; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0011354 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0011354
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionprotein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2-like
Genome locationLG04:11095957..11097006
RNA-Seq ExpressionTan0011354
SyntenyTan0011354
Gene Ontology termsGO:0010468 - regulation of gene expression (biological process)
InterPro domainsIPR039349 - Protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601371.1 Protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-7080.81Show/hide
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XP_004135230.1 protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]3.9e-7180Show/hide
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XP_008446243.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103489034 isoform X1 [Cucumis melo]1.1e-7381.76Show/hide
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XP_022151033.1 protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2-like [Momordica charantia]1.9e-7382.63Show/hide
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XP_038891536.1 protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic-like [Benincasa hispida]4.9e-7482.94Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BEK8 uncharacterized protein LOC103489034 isoform X15.3e-7481.76Show/hide
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A0A5A7SZ04 Uncharacterized protein5.3e-7481.76Show/hide
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A0A6J1DB25 protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2-like9.0e-7482.63Show/hide
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A0A6J1GYK9 protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic-like isoform X11.5e-6879.77Show/hide
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A0A6J1JDH3 protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic-like isoform X16.1e-7080.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B6UFC7 Protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic2.7e-2745.16Show/hide
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Q6H612 Protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic8.8e-2650Show/hide
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        Y +PDPIPEFA  ET KFKE +  +L + ++  FG  ++ +V+VC++I G +L  +Y GPGTLLV PF +M   + ER LPGAP AAR +I WA+ N+D 
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        DWK W  +
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Q9XIK0 Protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic2.9e-2956.6Show/hide
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        A+Y +PDPIPEFAE ET KF++ +  KL+K R+ F + +D +V VC++IF  +L  EYGGPGTLLV PF +M   LNER+LPG P AAR +I WAQ+++D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G10522.1 unknown protein2.1e-3056.6Show/hide
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         DWK W
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AT1G10522.2 unknown protein2.1e-3056.6Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGCTCTATGGTTGCGCTCTGGTATCGGCCACTGCCATTTCTCCCGCCAAGATCTCACGTTTTAACGGTCTTCTTCATCGAACATTTTCCCCTTTCCCTTCCCTCGT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALYGCALVSATAISPAKISRFNGLLHRTFSPFPSLVKLFVNCSLTSSFSYRATPIPAKYVYPDPIPEFAEVETRKFKEELSKKLAKDRETFGNDLDSVVEVCSKIFGEY
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