CuGenDBv2

Gene ID	Tan0011591
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	ThiF domain-containing protein
Genome location	LG05:6972562..6972954
RNA-Seq Expression	Tan0011591
Synteny	Tan0011591
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

PON83836.1 hypothetical protein TorRG33x02_203870 [Trema orientale]

6.1e-24

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XP_022944248.1 uncharacterized protein LOC111448755 [Cucurbita moschata]

2.2e-42

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XP_022986202.1 uncharacterized protein LOC111484017 [Cucurbita maxima]

5.8e-43

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XP_023513131.1 uncharacterized protein LOC111777660 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.1e-44

76.15

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XP_038902395.1 uncharacterized protein LOC120089036 [Benincasa hispida]

1.6e-45

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A2P5EE91 Uncharacterized protein

2.9e-24

55.38

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A0A6J1FXV4 uncharacterized protein LOC111448755

1.1e-42

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A0A6J1J6X7 uncharacterized protein LOC111484017

2.8e-43

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A0A7J6GIE5 Uncharacterized protein

6.6e-24

58.02

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A0A7J6HHM1 ThiF domain-containing protein

1.9e-23

58.4

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G26960.1 unknown protein

7.2e-07

32.71

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         L PSP+
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AT5G54970.1 unknown protein

2.6e-09

34.62

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             S+     +   + ++   +SDV AH
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAATCGCAGGCTTCGATCCTCGCCAAAATCATCTGCAAATGGGACGGAATCATTCCACAAGTACTTGAAGCCCGGTGCCTTAGCGCAGTTGCGAGACTCGAGAATCAG
CGCTAGATCGTACCGATTCAACTCGCTCGCTCAGATCTACCTCCGCCGTACTTCTTCTCTGGCGTCGTCTGCACTTTCCACTACCGATCAATCAGAGATGGACATGGTCG
ACGACTTCCCCTCTTTGTCTGGGAGGGTTTATGGCCCCTTGTGCCTTAAGAGAAAGAAACTCACGGCGATTAAGTCTACATTGTTTCCGAGCCCTAGTTTGCAAACTTCT
ACTTCCGATTTGACTCGAGACCCGATTATTGACGTGTTTAATAGCGATGTTGCTGCGCATTGA

mRNA sequence

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Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNRRLRSSPKSSANGTESFHKYLKPGALAQLRDSRISARSYRFNSLAQIYLRRTSSLASSALSTTDQSEMDMVDDFPSLSGRVYGPLCLKRKKLTAIKSTLFPSPSLQTS
TSDLTRDPIIDVFNSDVAAH

Tan0011591 (gene) of Snake gourd v1 genome