; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0012098 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0012098
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like
Genome locationLG06:7346657..7347389
RNA-Seq ExpressionTan0012098
SyntenyTan0012098
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0068047.1 protein no-on-transient A-like [Cucumis melo var. makuwa]2.3e-0855.56Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK----RIRSGRVG----GPHNSAANRSRLASFG
        MAAIKSL+ IS+ +ALL FSESL+TSAA C  A SNS+TG L RN+LQT     +  E K+NVHIK+    RIR    G    G   SAA+RS++ASFG
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK----RIRSGRVG----GPHNSAANRSRLASFG

KAG6575859.1 hypothetical protein SDJN03_26498, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-1158.76Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKINVHIKKRIRSGRVGGPHNSAANRSRLASFG
        MAA+KSLVS+++ +ALLLFSESL  SA    S  SNSLTG L RN+LQT        +VESS ERK+NVHIK+R+R     G  +SAANRSR+AS G
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKINVHIKKRIRSGRVGGPHNSAANRSRLASFG

KAG6593163.1 hypothetical protein SDJN03_12639, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.5e-0753Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKKRIRSGRV--GGPHNSAANRSRLASFGRCNRSCL
        MAAIK+L+SI++ +ALLLF ESL TSAA     +S SL G L RNI+QTT +     E+K NVHIK+R+R   V  G P  SAANRSR A  G  +  C+
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKKRIRSGRV--GGPHNSAANRSRLASFGRCNRSCL

KAG7025561.1 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.1e-0655.56Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKKRIRSGRV--GGPHNSAANRSRLA
        MAAIK+L+SI++ +ALLLF ESL TSAA     +S SL G L RNI+QTT +     E+K NVHIK+R+R   V  G P  S ANRSR A
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKKRIRSGRV--GGPHNSAANRSRLA

KGN44886.1 hypothetical protein Csa_015765 [Cucumis sativus]1.3e-0856.12Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK-------RIRSGRVGGPHNSAANRSRLASFG
        MAAIKSL+SIS+ +ALL FSESL+TSAA C  A SNS+T  L RNILQT     +  E K+NV IKK        I +G   G  +SAANRSR+ SFG
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK-------RIRSGRVGGPHNSAANRSRLASFG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAQ7 Uncharacterized protein6.5e-0956.12Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK-------RIRSGRVGGPHNSAANRSRLASFG
        MAAIKSL+SIS+ +ALL FSESL+TSAA C  A SNS+T  L RNILQT     +  E K+NV IKK        I +G   G  +SAANRSR+ SFG
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK-------RIRSGRVGGPHNSAANRSRLASFG

A0A1S3BT53 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like7.4e-0550.49Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKIN-VHIKKRIR------SGRVGGPHNSAANRSRL
        MAAI+ LVSI++ +ALL FSESL T         S+SLTG  HRNIL T        +VESS +RK N +H K R R      SG  G  H SA NRSR+
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKIN-VHIKKRIR------SGRVGGPHNSAANRSRL

Query:  ASF
        ASF
Subjt:  ASF

A0A5A7VLE5 Protein no-on-transient A-like1.1e-0855.56Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK----RIRSGRVG----GPHNSAANRSRLASFG
        MAAIKSL+ IS+ +ALL FSESL+TSAA C  A SNS+TG L RN+LQT     +  E K+NVHIK+    RIR    G    G   SAA+RS++ASFG
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVE--SSVERKINVHIKK----RIRSGRVG----GPHNSAANRSRLASFG

A0A5D3D3Y6 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like1.6e-0447.75Show/hide
Query:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKIN-VHIKKRIR------SGRVGGPHNSAANRSRL
        MAAI+ LVSI++ +ALL FSESL T         S+SLTG  HRNIL T        +VESS +RK N +H K R R      SG  G  H SA NRSR+
Subjt:  MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQT--------TVESSVERKIN-VHIKKRIR------SGRVGGPHNSAANRSRL

Query:  ASFGRCNRSCL
        ASF   +  C+
Subjt:  ASFGRCNRSCL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGCGATCAAATCTCTAGTCTCGATATCAATTGTCGTTGCTCTTCTCTTGTTCTCTGAATCTCTAGCCACTTCCGCCGCCGGTTGCGGCAGCGCTTCGTCAAATTC
TCTTACCGGAAAACTTCATCGGAACATCCTTCAGACGACCGTCGAGTCCTCCGTCGAACGGAAGATAAATGTTCATATCAAAAAGCGGATCCGATCTGGACGAGTTGGCG
GCCCCCATAACTCGGCGGCGAATCGGAGCCGACTCGCCTCGTTTGGGCGTTGTAATCGCTCTTGCTTACATTTACGTTGTGAAAGATGCACAAAAACAGAAAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCGATCAAATCTCTAGTCTCGATATCAATTGTCGTTGCTCTTCTCTTGTTCTCTGAATCTCTAGCCACTTCCGCCGCCGGTTGCGGCAGCGCTTCGTCAAATTC
TCTTACCGGAAAACTTCATCGGAACATCCTTCAGACGACCGTCGAGTCCTCCGTCGAACGGAAGATAAATGTTCATATCAAAAAGCGGATCCGATCTGGACGAGTTGGCG
GCCCCCATAACTCGGCGGCGAATCGGAGCCGACTCGCCTCGTTTGGGCGTTGTAATCGCTCTTGCTTACATTTACGTTGTGAAAGATGCACAAAAACAGAAAGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIKSLVSISIVVALLLFSESLATSAAGCGSASSNSLTGKLHRNILQTTVESSVERKINVHIKKRIRSGRVGGPHNSAANRSRLASFGRCNRSCLHLRCERCTKTES