; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0013013 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0013013
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionVQ motif containing protein
Genome locationLG05:84983193..84988271
RNA-Seq ExpressionTan0013013
SyntenyTan0013013
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583990.1 VQ motif-containing protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.3e-11388.4Show/hide
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XP_022140262.1 VQ motif-containing protein 4-like isoform X1 [Momordica charantia]1.1e-11590.27Show/hide
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XP_022140263.1 VQ motif-containing protein 4-like isoform X2 [Momordica charantia]1.1e-11590.27Show/hide
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XP_023520333.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-11388Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]2.2e-11690.04Show/hide
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        P     NSDS SKTHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINP+ PVFGS  ++GFSPRK EILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSY
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B685 VQ motif-containing protein 4 isoform X17.3e-11085.6Show/hide
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A0A6J1CGC6 VQ motif-containing protein 4-like isoform X15.2e-11690.27Show/hide
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A0A6J1CHL5 VQ motif-containing protein 4-like isoform X25.2e-11690.27Show/hide
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        QASAKP A A  NS+SVSK+HIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKL+INPLIPVFG SCN+GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSG
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A0A6J1EII3 VQ motif-containing protein 4-like5.4e-11387.6Show/hide
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        ME+SS+ QENP P  SSLLPSPSSRMT+S+TSS+STS G+Q + PPP  H LHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQAS  P
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         AA SNSDSVSKTHIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNS+NKLKINP+ PVFGS+ ++GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYL
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like1.9e-11387.35Show/hide
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        ME+SSI QENP P     SSLLPSPSSRMT+S+TSS+STS G+Q + PPP  H LHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQAS
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          P AA SNSDSVSKTHIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNS+NKLKINP+ PVFGS+ ++GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANC
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 131.2e-2946.91Show/hide
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        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P        S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         ++
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        G     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + ++++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P
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Q5M750 VQ motif-containing protein 41.8e-6057.03Show/hide
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        ME S  ++E    ++L+PSP    +N+S   +S+S   +    PP     H     TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+ KP 
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              D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINPL PVF +  N+ FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG
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         +N        +  +  AE+KA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 337.7e-3245.82Show/hide
Query:  STSSTSTSNGVQLMPPPPQLH------QLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-SPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKSL
        STSS S S   Q+  PPP +       Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTG S +T      +  +  +N++  S   IPPIK  
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Query:  PRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP--------LIPVFGSSC---NAGFSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLAN
           + + FKLYERR       + N L IN         L+   G+S    +  FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S    
Subjt:  PRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP--------LIPVFGSSC---NAGFSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLAN

Query:  CSYLKNGNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
         S L  GN    +  EDKAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 313.3e-1135.52Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSP
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG P     A+A P A      +V KT I        +++   KL+ERR  + + K+  + P             KP   +P
Subjt:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSP

Query:  SILDFPALALSPVTPLIPDPF--DRSGLANCSYLKN--GNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
        S       + S  T L+  P     S  +N S ++    +   + E E+KAIKE+ FYLHPSP + P  +EP LL LFP+TSP
Subjt:  SILDFPALALSPVTPLIPDPF--DRSGLANCSYLKN--GNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP

Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 192.8e-3446.31Show/hide
Query:  SSRMTNSSTSSTSTS--NGVQLMPPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKS
        S+   +SS+SS S+S  NG         LH       ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P    S   +     IPPIK+
Subjt:  SSRMTNSSTSSTSTS--NGVQLMPPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKS

Query:  LPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNA
           ++ SG KLYERR       N  N L IN L+   G + +  FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+              
Subjt:  LPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNA

Query:  KLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
              E++ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.2e-6157.03Show/hide
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        ME S  ++E    ++L+PSP    +N+S   +S+S   +    PP     H     TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+ KP 
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Query:  AAGSNSD---SVSKTHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSG
              D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINPL PVF +  N+ FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG
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Query:  LANCSYLKNGNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
         +N        +  +  AE+KA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein7.3e-6256.98Show/hide
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        ME S  ++E    ++L+PSP    +N+S   +S+S   +    PP     H     TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S+ KP 
Subjt:  METSSIHQENPSPSSLLPSPSSRMTNSSTSSTSTSNGVQLMPPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASA-KPT

Query:  AAGSNSD---SVSKTHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSG
              D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINPL PVF +  N+ FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG
Subjt:  AAGSNSD---SVSKTHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSG

Query:  LANCSYLKNGNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPV
         +N        +  +  AE+KA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV V
Subjt:  LANCSYLKNGNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPV

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein8.7e-3146.91Show/hide
Query:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPLIPVFGSSCNA
        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P        S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         ++
Subjt:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPLIPVFGSSCNA

Query:  GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVP
        G     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + ++++IKEKGFYL PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P
Subjt:  GFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVP

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein2.0e-3546.31Show/hide
Query:  SSRMTNSSTSSTSTS--NGVQLMPPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKS
        S+   +SS+SS S+S  NG         LH       ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P    S   +     IPPIK+
Subjt:  SSRMTNSSTSSTSTS--NGVQLMPPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKS

Query:  LPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNA
           ++ SG KLYERR       N  N L IN L+   G + +  FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+              
Subjt:  LPRRQQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNA

Query:  KLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
              E++ I +KG+YLH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  KLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein5.4e-3345.82Show/hide
Query:  STSSTSTSNGVQLMPPPPQLH------QLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-SPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKSL
        STSS S S   Q+  PPP +       Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTG S +T      +  +  +N++  S   IPPIK  
Subjt:  STSSTSTSNGVQLMPPPPQLH------QLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTG-SPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSKTHIPPIKSL

Query:  PRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP--------LIPVFGSSC---NAGFSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLAN
           + + FKLYERR       + N L IN         L+   G+S    +  FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S    
Subjt:  PRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP--------LIPVFGSSC---NAGFSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGLAN

Query:  CSYLKNGNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
         S L  GN    +  EDKAI +KGFYLHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
Subjt:  CSYLKNGNAKLDAEAEDKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACCTCTTCAATTCACCAAGAAAACCCATCCCCTTCTTCTCTTCTTCCTTCCCCAAGCAGCCGCATGACCAACAGCAGTACCAGTAGCACCAGCACCAGCAATGG
AGTCCAACTCATGCCTCCACCGCCTCAATTGCACCAATTGCACTCTCCAAAACCCATCACTCGATCTGAATCTGTCAATCCTTACCCCACTACTTTCGTCCAAGCCGATA
CCTCCTCTTTCAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACCGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCTGCCAAGCCCACTGCCGCTGGTTCCAACTCTGATTCTGTCTCCAAA
ACGCACATTCCGCCTATTAAATCTTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGGTTCAAGCTCTATGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAGATTAACCCCTTGATTCCCGT
TTTTGGTTCGAGTTGTAATGCCGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAAATTCTTTCCCCCAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTCCGGTCACGCCGCTTATTC
CCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGCGAAGTTGGATGCTGAGGCGGAAGATAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTAC
TTGCATCCATCGCCGACCACTACTCCTCGAGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCACTGTTCCCAATGACATCGCCTAGAGTTCCAGTGTTCAATATGTGTCCAACAAATGT
CCAAGTATCCAAGTGTCTCACACGGACATGCAAGCTAAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACCTCTTCAATTCACCAAGAAAACCCATCCCCTTCTTCTCTTCTTCCTTCCCCAAGCAGCCGCATGACCAACAGCAGTACCAGTAGCACCAGCACCAGCAATGG
AGTCCAACTCATGCCTCCACCGCCTCAATTGCACCAATTGCACTCTCCAAAACCCATCACTCGATCTGAATCTGTCAATCCTTACCCCACTACTTTCGTCCAAGCCGATA
CCTCCTCTTTCAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACCGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCTGCCAAGCCCACTGCCGCTGGTTCCAACTCTGATTCTGTCTCCAAA
ACGCACATTCCGCCTATTAAATCTTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGGTTCAAGCTCTATGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAGATTAACCCCTTGATTCCCGT
TTTTGGTTCGAGTTGTAATGCCGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAAATTCTTTCCCCCAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTCCGGTCACGCCGCTTATTC
CCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGCGAAGTTGGATGCTGAGGCGGAAGATAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTAC
TTGCATCCATCGCCGACCACTACTCCTCGAGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCACTGTTCCCAATGACATCGCCTAGAGTTCCAGTGTTCAATATGTGTCCAACAAATGT
CCAAGTATCCAAGTGTCTCACACGGACATGCAAGCTAAACTGAAGCGTCGGTGTTTCTTAGTACAACAAATGTGAAATATGAAAATTTGAACTTTTGACTTTAAGAGAAG
ATGCATATGTCAATTACTACTGAGCTATGCTTATTTTAGCTATCAACTTTTATATCTAGTCTAACAAGTGAGATGTAATTCAAATATAGGGTGTACTTTATATTACTAAG
TCATGACCAACGATTACAAACTTGTAGTCTTGTAGAAATAAATAGGTAACTTTTTGTTTTATTTGGTTAATTGTAAGAATAATCTTTGAATTATATCGAATATACGTGTT
TATAATATTTGGAAGTTGTGTTGATTAAGATAGCTTAATTGATTAATAACTGTATTGTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METSSIHQENPSPSSLLPSPSSRMTNSSTSSTSTSNGVQLMPPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASAKPTAAGSNSDSVSK
THIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPLIPVFGSSCNAGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEDKAIKEKGFY
LHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPVFNMCPTNVQVSKCLTRTCKLN