; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0011267 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0011267
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationLG01:15626614..15634123
RNA-Seq ExpressionTan0011267
SyntenyTan0011267
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein6.9e-10597.51Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X16.9e-10597.01Show/hide
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A0A6J1C4U5 ras-related protein RABD11.3e-10396.52Show/hide
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A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like3.4e-10496.52Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like3.4e-10496.52Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P40392 Ras-related protein RIC12.1e-8778.71Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM27.4e-8880.2Show/hide
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Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b6.9e-8678.61Show/hide
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c2.1e-8779.1Show/hide
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD11.4e-9182.44Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 56.4e-8777.72Show/hide
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E1.3e-6358.65Show/hide
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        +  I+++A+DSV K+LVGNK D+ E+K  V T   +A ADE GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+ +    T ++  G ++I  Q          
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         +KS+CCS
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein1.0e-9282.44Show/hide
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C1.5e-8879.1Show/hide
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A4.9e-8778.61Show/hide
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Query:  S
        S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCTAATGACAGTGTATGCAAGCTTTTAGTTGGGAATAAGTGTGATTTAGTTGAGAACAAGGTTGTTGACACGCAGACAGCAAAGGCATTTGCAGACGAGCTTGGAATCCC
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CGCCAGTTTCAAATACGTGTCAGGATGAGCGATGGCGATGGTTCGATGTATTATACCTTTGAACTGGAGATGTGTTTTCGTTACATCTACCATGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LRWSDKSYFGDLPKQKTLRRCLGWDIASLGVTEGTYASFKYVSG