; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0012506 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0012506
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRemorin_C domain-containing protein
Genome locationLG01:2170505..2171793
RNA-Seq ExpressionTan0012506
SyntenyTan0012506
Gene Ontology termsGO:0006950 - response to stress (biological process)
GO:0010033 - response to organic substance (biological process)
GO:1901700 - response to oxygen-containing compound (biological process)
InterPro domainsIPR005516 - Remorin, C-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN57373.1 hypothetical protein Csa_010046 [Cucumis sativus]2.1e-3472.27Show/hide
Query:  STSDGKKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKA
        S +D +KIE+KIQ WE+REK K DNKAER++ASTE WK+++KAALEAEVKKI+AD+ KLRLR MEKVKNKEAE  KA ESKKASIEA+REL+K KVE KA
Subjt:  STSDGKKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKA

Query:  AKHRSNNTIPTKCFGICQD
          HR  NT+P KCFGIC D
Subjt:  AKHRSNNTIPTKCFGICQD

PNT11038.2 hypothetical protein POPTR_012G140900 [Populus trichocarpa]1.0e-1749.55Show/hide
Query:  ELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNT
        E  I+AWE++EK K  NKA+R ++  + W+   K + EA+  KIEA++E +R  + EK+KN+EA+ QKA E KKA+I+A+ + +  ++ EKA KHRSNNT
Subjt:  ELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNT

Query:  IPTKCFGICQD
        +P KCFGIC D
Subjt:  IPTKCFGICQD

XP_004140777.2 remorin [Cucumis sativus]1.0e-2574Show/hide
Query:  STSDGKKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKA
        S +D +KIE+KIQ WE+REK K DNKAER++ASTE WK+++KAALEAEVKKI+AD+ KLRLR MEKVKNKEAE  KA ESKKASIEA+REL+K KVE KA
Subjt:  STSDGKKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKA

XP_017973082.1 PREDICTED: remorin-like [Theobroma cacao]4.3e-1952.21Show/hide
Query:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS
        +++E KI AW EREK KVD+KA+RK+A T+ W+   KA  EA+ K IE   EKL+  ++E++KNKEA+ QK    KKASIEA+RE  K  +++KA K+R+
Subjt:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS

Query:  NNTIPTKCFGICQ
         NT+P  CFGIC+
Subjt:  NNTIPTKCFGICQ

XP_024438026.1 uncharacterized protein LOC7484383 isoform X1 [Populus trichocarpa]1.0e-1749.55Show/hide
Query:  ELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNT
        E  I+AWE++EK K  NKA+R ++  + W+   K + EA+  KIEA++E +R  + EK+KN+EA+ QKA E KKA+I+A+ + +  ++ EKA KHRSNNT
Subjt:  ELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNT

Query:  IPTKCFGICQD
        +P KCFGIC D
Subjt:  IPTKCFGICQD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6I9 Remorin_C domain-containing protein1.0e-3472.27Show/hide
Query:  STSDGKKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKA
        S +D +KIE+KIQ WE+REK K DNKAER++ASTE WK+++KAALEAEVKKI+AD+ KLRLR MEKVKNKEAE  KA ESKKASIEA+REL+K KVE KA
Subjt:  STSDGKKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKA

Query:  AKHRSNNTIPTKCFGICQD
          HR  NT+P KCFGIC D
Subjt:  AKHRSNNTIPTKCFGICQD

A0A2K1YDD2 Remorin_C domain-containing protein5.1e-1849.55Show/hide
Query:  ELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNT
        E  I+AWE++EK K  NKA+R ++  + W+   K + EA+  KIEA++E +R  + EK+KN+EA+ QKA E KKA+I+A+ + +  ++ EKA KHRSNNT
Subjt:  ELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNT

Query:  IPTKCFGICQD
        +P KCFGIC D
Subjt:  IPTKCFGICQD

A0A5N5F0X1 Remorin-like1.9e-1754.63Show/hide
Query:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT
        I+ WEE++KTKVDNKA +++A  E  K+  +  LEAE KKIE  VEK R RE+EK+KNKEA + K  E  K  IEA+R  +   VE+KA K R+ NT+PT
Subjt:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT

Query:  KCFGICQD
        KCFG+C D
Subjt:  KCFGICQD

A0A6J1BA75 remorin-like1.1e-1753.21Show/hide
Query:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS
        +K+E KI AW EREK KVD+KA+RK+A T+ W+   KA  EA+ K IE   EKLR  ++E++KNKEA+ QK    KKASIEA+RE  K  +++KA K+R+
Subjt:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS

Query:  NNTIPTKCF
         NT+P  CF
Subjt:  NNTIPTKCF

A0A6P5TJD0 remorin 4.1-like4.3e-1750.89Show/hide
Query:  IELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNN
        I+ +++ WE ++K KVDNKA++ +A  E  K+  +  LEA  KKIE  VEKLR +E+EK+KNKEA + K  E  K  IEA+R    QKVE+KA K R +N
Subjt:  IELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNN

Query:  TIPTKCFGICQD
        ++PTKCFG+C D
Subjt:  TIPTKCFGICQD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80837 Remorin3.6e-1341.35Show/hide
Query:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT
        I+AWEE EK+K +N+A++K++    W++++KAA+EA+++KIE  +EK + +  EK+KNK A   K AE K+A +EA++  +  K EE  AK+R+   +P 
Subjt:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT

Query:  KCFG
           G
Subjt:  KCFG

P93788 Remorin1.7e-1548.65Show/hide
Query:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS
        K++ L I+AWEE EK+K +NKA++KV++   W++++KA LEAE+KK+E  +EK +    EK+KNK A   K AE K+A IEA+R     K EE AAK+R+
Subjt:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS

Query:  NNTIPTKCFGI
          T P K  GI
Subjt:  NNTIPTKCFGI

Q7XII4 Remorin 4.13.1e-0434.58Show/hide
Query:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS
        +++E KI AW+  E  KV+N+ +R+      W+  +     A +KK E  +E+ R + MEK +N+ A+A++ AE K+AS EA+R  +  +V E A   R+
Subjt:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS

Query:  NNTIPTK
            P+K
Subjt:  NNTIPTK

Q9FFA5 Remorin 1.41.2e-1650.96Show/hide
Query:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT
        I+AWEE EK KV+NKAE+K++S   W++ +KAA+EAE+KK+E  +EK +   +E++KNK A+  K AE K+A IEA+R  +  K EE AAK+R+  T P 
Subjt:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT

Query:  KCFG
        K FG
Subjt:  KCFG

Q9M2D8 Uncharacterized protein At3g612601.5e-1445.19Show/hide
Query:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT
        ++AWEE EK+K +NKAE+K+A    W++++KAA+EA++KKIE  +EK +    E++KNK A   K AE ++A IEA+R     K EE AAK+R+   +P 
Subjt:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT

Query:  KCFG
           G
Subjt:  KCFG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G45820.1 Remorin family protein2.6e-1441.35Show/hide
Query:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT
        I+AWEE EK+K +N+A++K++    W++++KAA+EA+++KIE  +EK + +  EK+KNK A   K AE K+A +EA++  +  K EE  AK+R+   +P 
Subjt:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT

Query:  KCFG
           G
Subjt:  KCFG

AT3G48940.1 Remorin family protein6.6e-1849.09Show/hide
Query:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS
        K+I L I+AWEE EK+KV+NKA++K++S   W++++KA++EAE+KKIE  + K +    E++KNK A+  K AE K+A  EA+R     K EE AAK+R+
Subjt:  KKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRS

Query:  NNTIPTKCFG
          T PTK FG
Subjt:  NNTIPTKCFG

AT3G61260.1 Remorin family protein1.0e-1545.19Show/hide
Query:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT
        ++AWEE EK+K +NKAE+K+A    W++++KAA+EA++KKIE  +EK +    E++KNK A   K AE ++A IEA+R     K EE AAK+R+   +P 
Subjt:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT

Query:  KCFG
           G
Subjt:  KCFG

AT5G23750.1 Remorin family protein8.6e-1850.96Show/hide
Query:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT
        I+AWEE EK KV+NKAE+K++S   W++ +KAA+EAE+KK+E  +EK +   +E++KNK A+  K AE K+A IEA+R  +  K EE AAK+R+  T P 
Subjt:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT

Query:  KCFG
        K FG
Subjt:  KCFG

AT5G23750.2 Remorin family protein8.6e-1850.96Show/hide
Query:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT
        I+AWEE EK KV+NKAE+K++S   W++ +KAA+EAE+KK+E  +EK +   +E++KNK A+  K AE K+A IEA+R  +  K EE AAK+R+  T P 
Subjt:  IQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSNNTIPT

Query:  KCFG
        K FG
Subjt:  KCFG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTAGCTGGGAGCACGAGTGACGGAAAGAAGATCGAATTGAAAATCCAAGCCTGGGAAGAAAGGGAAAAGACCAAAGTCGATAACAAAGCTGAAAGGAAAGTGGCTTC
TACTGAGGTATGGAAGAGCACAAGGAAAGCTGCTTTGGAAGCGGAAGTGAAGAAGATAGAGGCTGATGTGGAGAAGTTGAGGCTGAGGGAAATGGAGAAGGTGAAAAACA
AAGAGGCTGAGGCACAAAAGGCAGCTGAATCAAAGAAGGCATCCATTGAAGCAAGAAGAGAGCTTCAAAAGCAGAAGGTTGAGGAGAAAGCTGCCAAGCATAGGTCTAAC
AATACAATTCCAACCAAATGCTTTGGCATCTGCCAAGACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCTAGCTGGGAGCACGAGTGACGGAAAGAAGATCGAATTGAAAATCCAAGCCTGGGAAGAAAGGGAAAAGACCAAAGTCGATAACAAAGCTGAAAGGAAAGTGGCTTC
TACTGAGGTATGGAAGAGCACAAGGAAAGCTGCTTTGGAAGCGGAAGTGAAGAAGATAGAGGCTGATGTGGAGAAGTTGAGGCTGAGGGAAATGGAGAAGGTGAAAAACA
AAGAGGCTGAGGCACAAAAGGCAGCTGAATCAAAGAAGGCATCCATTGAAGCAAGAAGAGAGCTTCAAAAGCAGAAGGTTGAGGAGAAAGCTGCCAAGCATAGGTCTAAC
AATACAATTCCAACCAAATGCTTTGGCATCTGCCAAGACTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLAGSTSDGKKIELKIQAWEEREKTKVDNKAERKVASTEVWKSTRKAALEAEVKKIEADVEKLRLREMEKVKNKEAEAQKAAESKKASIEARRELQKQKVEEKAAKHRSN
NTIPTKCFGICQD