; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0013771 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0013771
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionNADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial
Genome locationLG02:8106405..8109976
RNA-Seq ExpressionTan0013771
SyntenyTan0013771
Gene Ontology termsGO:0006120 - mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone (biological process)
GO:0032981 - mitochondrial respiratory chain complex I assembly (biological process)
GO:0005747 - mitochondrial respiratory chain complex I (cellular component)
GO:0003954 - NADH dehydrogenase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR010226 - NADH-quinone oxidoreductase, chain I
IPR017896 - 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulphur binding domain
IPR017900 - 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572037.1 hypothetical protein SDJN03_28765, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-11696.4Show/hide
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XP_022952272.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial-like [Cucurbita moschata]6.1e-11796.85Show/hide
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XP_038887775.1 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-B, mitochondrial [Benincasa hispida]1.6e-12099.55Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K5Z9 Uncharacterized protein1.5e-11696.85Show/hide
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A0A6J1C2E8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial1.6e-11897.75Show/hide
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A0A6J1F0I7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial3.2e-11997.75Show/hide
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A0A6J1GJX8 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial-like3.0e-11796.85Show/hide
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A0A6J1I8H7 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial3.2e-11997.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O21233 NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit 84.0e-7985.71Show/hide
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O24143 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial3.3e-10585.22Show/hide
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P80269 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial6.4e-10987.34Show/hide
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Q42599 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-A, mitochondrial3.2e-10887.39Show/hide
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Q9FX83 NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8-B, mitochondrial1.9e-10887.39Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16700.1 Alpha-helical ferredoxin1.3e-10987.39Show/hide
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AT1G79010.1 Alpha-helical ferredoxin2.2e-10987.39Show/hide
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ATCG01090.1 NADPH dehydrogenases1.9e-1535.54Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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ACACTTGTACAGTACCAAAAAAGAGGATGAAGAAAGAGAGCAGCTTGCCAAGGAGATCTCGAAGGACTGGAATTCTATTTTTGAGCGTAGCATAAACACACTATTTCTTA
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CATGCCCTCCGACGATATCCAACTGGAGAAGAACGATGCATTGCATGCAAACTTTGTGAAGCTATTTGTCCTGCCCAAGCAATCACAATTGAAGCTGAGGAACGGGAAGA
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TATCGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGCGATCTTAGCTCGCAAGTCCCTTCTCGCTCTTCGTGCTCGTCAGCTTGCTGTCTCTGGACAAGCACTGCAAGGTTCTCCCTTTCATGGTCTCCGGTCGAGTGC
ACACTTGTACAGTACCAAAAAAGAGGATGAAGAAAGAGAGCAGCTTGCCAAGGAGATCTCGAAGGACTGGAATTCTATTTTTGAGCGTAGCATAAACACACTATTTCTTA
CTGAAATGGTCCGGGGTCTGATGCTGACTCTTAAATACTTCTTTGAGAAAAAAGTCACTATCAATTACCCATTTGAGAAAGGCCCACTAAGCCCTCGTTTTCGAGGGGAG
CATGCCCTCCGACGATATCCAACTGGAGAAGAACGATGCATTGCATGCAAACTTTGTGAAGCTATTTGTCCTGCCCAAGCAATCACAATTGAAGCTGAGGAACGGGAAGA
TGGTAGCCGTAGGACTACAAGGTATGACATTGACATGACCAAATGCATCTACTGCGGATTCTGTCAAGAGGCATGCCCTGTTGATGCCATTGTCGAAGGTCCCAACTTTG
AGTTCGCCACAGAGACTCACGAGGAGCTTCTCTATGACAAAGAAAAGTTGCTCGAGAACGGAGACCGCTGGGAGACCGAGATTGCAGAGAACCTTAGATCTGAAAGCCTC
TATCGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAILARKSLLALRARQLAVSGQALQGSPFHGLRSSAHLYSTKKEDEEREQLAKEISKDWNSIFERSINTLFLTEMVRGLMLTLKYFFEKKVTINYPFEKGPLSPRFRGE
HALRRYPTGEERCIACKLCEAICPAQAITIEAEEREDGSRRTTRYDIDMTKCIYCGFCQEACPVDAIVEGPNFEFATETHEELLYDKEKLLENGDRWETEIAENLRSESL
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