; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0013466 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0013466
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionDNA/RNA polymerases superfamily protein
Genome locationLG02:56642621..56643739
RNA-Seq ExpressionTan0013466
SyntenyTan0013466
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042035.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-0590.91Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTSRRRRQ+Q GTQDPTQGQSERGSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

KAA0045180.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold30G001810 [Cucumis melo var. makuwa]6.7e-0587.88Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTSRRRRQ+Q GTQDPTQGQSE GSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

KAA0056353.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-0484.85Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTS+R RQ+Q GTQDPTQGQSERGSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

TYK17971.1 DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-0590.91Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTSRRRRQ+Q GTQDPTQGQSERGSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

TYK27372.1 uncharacterized protein E5676_scaffold325G00500 [Cucumis melo var. makuwa]6.7e-0587.88Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTSRRRRQ+Q GTQDPTQGQSE GSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TKT0 Reverse transcriptase6.5e-0690.91Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTSRRRRQ+Q GTQDPTQGQSERGSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

A0A5A7TPS6 Retrotrans_gag domain-containing protein3.2e-0587.88Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTSRRRRQ+Q GTQDPTQGQSE GSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

A0A5A7UKD3 DNA/RNA polymerases superfamily protein5.5e-0584.85Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTS+R RQ+Q GTQDPTQGQSERGSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

A0A5D3D150 Reverse transcriptase6.5e-0690.91Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTSRRRRQ+Q GTQDPTQGQSERGSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

A0A5D3DV36 Retrotrans_gag domain-containing protein3.2e-0587.88Show/hide
Query:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR
        VMPPRTSRRRRQ+Q GTQDPTQGQSE GSS PR
Subjt:  VMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTTGTCGTGAGAGTCTTTGGCGAGCCCCACTACGACAAAGACGATGGGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACATCGTAGAGCAAATTTGTTAAGTTTTCGCTGTGTTAT
GTTAAAGTGTTCCATAAGCAAACATAGTGTCATGCCACCACGTACTAGCAGACGACGCAGGCAGGATCAGGGCGGGACGCAGGATCCTACCCAAGGCCAATCTGAGAGGG
GATCTAGTGCCCCGAGAGTCCGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTTGTCGTGAGAGTCTTTGGCGAGCCCCACTACGACAAAGACGATGGGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACATCGTAGAGCAAATTTGTTAAGTTTTCGCTGTGTTAT
GTTAAAGTGTTCCATAAGCAAACATAGTGTCATGCCACCACGTACTAGCAGACGACGCAGGCAGGATCAGGGCGGGACGCAGGATCCTACCCAAGGCCAATCTGAGAGGG
GATCTAGTGCCCCGAGAGTCCGGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFVVRVFGEPHYDKDDGSVGRAPLHRRANLLSFRCVMLKCSISKHSVMPPRTSRRRRQDQGGTQDPTQGQSERGSSAPRVR