; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0013536 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0013536
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationLG11:6780495..6781802
RNA-Seq ExpressionTan0013536
SyntenyTan0013536
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578743.1 LOB domain-containing protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.6e-6679.87Show/hide
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KAG7016272.1 LOB domain-containing protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.6e-6679.87Show/hide
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        L AQLA+AKAE+HKMQ Q ANLL L+CTETSQ  ++ Q+  +L Q HFPFTD +P+P+N
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XP_022939142.1 LOB domain-containing protein 1-like [Cucurbita moschata]6.9e-6578.62Show/hide
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        L  QLA+AKAE+HKM  Q ANLL L+CTETSQ  ++ Q+  +L Q HFPFTD +P+P+N
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XP_022993359.1 LOB domain-containing protein 1-like [Cucurbita maxima]6.0e-6178.95Show/hide
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        AKAE+HKMQ Q ANLL LICTETSQ+Q   +E  +L Q HFPFTD + +P+N
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XP_023551518.1 LOB domain-containing protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-6279.11Show/hide
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        AKAE+HKMQ Q ANLL L+CTETSQ  ++ +E  +L Q HFPF+D +P+P Y K S+I
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KU20 LOB domain-containing protein5.3e-5574.53Show/hide
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        S  PPP TVVLSPCAACKILRRRCV+KC+LAPYFPPT+P KFAAVHRI+GAGNVIKFLQ+LPE  R DAASSLVYEA+ARIRDPIYGCTG+IFQLQN+V 
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        ELHAQLA+AKAE+HKM QLQ  NLL L     SQ Q+Q++  I +Q Q+FPF DF S LP+
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A0A6J1FFZ7 LOB domain-containing protein 1-like3.3e-6578.62Show/hide
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        L  QLA+AKAE+HKM  Q ANLL L+CTETSQ  ++ Q+  +L Q HFPFTD +P+P+N
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A0A6J1JZZ3 LOB domain-containing protein 1-like2.9e-6178.95Show/hide
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        AKAE+HKMQ Q ANLL LICTETSQ+Q   +E  +L Q HFPFTD + +P+N
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A0A7J8YXG7 LOB domain-containing protein9.4e-5266.88Show/hide
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        L AQLA A+AE+  MQLQQANL+ L+C E +Q   Q        H P  DF   SP  Y+
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A0A7J9KLE0 LOB domain-containing protein9.4e-5266.88Show/hide
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        L AQLA A+AE+  MQLQQANL+ L+C E +Q   Q        H P  DF   SP  Y+
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L5T5 LOB domain-containing protein 153.8e-3454.2Show/hide
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        PP T   ++PCAACK+LRRRC  +C  +PYF P EP KFA+VH++FGA NV K L ++PE+ R DAA+SLVYEA+ R+RDP+YGC GAI  LQ QV  L 
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        A+L   ++EI K + ++A + TLI    SQ+
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Q8LBW3 LOB domain-containing protein 125.3e-3663.89Show/hide
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        SPCA+CK+LRRRC   C+ APYFPP +P KFA VH++FGA NV K LQ+LP + R DA +SLV+EA+AR+RDP+YGC GAI  LQNQVS+L  QLA+A+A
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        EI  +Q+Q
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Q9LQR0 LOB domain-containing protein 19.7e-4662.94Show/hide
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        S PPP  +  VVLSPCAACKILRRRC  +CVLAPYFPPT+P KF   HR+FGA N+IKFLQ+LPE+ R DA +S+VYEA ARIRDP+YGC GAI+ LQ Q
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        VSEL AQLA A+ E+  MQ Q++NLL LI     Q + ++D++
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Q9SHE9 LOB domain-containing protein 41.0e-3461.82Show/hide
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        SPCAACK+LRRRC   CV +PYFP  EP KFA VHR+FGA NV K LQ+LP + R DA SS+VYEA+AR+RDP+YGC GAI  LQ Q+  L AQLA+A+A
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        E+  ++++Q+
Subjt:  EIHKMQLQQA

Q9SK08 LOB domain-containing protein 111.6e-4563.7Show/hide
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        SPPPPP+        VVLSPCAACKILRRRC +KCVLAPYFPPT+P KF   HR+FGA N+IKFLQ+LPE+ R DA +S+VYEA AR+RDP+YGC GAI+
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         LQ QVSEL AQLA  + E+  MQLQ+++LL LI   E ++L  QE
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07900.1 LOB domain-containing protein 16.9e-4762.94Show/hide
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        S PPP  +  VVLSPCAACKILRRRC  +CVLAPYFPPT+P KF   HR+FGA N+IKFLQ+LPE+ R DA +S+VYEA ARIRDP+YGC GAI+ LQ Q
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        VSEL AQLA A+ E+  MQ Q++NLL LI     Q + ++D++
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AT1G31320.1 LOB domain-containing protein 47.1e-3661.82Show/hide
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AT2G28500.1 LOB domain-containing protein 111.2e-4663.7Show/hide
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        SPPPPP+        VVLSPCAACKILRRRC +KCVLAPYFPPT+P KF   HR+FGA N+IKFLQ+LPE+ R DA +S+VYEA AR+RDP+YGC GAI+
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Query:  QLQNQVSELHAQLAMAKAEIHKMQLQQANLLTLICT-ETSQLQDQE
         LQ QVSEL AQLA  + E+  MQLQ+++LL LI   E ++L  QE
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AT2G30130.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein3.8e-3763.89Show/hide
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Query:  EIHKMQLQ
        EI  +Q+Q
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AT2G40470.1 LOB domain-containing protein 152.7e-3554.2Show/hide
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        PP T   ++PCAACK+LRRRC  +C  +PYF P EP KFA+VH++FGA NV K L ++PE+ R DAA+SLVYEA+ R+RDP+YGC GAI  LQ QV  L 
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Query:  AQLAMAKAEIHKMQLQQANLLTLICTETSQL
        A+L   ++EI K + ++A + TLI    SQ+
Subjt:  AQLAMAKAEIHKMQLQQANLLTLICTETSQL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCCCGCCGCCGCCGCCGACGACGGTGGTTCTCAGCCCGTGCGCCGCTTGTAAGATCCTCCGCCGGAGATGCGTCAATAAGTGTGTTTTGGCGCCTTATTTTCCTCC
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CTTTCCGTTTACTGATTTTAGCCCTCTTCCATATAACAAATTTTCTGACATTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCCCGCCGCCGCCGCCGACGACGGTGGTTCTCAGCCCGTGCGCCGCTTGTAAGATCCTCCGCCGGAGATGCGTCAATAAGTGTGTTTTGGCGCCTTATTTTCCTCC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSPPPPPTTVVLSPCAACKILRRRCVNKCVLAPYFPPTEPLKFAAVHRIFGAGNVIKFLQDLPENHRVDAASSLVYEASARIRDPIYGCTGAIFQLQNQVSELHAQLAMA
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