; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0011682 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0011682
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description50S ribosomal protein L20, chloroplastic
Genome locationContig00034:92801..93154
RNA-Seq ExpressionTan0011682
SyntenyTan0011682
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
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GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005813 - Ribosomal protein L20
IPR035566 - Ribosomal protein L20, C-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A6H0EVH9 50S ribosomal protein L20, chloroplastic2.5e-54100Show/hide
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A0A6H0EXK8 50S ribosomal protein L20, chloroplastic2.5e-54100Show/hide
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A0A6M3RWV1 50S ribosomal protein L20, chloroplastic2.5e-54100Show/hide
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A0A6M3S4F6 50S ribosomal protein L20, chloroplastic2.5e-54100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1NWH3 50S ribosomal protein L20, chloroplastic3.3e-4886.32Show/hide
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Q4VZJ4 50S ribosomal protein L20, chloroplastic1.4e-5496.58Show/hide
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Q7FNS5 50S ribosomal protein L20, chloroplastic3.3e-4888.03Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16740.1 Ribosomal protein L209.0e-0938.2Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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