; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0011824 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0011824
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRibosome production factor 2 homolog
Genome locationLG08:69724043..69726987
RNA-Seq ExpressionTan0011824
SyntenyTan0011824
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0000463 - maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006099 - tricarboxylic acid cycle (biological process)
GO:0015977 - carbon fixation (biological process)
GO:0032774 - RNA biosynthetic process (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0008964 - phosphoenolpyruvate carboxylase activity (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007109 - Brix domain
IPR039770 - Ribosome biogenesis protein Rpf2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580669.1 Ribosome production factor 2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.0e-16894.1Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKV+REL+KRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES++KYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDL+E+GIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLP+DGLRKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE

KAG7017424.1 Ribosome production factor 2-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.5e-16893.79Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+REL+KRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES++KYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDL+E+GIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLP+DGLRKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE

XP_022934916.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita moschata]6.5e-16893.79Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+REL+KRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES++KYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDL+E+GIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLP+DGLRKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE

XP_022983029.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita maxima]1.4e-16794.1Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKV+REL+KRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES++KYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDLIE+GIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLP+DGLRKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMK+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE

XP_023540188.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.5e-16894.72Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKREL+KRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESA+KYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDHHIYDLIE+GIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLP+DGLRKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+ALP+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE
        RDD PASKKPKEDSEKPKE SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAR1 Ribosome production factor 2 homolog1.5e-16290.99Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        ML++RTPKN KVKREL+KRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTE+YHLKKESA+KYSRKN+GIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSII+YGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        +NLVI RTY+ HIYD++E+GIENFKSMHSF YDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD FRGEVVEN+NL+GLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMV+RRHRLP DGLRKEAMKT KD+AKKKEKNVS+D IQGKIGRIYIPDQKVGDMA+ +KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE
        RDDGPASKKPKEDSEKPKE SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE

A0A6J1F357 Ribosome production factor 2 homolog3.1e-16893.79Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+REL+KRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES++KYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDL+E+GIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLP+DGLRKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE

A0A6J1FZZ6 Ribosome production factor 2 homolog1.3e-16693.79Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKREL+KRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESA+KYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDHHIYDL+E+GIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLP+DGLRKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+ALP+KSKGVKRER EAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE
        RD+GPASKK KEDSEKPKE SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE

A0A6J1J655 Ribosome production factor 2 homolog7.0e-16894.1Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKV+REL+KRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES++KYSRKN+GIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDH IYDLIE+GIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLP+DGLRKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMA+P+KSKGVKRERREAKMK+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE
        +DDGPASKKPKEDSEKPKE SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE

A0A6J1KZU6 Ribosome production factor 2 homolog1.2e-16794.7Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKVRTPKNGKVKREL+KRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESA+KYSR+NEGIKPFE+GGD+SLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDHHIYDLIE+GIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLP+DGLRKEAMKT KDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQKVGD+ALP+KSKGVKRERREAKMKN
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGS
        RDD PASKKPKEDSEKPKE S
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSEKPKEGS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2YDN6 Ribosome production factor 2 homolog2.2e-5743.09Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        +V  PK  + KR L+KR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   + Y +KN   +PFE     SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+H+ D+IE+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V NI LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L +D L K +MK PK    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+ K  D
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD

Query:  DGPASKKPKED
        +   SK+ K++
Subjt:  DGPASKKPKED

Q9AWM9 Ribosome production factor 2 homolog2.8e-12169.55Show/hide
Query:  VRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL
        +R P++ + KREL K APKLVETGKKTLILHGTKTS VLN VL +++HLK+++A+KYS+KN+ I+PFESGG+ SLEFFSLKTDCS+IVYGSHSKKRP+NL
Subjt:  VRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL

Query:  VIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA
        V+GRTYDHHIYDL+E+G+EN+KS+ S+ YDKKL+P++GSKPF  FIGE FE+VEELKHLKEVLLDLF+GEVVEN+NLAG+DRV+VCTAISP  V++ HCA
Subjt:  VIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA

Query:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRDD
        LRLK+SG+ +PR+ELVEVGPSMD+VVRRHR P + L+KEAMKT  D AKK  KNV++D + GK+G++YIPDQ++  M+L N  KG+KRERREAK KN+D 
Subjt:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRDD

Query:  GPASKKPKEDSE
           SKK K + E
Subjt:  GPASKKPKEDSE

Q9H7B2 Ribosome production factor 2 homolog8.2e-5743.09Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        +V  PK  + KR L+KR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   + Y +KN   +PFE     SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+H+ D+IE+GIENF S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V NI LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L +D L K +MK PK    KK+KN+S D      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+    D
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD

Query:  DGPASKKPKED
            SK+ K++
Subjt:  DGPASKKPKED

Q9JJ80 Ribosome production factor 2 homolog4.4e-5843.73Show/hide
Query:  KVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        KV  PK  + KR L+KR PKL E  K  +++ G   +  + +VL ++Y LKK   + Y +KN   +PFE     SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+H+ D+IE+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  KV+    
Subjt:  LVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L +D L K +MK PK    KK KN+SQD      GRI++  Q +  +    K KG+K  +R A+    D
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRD

Query:  DGPASKKPKED
         G  SK+ K++
Subjt:  DGPASKKPKED

Q9LUG5 Ribosome production factor 2 homolog3.6e-12972.06Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK GK KR L+ RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  A++YSR+NE I+PFESGG+ SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+GR YDH +YDLIE+GIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL DLFRGEVV+N+NL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLPND L KEAM+T KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M L +KSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSE
        +++   +KK K  SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23620.1 Ribosomal RNA processing Brix domain protein2.6e-13072.06Show/hide
Query:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M+++RTPK GK KR L+ RAPKLVETGKKTLILHGTKTS  L+ V+TE+Y LKK  A++YSR+NE I+PFESGG+ SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+GR YDH +YDLIE+GIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL DLFRGEVV+N+NL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLPND L KEAM+T KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M L +KSKG KRER++AK+K+
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKN

Query:  RDDGPASKKPKEDSE
        +++   +KK K  SE
Subjt:  RDDGPASKKPKEDSE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAAGTCAGAACTCCCAAGAATGGGAAAGTTAAACGAGAGCTCGACAAACGCGCTCCCAAACTAGTAGAAACAGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACAAA
AACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTATTGACGGAAATTTATCACCTGAAGAAAGAAAGTGCCCTGAAGTATTCTCGTAAGAATGAAGGAATTAAACCATTTGAAAGTGGCG
GCGATGCGTCTTTGGAATTCTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCCGATAACCTTGTCATAGGGAGAACCTATGAT
CACCACATCTACGACCTAATTGAGATTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTATCTCCACGGGTGGGGTCAAAGCCTTTCATTAC
TTTCATTGGCGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTAAAGCATTTAAAAGAAGTTTTGCTTGATTTGTTCCGAGGAGAGGTTGTAGAGAATATAAATCTTGCTGGGTTGG
ACCGTGTATATGTATGTACAGCCATCTCACCAAATAAAGTGTTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCAAGAATGGAACTAGTTGAA
GTTGGTCCTTCAATGGATATGGTGGTTCGTCGGCACCGACTTCCAAATGATGGCCTAAGGAAGGAAGCAATGAAAACACCCAAGGATCAGGCTAAGAAGAAGGAGAAAAA
TGTTAGCCAGGATGCAATTCAAGGCAAGATTGGAAGGATATATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATATGGCTCTACCCAACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGAGAACGAC
GCGAAGCAAAAATGAAAAACAGAGATGATGGCCCAGCCTCTAAAAAACCAAAAGAAGATTCCGAAAAACCAAAAGAAGGTTCGGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGCGAATTGCCATAGCTCGATTTGCCAAAACCCCATTTGCCACAAAAACCCTAACGATAAAGACGCCCCAGCCAAAAGGCCACCAAAATCGGCGTCCGCTTGTAGTCGCC
GGAAGTATCTATATTTCTCTGCTGGTTGAGCAACAAAACCCTAAATCTCACCTCAGTTATCTCGTCGCCTGTAGATCATGTTGAAAGTCAGAACTCCCAAGAATGGGAAA
GTTAAACGAGAGCTCGACAAACGCGCTCCCAAACTAGTAGAAACAGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACAAAAACGAGCGGCGTGTTGAATGAAGTATTGACGGA
AATTTATCACCTGAAGAAAGAAAGTGCCCTGAAGTATTCTCGTAAGAATGAAGGAATTAAACCATTTGAAAGTGGCGGCGATGCGTCTTTGGAATTCTTCTCTCTCAAAA
CTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCCGATAACCTTGTCATAGGGAGAACCTATGATCACCACATCTACGACCTAATTGAGATTGGGATT
GAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTATCTCCACGGGTGGGGTCAAAGCCTTTCATTACTTTCATTGGCGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGA
GCTAAAGCATTTAAAAGAAGTTTTGCTTGATTTGTTCCGAGGAGAGGTTGTAGAGAATATAAATCTTGCTGGGTTGGACCGTGTATATGTATGTACAGCCATCTCACCAA
ATAAAGTGTTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCAAGAATGGAACTAGTTGAAGTTGGTCCTTCAATGGATATGGTGGTTCGTCGG
CACCGACTTCCAAATGATGGCCTAAGGAAGGAAGCAATGAAAACACCCAAGGATCAGGCTAAGAAGAAGGAGAAAAATGTTAGCCAGGATGCAATTCAAGGCAAGATTGG
AAGGATATATATTCCTGATCAAAAGGTTGGAGATATGGCTCTACCCAACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGAGAACGACGCGAAGCAAAAATGAAAAACAGAGATGATGGCC
CAGCCTCTAAAAAACCAAAAGAAGATTCCGAAAAACCAAAAGAAGGTTCGGAATAGTTCAATTATTGTGATACTGTTTGATCCAATTCTCCTCTTACTAACTTGAGTTGC
TGTTGTGAAATGCATAGTAGCATGCCAATTATGAGGAAAGAACAGACAAATTATTTATTTGCTTATATACAATTTTGCCTTCGGTCTTCAATTTGATTCTTTACATGCAA
GCCTACCTTTTATCATCTTAACCATTCAGGGTTTTGCAGAGTTTGACTGTGAATCTCATTGGTTAGTTAGGACACAATGTTGTTGTAGCAAACAGAATGTTCCTTCAAAA
TTAGATGTGGGAGAGATATCTAAATACATGTATTGTTTCTGTTATGTATTTATTTTTCTATTAAACTTGGCATGGTTTAAAAAACTAGCTGTTTATTACTATGGTTGTTT
TAGGGATGTGTAGCAACCTCTGCCCTTGATTATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKVRTPKNGKVKRELDKRAPKLVETGKKTLILHGTKTSGVLNEVLTEIYHLKKESALKYSRKNEGIKPFESGGDASLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNLVIGRTYD
HHIYDLIEIGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENINLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCALRLKKSGSVVPRMELVE
VGPSMDMVVRRHRLPNDGLRKEAMKTPKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVGDMALPNKSKGVKRERREAKMKNRDDGPASKKPKEDSEKPKEGSE