; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0012595 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0012595
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionAWPM-19-like protein
Genome locationLG03:79558295..79559404
RNA-Seq ExpressionTan0012595
SyntenyTan0012595
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008390 - AWPM-19-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0052579.1 AWPM-19-like protein [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-6283.66Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        MKAIAA I F NFCICI+IFGIGGWVMN TIDNGFVIGA  ++P YFSPIFFQIGNSATGFFV+FALIAAVAVVASAISGNFYFRFS+ +NLPPAASTAL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS
        +ACFLT LAMGFAWKEIA+TV SGHLIALE  +I+LSVTQ +YTAII+WTSTS
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS

TYK13246.1 uncharacterized protein E5676_scaffold255G008640 [Cucumis melo var. makuwa]1.7e-6283.66Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        MKAIAA I F NFCICI+IFGIGGWVMN TIDNGFVIGA  ++P YFSPIFFQIGNSATGFFV+FALIAAVAVVASAISGNFYFRFS+ +NLPPAASTAL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS
        +ACFLT LAMGFAWKEIA+TV SGHLIALE  +I+LSVTQ +YTAII+WTSTS
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS

XP_008439689.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484407 [Cucumis melo]3.9e-6283.01Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        MKAIAA I F NFCICI+IFGIGGWVMN TIDNGFVIGA  ++P YFSPIFFQIGNSATGFFV+FALIAAVAVVASAISGNFYFR+S+ +NLPPAASTAL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS
        +ACFLT LAMGFAWKEIA+TV SGHLIALE  +I+LSVTQ +YTAII+WTSTS
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS

XP_022978777.1 uncharacterized protein LOC111478636 [Cucurbita maxima]1.2e-6083.66Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        M+AIAASISF NFCI +IIFGIGGWVMN +IDNGFVIGAE E+P YFSPIFFQIGN+ATGFFVVFALIAAVA VAS ISG+FYFRFSN +NLPPAAS+AL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS
        IACFLT LAMGFAWKEI+ TV S HL+ALE FLIILSVTQ IYTAII+WTSTS
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS

XP_038882133.1 uncharacterized protein LOC120073380 isoform X2 [Benincasa hispida]2.1e-6386.84Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        MKAIAA I F NFCICI+IFGIGGWVMN T+DNGFVIGA  E+P YFSPIFFQIGNSATGFFV+FALIAAVAVVASAISG+FYFRFS+ SNLPPAASTAL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTST
        IACFLT LAMGFAWKEIALTV SGHLIALE FLIILSVTQ +YTAII+WTST
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTST

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNQ2 Uncharacterized protein5.1e-6079.08Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        MKAIAA I F NFCIC++IFGIGGWVMN TIDNGFVIGA  ++P YFSPIFFQIGNSATGFF++FALIAAVAVVASAI+G+FYFRF   +N PPAASTAL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS
        +ACFLT LAMGFAWKEIA+TV SGHLIALE F+I+LS+TQ +YTAII+W STS
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS

A0A1S3AZB2 uncharacterized protein LOC1034844071.9e-6283.01Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        MKAIAA I F NFCICI+IFGIGGWVMN TIDNGFVIGA  ++P YFSPIFFQIGNSATGFFV+FALIAAVAVVASAISGNFYFR+S+ +NLPPAASTAL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS
        +ACFLT LAMGFAWKEIA+TV SGHLIALE  +I+LSVTQ +YTAII+WTSTS
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS

A0A5A7UGF2 AWPM-19-like protein8.4e-6383.66Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        MKAIAA I F NFCICI+IFGIGGWVMN TIDNGFVIGA  ++P YFSPIFFQIGNSATGFFV+FALIAAVAVVASAISGNFYFRFS+ +NLPPAASTAL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS
        +ACFLT LAMGFAWKEIA+TV SGHLIALE  +I+LSVTQ +YTAII+WTSTS
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS

A0A5D3CS83 Uncharacterized protein8.4e-6383.66Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        MKAIAA I F NFCICI+IFGIGGWVMN TIDNGFVIGA  ++P YFSPIFFQIGNSATGFFV+FALIAAVAVVASAISGNFYFRFS+ +NLPPAASTAL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS
        +ACFLT LAMGFAWKEIA+TV SGHLIALE  +I+LSVTQ +YTAII+WTSTS
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS

A0A6J1IM08 uncharacterized protein LOC1114786366.0e-6183.66Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        M+AIAASISF NFCI +IIFGIGGWVMN +IDNGFVIGAE E+P YFSPIFFQIGN+ATGFFVVFALIAAVA VAS ISG+FYFRFSN +NLPPAAS+AL
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS
        IACFLT LAMGFAWKEI+ TV S HL+ALE FLIILSVTQ IYTAII+WTSTS
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6L4D2 Membrane protein PM19L4.4e-0833.33Show/hide
Query:  KAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTALI
        + + A +  +N  + +I+ G   W +N        I  E   P          GN AT +F+VFA++A V   AS ++G  + R     +L   A++ALI
Subjt:  KAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTALI

Query:  ACFLTLLAMGFAWKEIALTVISG-HLIALETFLIILSVTQCIYTAII
        A  +T LA G A KEI +    G  L  LE F+IIL+ TQ +Y A++
Subjt:  ACFLTLLAMGFAWKEIALTVISG-HLIALETFLIILSVTQCIYTAII

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04560.1 AWPM-19-like family protein1.5e-1133.79Show/hide
Query:  IAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTALIAC
        IAA + F+N  + +I+ G   W +N+       I  +   P++        GN AT FF+ F+++AAV  VAS ++G  + RF  + +L  A +++++A 
Subjt:  IAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTALIAC

Query:  FLTLLAMGFAWKEIALTVISG-HLIALETFLIILSVTQCIYTAII
         +T LAMG A K+I +    G  L  +E F+IIL+ TQ +Y  +I
Subjt:  FLTLLAMGFAWKEIALTVISG-HLIALETFLIILSVTQCIYTAII

AT1G29520.1 AWPM-19-like family protein6.6e-3654.42Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        +K +A+ +  +NFC+ +I+ GIGGW MN+ ID+GF +G  LE+PA+FSPI+F +GN+ATGFFV+FAL+A V   AS ISG  + R     +LP AA+ A 
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAII
        IA  LT+LAMGFAWKEI L   +  L  +E FLIILSVTQ IY A +
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAII

AT5G18970.1 AWPM-19-like family protein4.5e-1638.36Show/hide
Query:  KAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTALI
        K+ A  +  +N  +  +I  I  W +N  I+      + L +PA   PI+F +GN ATGFFV+F LIA V  +A++++G       +  NL  AA+++LI
Subjt:  KAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTALI

Query:  ACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAII
        +  LTLLAMG A KEI +     +L  LE   II+S TQ + T  I
Subjt:  ACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAII

AT5G46530.1 AWPM-19-like family protein4.5e-3252.38Show/hide
Query:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL
        MK +A+ +  +NFC+  I+ GIG W MN+ I++GF+IGA+  +PA+FSPI F +GN+ATGFF++FALIA VA  AS ISG  + +    ++LP A S A 
Subjt:  MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTAL

Query:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAII
        IA  LTLLAMGF  KEI L + +  L  +E FLIILS TQ +Y A I
Subjt:  IACFLTLLAMGFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAII


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAGCCATTGCAGCCTCGATTTCGTTCATCAATTTCTGCATATGCATCATCATTTTCGGGATCGGGGGCTGGGTGATGAATCAAACAATTGATAATGGCTTTGTTAT
TGGTGCAGAACTTGAAATTCCTGCATATTTTTCTCCAATTTTCTTCCAAATTGGGAACTCTGCTACTGGGTTCTTTGTTGTTTTTGCTTTGATTGCTGCTGTTGCTGTGG
TTGCATCCGCCATCTCTGGAAACTTTTATTTTCGTTTTTCGAACCACAGCAACCTGCCCCCTGCTGCTTCGACAGCTCTCATCGCATGCTTTCTAACTCTTCTCGCAATG
GGGTTTGCTTGGAAAGAGATTGCTCTAACTGTCATCAGTGGCCATCTGATTGCATTGGAGACTTTCCTGATTATCCTTTCAGTTACGCAGTGTATTTATACTGCAATCAT
CATGTGGACCTCAACCAGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAAGCCATTGCAGCCTCGATTTCGTTCATCAATTTCTGCATATGCATCATCATTTTCGGGATCGGGGGCTGGGTGATGAATCAAACAATTGATAATGGCTTTGTTAT
TGGTGCAGAACTTGAAATTCCTGCATATTTTTCTCCAATTTTCTTCCAAATTGGGAACTCTGCTACTGGGTTCTTTGTTGTTTTTGCTTTGATTGCTGCTGTTGCTGTGG
TTGCATCCGCCATCTCTGGAAACTTTTATTTTCGTTTTTCGAACCACAGCAACCTGCCCCCTGCTGCTTCGACAGCTCTCATCGCATGCTTTCTAACTCTTCTCGCAATG
GGGTTTGCTTGGAAAGAGATTGCTCTAACTGTCATCAGTGGCCATCTGATTGCATTGGAGACTTTCCTGATTATCCTTTCAGTTACGCAGTGTATTTATACTGCAATCAT
CATGTGGACCTCAACCAGTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKAIAASISFINFCICIIIFGIGGWVMNQTIDNGFVIGAELEIPAYFSPIFFQIGNSATGFFVVFALIAAVAVVASAISGNFYFRFSNHSNLPPAASTALIACFLTLLAM
GFAWKEIALTVISGHLIALETFLIILSVTQCIYTAIIMWTSTS