CuGenDBv2

Gene ID	Tan0013140
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	LG05:808366..810104
RNA-Seq Expression	Tan0013140
Synteny	Tan0013140
Gene Ontology terms	GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6570471.1 Family With Sequence Similarity 210 Member B, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

5.9e-79

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KAG7010336.1 hypothetical protein SDJN02_27129 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.9e-78

83.5

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XP_022943302.1 uncharacterized protein LOC111448115 [Cucurbita moschata]

3.5e-79

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XP_023512163.1 uncharacterized protein LOC111776967 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.0e-78

83.5

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XP_038901803.1 uncharacterized protein LOC120088508 [Benincasa hispida]

6.6e-78

84.16

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        MATA S+I FSSS I    SF   NFRF F F N P KFN KRFRVQALK+KTGEIERP    S ++SSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEE EE E 
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        KNKSKGDQAKELL KYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAG+DVQALLQKVGIS +ETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVE
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        KE
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KEW3 DUF1279 domain-containing protein

1.0e-76

84.85

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        MA A S+I FSSS   S  SFT  NFRFHF F N P KFN K FRVQALK+KTGEIERPSP +SSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEG   E  NKS
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        KGDQAKELL KYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAG+DVQ LLQKVGIS +ETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKE
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A0A5D3B9U1 DUF1279 domain-containing protein

1.0e-76

84.85

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        MATA S+I FSS    S  SFT  NFRFHF F N P KFN K FRVQALK+KTGEI+RPSP +SSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEG   E  NKS
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A0A6J1DHN1 uncharacterized protein LOC111020570 isoform X1

1.2e-77

84.18

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        S+ICFSS FI SPASF   NFRFH K  NR PKFN +  RFRV+ALKEKTGEIERPSP       DEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEGE D  K KSKG+
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Query:  QAKELLTKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGIDVQALLQKVGISTNETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKEK
        QAKELL KYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGIDVQALLQKVGIS NETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEK++
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A0A6J1FSN5 uncharacterized protein LOC111448115

1.7e-79

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        KSKGDQAKELL KYGGAYLATSITLSLISF++CYALISAG+DVQALLQKVGIS +  GEKVGTFALAYAAHKA SPIRFPPTVALT +VA+WIGKKVE+E
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A0A6J1JG12 uncharacterized protein LOC111484182

1.7e-79

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        MATAPS ICFSSSFI SPASF   NFRF F  S RPPKFNPKR RVQALKEKTGEIERPSP  + SSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEG   E K+
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q96KR6 Protein FAM210B, mitochondrial

6.7e-09

33.01

Show/hide

Query:  ERKNKSKGDQAKELLTKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGIDVQALLQKVGISTNETGEKV----GTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASW
        E K +SK  Q K++  +YG   ++  I +SLIS  + Y ++S+G+D+ A+L K+G   +    K+     TF +AYA HK  +P+R   T+   P++  +
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Query:  IGK
          K
Subjt:  IGK

Q9D8B6 Protein FAM210B, mitochondrial

2.8e-07

32.65

Show/hide

Query:  KNKSKGDQAKELLTKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGIDVQALLQKVGISTNETGEKV----GTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASW
        K  S+  Q K++  +YG   ++  I +SL+S  + Y ++S+GID+ A+L K+G   +    K+     TF +AYA HK  +P+R   T+   P V  +
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

1.8e-04

30.77

Show/hide

Query:  KELLTKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGIDVQALLQKVGI------------------------STNETGEKV----GTFALAYAAHKAASPIRF
        KE++ KYG   L    ++S +S S  Y  I   +DV++LL+K  I                        S N+T +      G  ALA   +KA  PIR 
Subjt:  KELLTKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGIDVQALLQKVGI------------------------STNETGEKV----GTFALAYAAHKAASPIRF

Query:  PPTVALTPIVASWIGKK
        P T+ALTP +A ++ ++
Subjt:  PPTVALTPIVASWIGKK

AT2G27290.1 Protein of unknown function (DUF1279)

7.3e-59

65.79

Show/hide

Query:  PSPASFTARNFRFHFKFSNRPPKFNPKRFRVQALKEKTGEIER----PSPAASSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEE--GEEDERKNKSKGDQAKELL
        PS +    RN +  F  S+     + K+FR +A++EK  +I++    PS +    SA+EVTKKYGLE GLWKI SSK++   + D +K KSK D+AKELL
Subjt:  PSPASFTARNFRFHFKFSNRPPKFNPKRFRVQALKEKTGEIER----PSPAASSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEE--GEEDERKNKSKGDQAKELL

Query:  TKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGIDVQALLQKVGISTNETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKEK
         KYGGAYLATSITLSLISFSLCY L+++G+DVQALL KVGISTNETGEKVG FALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVA+WIGKKV+KEK
Subjt:  TKYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGIDVQALLQKVGISTNETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKEK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCAACAGCTCCCTCTGTAATTTGCTTTTCATCTTCTTTCATTCCCTCTCCCGCTTCCTTTACTGCTCGAAATTTCAGATTTCACTTCAAATTTTCTAATCGACCCCC
GAAATTCAATCCGAAACGATTCAGGGTTCAAGCCCTTAAAGAGAAAACCGGCGAAATCGAACGCCCATCTCCAGCAGCTTCGTCTTCTTCAGCAGATGAAGTTACCAAGA
AGTACGGACTTGAAGCTGGTCTCTGGAAGATATTTAGCTCAAAGGAGGAGGGTGAAGAAGATGAAAGGAAAAACAAATCAAAGGGTGATCAGGCAAAAGAGTTGCTTACA
AAATATGGAGGTGCATATTTAGCCACCTCCATAACTCTCTCCCTGATCTCTTTCTCTCTGTGTTATGCGCTCATCAGTGCCGGTATCGATGTTCAAGCTCTTCTGCAGAA
GGTAGGAATTTCAACAAACGAGACTGGAGAGAAAGTAGGAACGTTTGCTTTGGCATATGCAGCGCATAAAGCTGCTTCTCCAATAAGGTTTCCTCCAACAGTAGCCCTCA
CTCCAATCGTTGCAAGTTGGATTGGGAAGAAAGTTGAGAAAGAGAAATAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CGAATACCAAATTTAGCCATCTTTTCCTCTTTTAAACTGAGTGAAGAACAATCATGGTGACGACAGAGGATTAATCTCGAAGCAAATATCTGGTTTATAACGTTTCAGAT
AAAACTCTCTTTTTCTTTGATTTTGTGGGATCCTTGTTTCCCACCCTCCGAATTCAGAGGGCATGTTTTATCAATAGATTGCCAACCTCTGATTTTCCGATAATGGCAAC
AGCTCCCTCTGTAATTTGCTTTTCATCTTCTTTCATTCCCTCTCCCGCTTCCTTTACTGCTCGAAATTTCAGATTTCACTTCAAATTTTCTAATCGACCCCCGAAATTCA
ATCCGAAACGATTCAGGGTTCAAGCCCTTAAAGAGAAAACCGGCGAAATCGAACGCCCATCTCCAGCAGCTTCGTCTTCTTCAGCAGATGAAGTTACCAAGAAGTACGGA
CTTGAAGCTGGTCTCTGGAAGATATTTAGCTCAAAGGAGGAGGGTGAAGAAGATGAAAGGAAAAACAAATCAAAGGGTGATCAGGCAAAAGAGTTGCTTACAAAATATGG
AGGTGCATATTTAGCCACCTCCATAACTCTCTCCCTGATCTCTTTCTCTCTGTGTTATGCGCTCATCAGTGCCGGTATCGATGTTCAAGCTCTTCTGCAGAAGGTAGGAA
TTTCAACAAACGAGACTGGAGAGAAAGTAGGAACGTTTGCTTTGGCATATGCAGCGCATAAAGCTGCTTCTCCAATAAGGTTTCCTCCAACAGTAGCCCTCACTCCAATC
GTTGCAAGTTGGATTGGGAAGAAAGTTGAGAAAGAGAAATAGCATAATGGTTGCCTTGAGGAGAGTTCATGTATTTGGCTCAGATAAAGTTTTTTTGTAAAATTATTTGA
TAGTGGATATTGGGTTATGTCCCATATAGATTGCATACTAATGATTTATAAAGTATCCATCCTTTTGAATCATAGCGAATGGTTCCAGCTCTGAGCAACTGTATTAGTAG
TCCTGGTAGAGATTTGTGCTGCTAAAAAAGCAGTTAAGACATGGTAACTTTACACAAATGGAGC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MATAPSVICFSSSFIPSPASFTARNFRFHFKFSNRPPKFNPKRFRVQALKEKTGEIERPSPAASSSSADEVTKKYGLEAGLWKIFSSKEEGEEDERKNKSKGDQAKELLT
KYGGAYLATSITLSLISFSLCYALISAGIDVQALLQKVGISTNETGEKVGTFALAYAAHKAASPIRFPPTVALTPIVASWIGKKVEKEK

Tan0013140 (gene) of Snake gourd v1 genome