; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0011863 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0011863
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionThiamine-phosphate synthase
Genome locationLG01:12205282..12206502
RNA-Seq ExpressionTan0011863
SyntenyTan0011863
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038881247.1 uncharacterized protein LOC120072805 [Benincasa hispida]4.6e-5891.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KY02 Uncharacterized protein8.8e-5587.7Show/hide
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A0A6J1C5G7 uncharacterized protein LOC111008437 isoform X21.2e-5691.8Show/hide
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A0A6J1C6J6 uncharacterized protein LOC111008437 isoform X11.3e-5892.62Show/hide
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A0A6J1FSI5 uncharacterized protein LOC1114477564.1e-6095.08Show/hide
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A0A6J1J258 uncharacterized protein LOC1114820279.1e-6094.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G73940.1 unknown protein7.2e-1736.79Show/hide
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        +RY + +    ++ I  K P ++   I+  ++D+ + HGPL++  TW R QE G+ GL SK HMK++++WMR ++ L+L+CN +G  K+F +T     P 
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AT5G49410.1 unknown protein3.2e-4980Show/hide
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AT5G49410.2 unknown protein3.2e-4980Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTGGGACTGCAATAAGGTATTTCACGACGAAGCCAAAGCCGAAGATGAAGCCGATAGAGCTGAAAACTCCACCGGAGCAAACGCAGACGATAACTAGAGTCATATT
CGACATCGTTAGGGAGCATGGTCCGCTAACCATAGCCGAAACTTGGGACCGCGTTCAGGAAGTTGGTTTGAGAGGATTAACAAGCAAAAGGCACATGAAAATAGTGATGA
GATGGATGAGGGAACGGCAGAAGTTAAGATTAATGTGCAATCACTTAGGACCTCATAAGCAGTTTCTTTATACCACCTGGTTCACAAAACCCAACTTCGGGCAGGAAAAA
CCACAGGGGCGTAATTCTTCCCAATCAAAAAGCCCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGGAGTGTCCAACCTAAACTAATATGCTTATGGGTTAGATTTTACACTTTACAGGATCCCCAAATTCACCCTCCTCTGAGCATTTGAAATTCTCGAAATCCGTCCATAG
TCACTGGAGCTCACCGCCAACGACCATTTTCCTCAATCCCAGACCTGACGGTTACCATACCGATTGGATTACCTGCTCTGTCTGGTTTTGTGAGTAACAAAATCAGTATG
TTTGGGACTGCAATAAGGTATTTCACGACGAAGCCAAAGCCGAAGATGAAGCCGATAGAGCTGAAAACTCCACCGGAGCAAACGCAGACGATAACTAGAGTCATATTCGA
CATCGTTAGGGAGCATGGTCCGCTAACCATAGCCGAAACTTGGGACCGCGTTCAGGAAGTTGGTTTGAGAGGATTAACAAGCAAAAGGCACATGAAAATAGTGATGAGAT
GGATGAGGGAACGGCAGAAGTTAAGATTAATGTGCAATCACTTAGGACCTCATAAGCAGTTTCTTTATACCACCTGGTTCACAAAACCCAACTTCGGGCAGGAAAAACCA
CAGGGGCGTAATTCTTCCCAATCAAAAAGCCCTTGAGTGCCTGCCAATTACCTGTAAAACTGTTATTGTTTCTTTCTTTTTAATGGAAGCTTTTCTTTGATTATTCCACA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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