; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0011889 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0011889
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionBHLH transcription factor
Genome locationLG01:103768169..103770340
RNA-Seq ExpressionTan0011889
SyntenyTan0011889
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031754.1 Transcription factor bHLH93, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-13976.19Show/hide
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XP_022940461.1 transcription factor bHLH93-like isoform X1 [Cucurbita moschata]5.0e-14279.47Show/hide
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XP_022981028.1 transcription factor bHLH93-like [Cucurbita maxima]2.0e-14380.06Show/hide
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XP_023525294.1 transcription factor bHLH93-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.2e-14179.77Show/hide
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XP_038899495.1 transcription factor bHLH93-like [Benincasa hispida]2.8e-13778.99Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1F615 transcription factor bHLH93-like3.1e-12673.84Show/hide
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        ISKMDRTAILADAI+YVKEL+EKI NLQ+EIE GN P+KL   GILRD+K NEYLVRNS KFNVERREG T IEICCAAKPGLLLSTV TLEALGL+IQ 
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        CV+SCFNDFA+QASCSEG E R  +STEEVKQALF+NAGYGGRC
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A0A6J1FIJ3 transcription factor bHLH93-like isoform X12.4e-14279.47Show/hide
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        CFNDFAIQASCSEGTE R +   EEVKQ LFENAGYGGRCL
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A0A6J1FJN9 transcription factor bHLH93-like isoform X22.5e-13175.83Show/hide
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        CFNDFAIQASCSE   ++ +++   + + +F
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A0A6J1IE22 transcription factor bHLH93-like2.0e-12875.22Show/hide
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        MELNEHYL +ELLAL+RE+NWE AMPT++       NGWNFDCSD      S+ +D+ N +YLL+GQGQYSFP DQFT  A ASTGDSM          S
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        V+SCFNDFAIQASCSEG E R+ +STEEVKQALF+ AGYGGRC
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A0A6J1J102 transcription factor bHLH93-like9.7e-14480.06Show/hide
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        MELNEH LLDEL ALRRE+NWELAMPTE+N+LIS+ANGWNFDCSD+SS  FSLPID Q+F YLL G+  YSFP  QFTA  STGDSMSY+T ETTP  F 
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        CFNDFAIQASCSEGTE R I   EEVKQALFENAGYGGRCL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q10S44 Transcription factor BHLH31.2e-5866.85Show/hide
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        KL G PSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRT+IL D IDYVKEL E+I  L++EI V  P +L+ +  ++D      NE LVRNS KF+VE
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         R  G+TRIEICC A PG+LLSTV  LE LGLEI+QCV+SCF+DF +QASC +    R +VST+E+KQ LF +AGYGGRCL
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Q336V8 Basic helix-loop-helix protein 0041.6e-5055.5Show/hide
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        S E+ P+F  GG       +   S +  Q G PSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRS+VP+ISKMDRT+IL D I YVKEL+++I NLQ E   G+ S   
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Query:  ----SMGILRDVKP--------NEYLVRNSPKFNVERRE-GDTRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIV-ST
            SM  L  +KP           L+RNS +F VERRE G TRIE+ CAA P LL ST+  LEALG+EI+QCVISCF+DFA+QASC +  + R +   T
Subjt:  ----SMGILRDVKP--------NEYLVRNSPKFNVERRE-GDTRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIV-ST

Query:  EEVKQALFENAGYGGRCL
        EE+KQ LF +AGYG  CL
Subjt:  EEVKQALFENAGYGGRCL

Q9LPW3 Transcription factor SCREAM23.8e-3647.62Show/hide
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        K +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLRS+VPKISKMDR +IL DAIDY+KELL++IN+L  E+E   PS              S  +  ++ P+  L  
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Query:  ---NSPKFNVERREGD-TRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGG
             P+  V  REG    I + C  +PGLLLST+  L+ LGL++QQ VISCFN FA+    +E  +    V  E++K  L + AGY G
Subjt:  ---NSPKFNVERREGD-TRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGG

Q9LSL1 Transcription factor bHLH932.4e-6771.04Show/hide
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        +KKL+GQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRT+IL DAIDY+KELL+KIN LQ +E E+GN +     +  G L+D+  NE LVRNSPKF
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Query:  NVERREGDTRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGGRCL
         ++RR+ DTR++ICC+ KPGLLLSTV+TLE LGLEI+QCVISCF+DF++QASCSEG E R  +++E++KQALF NAGYGG CL
Subjt:  NVERREGDTRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGGRCL

Q9LXA9 Transcription factor bHLH612.4e-5965.08Show/hide
Query:  LGQKIVGSSTKKLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQK-EIEVGNPSKLESMGILRDVKPNEYLV
        +G+     S KKL+GQPSKNLMAERRRRKRLNDRLS+LRSIVPKI+KMDRT+IL DAIDY+KELL+KIN LQ+ E E+G+ S L ++        NE +V
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Query:  RNSPKFNVERREGDTRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGGRCL
        RNS KF V++RE +T I+ICC  KPGL++STV TLE LGLEI+QCVISCF+DF++QASC E  E R +V++E  KQAL  NAGYGGRCL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12860.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein2.7e-3747.62Show/hide
Query:  KLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQKEIEVGNPSKLE-----------SMGILRDVKPNEYLVR
        K +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLRS+VPKISKMDR +IL DAIDY+KELL++IN+L  E+E   PS              S  +  ++ P+  L  
Subjt:  KLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQKEIEVGNPSKLE-----------SMGILRDVKPNEYLVR

Query:  ---NSPKFNVERREGD-TRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGG
             P+  V  REG    I + C  +PGLLLST+  L+ LGL++QQ VISCFN FA+    +E  +    V  E++K  L + AGY G
Subjt:  ---NSPKFNVERREGD-TRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGG

AT3G26744.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.0e-3642.65Show/hide
Query:  NTGGTCDLGQKIVGSSTKKLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQKEIEVGNPSKLE---------
        N  G      +I G    K +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLRS+VPKISKMDR +IL DAIDY+KELL++IN+L  E+E   P  L          
Subjt:  NTGGTCDLGQKIVGSSTKKLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQKEIEVGNPSKLE---------

Query:  -------SMGILRDVKPNEYLVRNSPKFNVERREGDTR---IEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVK
               S  +  ++ P+        +  VE R  + R   I + C  +PGLLL+T+  L+ LGL++QQ VISCFN FA+    +E  +    +  +++K
Subjt:  -------SMGILRDVKPNEYLVRNSPKFNVERREGDTR---IEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVK

Query:  QALFENAGYGG
          LF+ AGY G
Subjt:  QALFENAGYGG

AT3G26744.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.0e-3642.65Show/hide
Query:  NTGGTCDLGQKIVGSSTKKLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQKEIEVGNPSKLE---------
        N  G      +I G    K +G P+KNLMAERRRRK+LNDRL MLRS+VPKISKMDR +IL DAIDY+KELL++IN+L  E+E   P  L          
Subjt:  NTGGTCDLGQKIVGSSTKKLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQKEIEVGNPSKLE---------

Query:  -------SMGILRDVKPNEYLVRNSPKFNVERREGDTR---IEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVK
               S  +  ++ P+        +  VE R  + R   I + C  +PGLLL+T+  L+ LGL++QQ VISCFN FA+    +E  +    +  +++K
Subjt:  -------SMGILRDVKPNEYLVRNSPKFNVERREGDTR---IEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVK

Query:  QALFENAGYGG
          LF+ AGY G
Subjt:  QALFENAGYGG

AT5G10570.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein1.7e-6065.08Show/hide
Query:  LGQKIVGSSTKKLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQK-EIEVGNPSKLESMGILRDVKPNEYLV
        +G+     S KKL+GQPSKNLMAERRRRKRLNDRLS+LRSIVPKI+KMDRT+IL DAIDY+KELL+KIN LQ+ E E+G+ S L ++        NE +V
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Query:  RNSPKFNVERREGDTRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGGRCL
        RNS KF V++RE +T I+ICC  KPGL++STV TLE LGLEI+QCVISCF+DF++QASC E  E R +V++E  KQAL  NAGYGGRCL
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AT5G65640.1 beta HLH protein 931.7e-6871.04Show/hide
Query:  TKKLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQ-KEIEVGNPSK---LESMGILRDVKPNEYLVRNSPKF
        +KKL+GQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRT+IL DAIDY+KELL+KIN LQ +E E+GN +     +  G L+D+  NE LVRNSPKF
Subjt:  TKKLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEKINNLQ-KEIEVGNPSK---LESMGILRDVKPNEYLVRNSPKF

Query:  NVERREGDTRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGGRCL
         ++RR+ DTR++ICC+ KPGLLLSTV+TLE LGLEI+QCVISCF+DF++QASCSEG E R  +++E++KQALF NAGYGG CL
Subjt:  NVERREGDTRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQALFENAGYGGRCL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTTGAATGAACACTATTTGTTAGATGAACTTTTAGCTTTGAGAAGAGAAATGAATTGGGAATTAGCAATGCCCACAGAAATGAACGAGCTAATTTCCAGTGCAAA
TGGCTGGAATTTTGATTGCTCTGATTCGTCTTCTTTAGCCTTCTCTTTACCAATTGATCAGCAGAATTTTAATTATCTTCTCAGTGGGCAAGGGCAGTATTCTTTTCCCG
GCGACCAATTCACGGCGACGGCGAGTACCGGCGATTCGATGTCGTACAGTACGTTGGAGACTACGCCGAGTAGTTTCGAGGTTTATAATGGGGAGTATCCGATTACGAAT
ATGGAAGAGGAAGAACTTGGGATTTTGGAGGATGAGATTCACAATCTTGAAGTTCAGGCCAGTTGTAAAATCGAGCCGGTTCATTCTCCTGAAATTATCCCGGTTTTTAA
CACGGGCGGCACGTGCGATCTTGGGCAAAAAATCGTCGGTTCGTCGACTAAGAAACTTCAGGGGCAGCCGTCGAAGAATCTCATGGCGGAGAGACGGCGGAGGAAGCGGC
TCAACGATCGGCTCTCCATGCTCAGATCCATCGTCCCCAAAATTAGCAAGATGGATAGAACTGCGATTCTTGCGGATGCAATTGATTACGTGAAGGAACTGCTAGAGAAA
ATCAACAATTTGCAAAAGGAAATTGAAGTGGGGAATCCGAGTAAATTGGAGTCGATGGGCATTTTGAGAGATGTGAAACCGAATGAATATTTGGTCAGAAATTCGCCTAA
GTTTAATGTGGAAAGAAGAGAAGGTGATACTCGGATTGAGATTTGCTGTGCGGCTAAGCCTGGATTATTGTTGTCGACTGTGGACACTCTTGAAGCTTTGGGGCTTGAGA
TTCAGCAGTGTGTCATTAGCTGTTTCAATGACTTTGCAATTCAAGCTTCTTGTTCTGAGGGAACGGAGCACAGAACAATTGTGAGCACAGAAGAAGTAAAGCAAGCATTA
TTTGAAAATGCTGGATATGGAGGAAGATGCCTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAAAAGACTTAGAGAGAGAGAGGAAAAAACAAATGGAGTTGAATGAACACTATTTGTTAGATGAACTTTTAGCTTTGAGAAGAGAAATGAATTGGGAATTAGCAA
TGCCCACAGAAATGAACGAGCTAATTTCCAGTGCAAATGGCTGGAATTTTGATTGCTCTGATTCGTCTTCTTTAGCCTTCTCTTTACCAATTGATCAGCAGAATTTTAAT
TATCTTCTCAGTGGGCAAGGGCAGTATTCTTTTCCCGGCGACCAATTCACGGCGACGGCGAGTACCGGCGATTCGATGTCGTACAGTACGTTGGAGACTACGCCGAGTAG
TTTCGAGGTTTATAATGGGGAGTATCCGATTACGAATATGGAAGAGGAAGAACTTGGGATTTTGGAGGATGAGATTCACAATCTTGAAGTTCAGGCCAGTTGTAAAATCG
AGCCGGTTCATTCTCCTGAAATTATCCCGGTTTTTAACACGGGCGGCACGTGCGATCTTGGGCAAAAAATCGTCGGTTCGTCGACTAAGAAACTTCAGGGGCAGCCGTCG
AAGAATCTCATGGCGGAGAGACGGCGGAGGAAGCGGCTCAACGATCGGCTCTCCATGCTCAGATCCATCGTCCCCAAAATTAGCAAGATGGATAGAACTGCGATTCTTGC
GGATGCAATTGATTACGTGAAGGAACTGCTAGAGAAAATCAACAATTTGCAAAAGGAAATTGAAGTGGGGAATCCGAGTAAATTGGAGTCGATGGGCATTTTGAGAGATG
TGAAACCGAATGAATATTTGGTCAGAAATTCGCCTAAGTTTAATGTGGAAAGAAGAGAAGGTGATACTCGGATTGAGATTTGCTGTGCGGCTAAGCCTGGATTATTGTTG
TCGACTGTGGACACTCTTGAAGCTTTGGGGCTTGAGATTCAGCAGTGTGTCATTAGCTGTTTCAATGACTTTGCAATTCAAGCTTCTTGTTCTGAGGGAACGGAGCACAG
AACAATTGTGAGCACAGAAGAAGTAAAGCAAGCATTATTTGAAAATGCTGGATATGGAGGAAGATGCCTGTAGAACAATATTCCAATTTGGGAACTAGGAAGAGAAAATG
GAGAAGGAAAAAAAAAAGGCGTTTTTTTGGAGATGGGTTTTCAAATCTCAATGTTTTCAATGAGATTTGGTTAGTTGAATTGTTCTTTTTTTTTTTTTTTCAATAATAAA
TGTGTATTTAATTTTAATTGAGTCCTTAAATCAGCAAATGATTGTCATATTAGGAAATAAAAGAAAAAGTAGATTTCCATTTGCAAGAATGAGTCTTCCAGGTGCCTACG
AAAAGAAAAGGAAAGTGACATTATTTTTATATAAAATATTAGGAACGGATGAGAAATAAAGAGTGAAATAAAATTATTTATTTATTTCAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELNEHYLLDELLALRREMNWELAMPTEMNELISSANGWNFDCSDSSSLAFSLPIDQQNFNYLLSGQGQYSFPGDQFTATASTGDSMSYSTLETTPSSFEVYNGEYPITN
MEEEELGILEDEIHNLEVQASCKIEPVHSPEIIPVFNTGGTCDLGQKIVGSSTKKLQGQPSKNLMAERRRRKRLNDRLSMLRSIVPKISKMDRTAILADAIDYVKELLEK
INNLQKEIEVGNPSKLESMGILRDVKPNEYLVRNSPKFNVERREGDTRIEICCAAKPGLLLSTVDTLEALGLEIQQCVISCFNDFAIQASCSEGTEHRTIVSTEEVKQAL
FENAGYGGRCL