQLESSGGDV---GQTQLVP

Query:  EHNG--SPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDV---EHQEHGKKGVMEKIREKLPG
        E  G        S S SSSSSEDDGQGGRR  KKG+TQKIKEKL   G H ++G  +      + S  D      + H KKG+M+KI+EKLPG
Subjt:  EHNG--SPRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDV---EHQEHGKKGVMEKIREKLPG

AT5G66400.2 Dehydrin family protein9.1e-1138.02Show/hide
Query:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLT-DEFGNPMHLTGVATTESKLEPIVNPPGVST----------------------TGSQLESSGGDV---GQTQLVP
        MA+ ++  G   Q TDE+GNP+Q   DE+GNPM   G  T            G  T                      TG++   +GG     GQ QL  
Subjt:  MANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLT-DEFGNPMHLTGVATTESKLEPIVNPPGVST----------------------TGSQLESSGGDV---GQTQLVP

Query:  EHNGS-PRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDV---EHQEHGKKGVMEKIREKLPG
        E  G        S S SSSS DDGQGGRR  KKG+TQKIKEKL   G H ++G  +      + S  D      + H KKG+M+KI+EKLPG
Subjt:  EHNGS-PRRSSSSSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDV---EHQEHGKKGVMEKIREKLPG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGCTATAGCTGTCGTTTCAACTCTATCTTCAGAAAACCAAATTTCCTTCATCATCGTCTTCTCAAACTTAAAATGGCGAATGTACGTGATGAGCATGGGAACCCGGT
CCAGCTGACCGACGAATGGGGGAACCCGGTTCAGTTGACTGATGAATTCGGCAACCCCATGCACCTCACCGGTGTTGCCACCACCGAGTCCAAGCTCGAGCCGATTGTTA
ACCCCCCCGGAGTTTCCACCACAGGGTCCCAGCTCGAGTCCAGTGGTGGTGATGTGGGTCAGACGCAGCTCGTTCCGGAGCACAACGGCTCGCCCCGTCGGTCCAGCAGC
TCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCTCGGAGGACGACGGTCAAGGCGGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGGGACTAACACAGAAGATAAAGGAGAAGTTAACGGGAAGCGGAAAACA
CAAGGAGGCGGGAGCGACGGAGCACTACCAGAGCACCACCGTGACGTCGACGGTTGACGTCGAACATCAAGAACATGGGAAGAAGGGAGTTATGGAGAAGATTAGAGAGA
AATTGCCAGGCCACCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAGATCAGAAACGACAATGAGCTATAGCTGTCGTTTCAACTCTATCTTCAGAAAACCAAATTTCCTTCATCATCGTCTTCTCAAACTTAAAATGGCGAATGTACGTGA
TGAGCATGGGAACCCGGTCCAGCTGACCGACGAATGGGGGAACCCGGTTCAGTTGACTGATGAATTCGGCAACCCCATGCACCTCACCGGTGTTGCCACCACCGAGTCCA
AGCTCGAGCCGATTGTTAACCCCCCCGGAGTTTCCACCACAGGGTCCCAGCTCGAGTCCAGTGGTGGTGATGTGGGTCAGACGCAGCTCGTTCCGGAGCACAACGGCTCG
CCCCGTCGGTCCAGCAGCTCCAGCTCCAGCTCCAGCTCCTCGGAGGACGACGGTCAAGGCGGGAGGAGGAGGAAGAAGAAGGGACTAACACAGAAGATAAAGGAGAAGTT
AACGGGAAGCGGAAAACACAAGGAGGCGGGAGCGACGGAGCACTACCAGAGCACCACCGTGACGTCGACGGTTGACGTCGAACATCAAGAACATGGGAAGAAGGGAGTTA
TGGAGAAGATTAGAGAGAAATTGCCAGGCCACCATTGATCTCAAAATCACCATCAAAAAGCTTCGGAGATTTCTAGTGTCCCATTATTATGGAAGCTTTATTTTACACAA
TGTTGTCTCTGGCTCTGTATTTGTGTGTGTTTATGAGTTTGCTGTGCGTTTAAGATTTGAGACCCCCCCCCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSYSCRFNSIFRKPNFLHHRLLKLKMANVRDEHGNPVQLTDEWGNPVQLTDEFGNPMHLTGVATTESKLEPIVNPPGVSTTGSQLESSGGDVGQTQLVPEHNGSPRRSSS
SSSSSSSSEDDGQGGRRRKKKGLTQKIKEKLTGSGKHKEAGATEHYQSTTVTSTVDVEHQEHGKKGVMEKIREKLPGHH