; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0013807 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0013807
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X2
Genome locationLG09:57242161..57249462
RNA-Seq ExpressionTan0013807
SyntenyTan0013807
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
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IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3BPM2 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X15.1e-18991Show/hide
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A0A5A7ULJ0 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X21.9e-18891.93Show/hide
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A0A5D3DX99 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X21.3e-18791.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2HIJ8 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A5.0e-0843.64Show/hide
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        D  +D C IC E++   +P   T C+HEFHL C+LEW +RS +CP+C + +   D
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Q4TU14 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A1.3e-3538.02Show/hide
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        +S+A  V     +  DDACSICLE F   DPST+TSCKHE+HLQC++EW QRS +CP+CWQ   L+DP SQELL AVE+ER ++  N + SS I  H + 
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         DF  +     +  +  +E+ L+HL  AA     R   RR   +  S        LV SS P  ++  P    N    +A   +    S P PS G  +P
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              SPV    S P+     S++ S++    S  RS+  P           E  S  +++KS+  A S +YK+SI+KS +G +EKL +RN S+ ++  
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         V+RE+NAGIA V+RM+ER++    R   S   S
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Q8LE94 E3 ubiquitin-protein ligase At3g022901.9e-0745.45Show/hide
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        +D C  CLE +   +P  +T C H FHL C+ EW +RS  CP+C
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Q93ZF6 E3 ubiquitin-protein ligase AIRP15.5e-0743.14Show/hide
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        D C ICLE +   +P  +T C H+FHL C+L W +RS  CP+C + + L +
Subjt:  DACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKD

Q9ZT42 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A1.5e-11363.56Show/hide
Query:  ETKKSEAHLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKDPTSQELLEAVEQERSIRLNPARSS
        ET  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ ISLKDPTSQELLEAVEQER+ R NP R++
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Query:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSHPNSSSASPPPGDNREGEAAPRIMVATIS--P
        TIFRHPTLGDFELQHLP G ++A++EERI+QHLAAAAAMG+ARH  RREGHR RS   G  Q +VFSS PN+S  SPPP        + R    T+S  P
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Query:  PQPSGEESPQLNASVSPVQTDQSSPSAPQPSSHSASQLGSPSSDRRSTSQPVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTRGWREKLFSR
            GE S Q N       T   + S P+  S SAS      S+ R  +Q  P+ QDRAGPSELQSFS+SLKSR NA+S RYK+SI+K+TR W+++LFSR
Subjt:  PQPSGEESPQLNASVSPVQTDQSSPSAPQPSSHSASQLGSPSSDRRSTSQPVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTRGWREKLFSR

Query:  NTSMSDIGSEVRREVNAGIATVSRMMERLETRDTRKSSSPESSNVADNSPVSESNNTQTPENGGN
        NTSM+D+GSEV+REV+AGIATVSRMMERLETR+  + S+   S+V++N    E+NN       G+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G00335.1 RING-H2 finger B1A3.5e-0943.64Show/hide
Query:  DACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKD
        D  +D C IC E++   +P   T C+HEFHL C+LEW +RS +CP+C + +   D
Subjt:  DACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKD

AT4G14220.1 RING-H2 group F1A9.0e-3738.02Show/hide
Query:  TSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKDPTSQELLEAVEQERSIRL-NPARSSTIFRHPTL
        +S+A  V     +  DDACSICLE F   DPST+TSCKHE+HLQC++EW QRS +CP+CWQ   L+DP SQELL AVE+ER ++  N + SS I  H + 
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Query:  GDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSHPNSSSASPPPGDNREGEAAPRIMVATISPPQPS-GEESP
         DF  +     +  +  +E+ L+HL  AA     R   RR   +  S        LV SS P  ++  P    N    +A   +    S P PS G  +P
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Query:  QLNASVSPVQTDQSSPSAPQPSSHSASQLGSPSSDRRSTSQPVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTRGWREKLFSRNTSMSDIGS
              SPV    S P+     S++ S++    S  RS+  P           E  S  +++KS+  A S +YK+SI+KS +G +EKL +RN S+ ++  
Subjt:  QLNASVSPVQTDQSSPSAPQPSSHSASQLGSPSSDRRSTSQPVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTRGWREKLFSRNTSMSDIGS

Query:  EVRREVNAGIATVSRMMERLETRDTRKSSSPESS
         V+RE+NAGIA V+RM+ER++    R   S   S
Subjt:  EVRREVNAGIATVSRMMERLETRDTRKSSSPESS

AT5G22000.1 RING-H2 group F2A1.1e-11463.56Show/hide
Query:  ETKKSEAHLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKDPTSQELLEAVEQERSIRLNPARSS
        ET  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ ISLKDPTSQELLEAVEQER+ R NP R++
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Query:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSHPNSSSASPPPGDNREGEAAPRIMVATIS--P
        TIFRHPTLGDFELQHLP G ++A++EERI+QHLAAAAAMG+ARH  RREGHR RS   G  Q +VFSS PN+S  SPPP        + R    T+S  P
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Query:  PQPSGEESPQLNASVSPVQTDQSSPSAPQPSSHSASQLGSPSSDRRSTSQPVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTRGWREKLFSR
            GE S Q N       T   + S P+  S SAS      S+ R  +Q  P+ QDRAGPSELQSFS+SLKSR NA+S RYK+SI+K+TR W+++LFSR
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Query:  NTSMSDIGSEVRREVNAGIATVSRMMERLETRDTRKSSSPESSNVADNSPVSESNNTQTPENGGN
        NTSM+D+GSEV+REV+AGIATVSRMMERLETR+  + S+   S+V++N    E+NN       G+
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AT5G22000.2 RING-H2 group F2A4.1e-11463.46Show/hide
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        T  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ ISLKDPTSQELLEAVEQER+ R NP R++T
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Query:  IFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSHPNSSSASPPPGDNREGEAAPRIMVATIS--PP
        IFRHPTLGDFELQHLP G ++A++EERI+QHLAAAAAMG+ARH  RREGHR RS   G  Q +VFSS PN+S  SPPP        + R    T+S  P 
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Query:  QPSGEESPQLNASVSPVQTDQSSPSAPQPSSHSASQLGSPSSDRRSTSQPVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTRGWREKLFSRN
           GE S Q N       T   + S P+  S SAS      S+ R  +Q  P+ QDRAGPSELQSFS+SLKSR NA+S RYK+SI+K+TR W+++LFSRN
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Query:  TSMSDIGSEVRREVNAGIATVSRMMERLETRDTRKSSSPESSNVADNSPVSESNNTQTPENGGN
        TSM+D+GSEV+REV+AGIATVSRMMERLETR+  + S+   S+V++N    E+NN       G+
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AT5G22000.3 RING-H2 group F2A1.1e-11463.56Show/hide
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        ET  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ ISLKDPTSQELLEAVEQER+ R NP R++
Subjt:  ETKKSEAHLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKDPTSQELLEAVEQERSIRLNPARSS

Query:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSHPNSSSASPPPGDNREGEAAPRIMVATIS--P
        TIFRHPTLGDFELQHLP G ++A++EERI+QHLAAAAAMG+ARH  RREGHR RS   G  Q +VFSS PN+S  SPPP        + R    T+S  P
Subjt:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSHPNSSSASPPPGDNREGEAAPRIMVATIS--P

Query:  PQPSGEESPQLNASVSPVQTDQSSPSAPQPSSHSASQLGSPSSDRRSTSQPVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTRGWREKLFSR
            GE S Q N       T   + S P+  S SAS      S+ R  +Q  P+ QDRAGPSELQSFS+SLKSR NA+S RYK+SI+K+TR W+++LFSR
Subjt:  PQPSGEESPQLNASVSPVQTDQSSPSAPQPSSHSASQLGSPSSDRRSTSQPVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTRGWREKLFSR

Query:  NTSMSDIGSEVRREVNAGIATVSRMMERLETRDTRKSSSPESSNVADNSPVSESNNTQTPENGGN
        NTSM+D+GSEV+REV+AGIATVSRMMERLETR+  + S+   S+V++N    E+NN       G+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTCTCCAACGATGGACGAAACTAAGAAATCTGAAGCGCATTTGACATCAGCTGCGGCTTTTGTCGAAGGTGGAATCCAGGATGCTTGTGATGACGCTTGCAGTAT
ATGTCTAGAAAACTTCTGTGATAGTGATCCTTCAACGATGACCAGTTGCAAGCATGAATTTCATCTGCAGTGCGTTCTTGAATGGTGTCAGAGAAGCTCCCAATGCCCCA
TGTGTTGGCAACCTATTAGCCTGAAGGATCCAACCAGCCAAGAGTTGCTCGAAGCAGTAGAACAAGAGAGAAGTATTAGACTTAATCCAGCTCGAAGCTCAACTATATTT
CGCCATCCCACTCTTGGTGACTTTGAGTTACAGCATCTACCGGCTGGTGCTAATGATGCTGATCTTGAAGAGCGTATACTCCAACACTTAGCTGCAGCAGCTGCCATGGG
ACAAGCTCGCCATAGTGCTAGAAGGGAAGGCCACAGACATCGGTCTGGAATTCATGGCCGTCCCCAGTTGTTGGTGTTTTCTTCACATCCTAATTCTTCGTCGGCCTCTC
CACCTCCTGGTGACAATCGGGAAGGTGAAGCAGCCCCAAGAATCATGGTAGCTACTATATCACCACCTCAACCTTCAGGAGAAGAGTCCCCACAACTCAATGCTTCAGTA
TCTCCAGTGCAAACTGATCAGTCTTCTCCTTCAGCACCTCAACCCAGTTCACATTCTGCCAGCCAACTTGGATCTCCTTCAAGTGATAGGAGATCTACCAGTCAACCAGT
GCCAAATAGTCAAGATAGAGCCGGACCATCAGAGTTACAATCATTCTCAGATTCTCTAAAGTCTCGATTTAATGCAATGTCAATGAGATACAAAGATTCAATCACAAAGA
GCACAAGAGGCTGGAGGGAGAAATTATTCTCTCGCAACACTTCAATGTCAGATATTGGCTCTGAAGTTAGAAGAGAGGTTAATGCAGGGATAGCAACGGTATCACGCATG
ATGGAACGTCTTGAAACGAGAGATACTAGAAAAAGTAGCAGTCCTGAGTCCAGTAATGTAGCAGATAATAGCCCGGTTTCAGAATCAAATAACACACAGACACCAGAGAA
TGGAGGAAACAATCCTTTGAGTGGCTCAAGTAAAGAAGGGCCACGCCCTGCAGAATCCAGTTCAAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGCAACTAGTAAAAGCTCTTAAAACTCTTCCACGCGTTCCGTTAAAATCCCATCATAATTTCATTCTTACATACTGAGCCGATGACCAACCAAACAAACTCAGCTCTCAG
CAGCAACAACAACAGCAGCAGCCTTTTCTCAAGTCAAGACCGGAGCCAATTCTCTTCTTCTTCTTCCTATTCCTCTCCCTAGGGTTCCACCGATTCCAATCCAATTTCAT
TTTCCACTTCGCTTCCAGGATTCTCCTGCTGATCGTCGTTTCTCATGGAGTCTCCAACGATGGACGAAACTAAGAAATCTGAAGCGCATTTGACATCAGCTGCGGCTTTT
GTCGAAGGTGGAATCCAGGATGCTTGTGATGACGCTTGCAGTATATGTCTAGAAAACTTCTGTGATAGTGATCCTTCAACGATGACCAGTTGCAAGCATGAATTTCATCT
GCAGTGCGTTCTTGAATGGTGTCAGAGAAGCTCCCAATGCCCCATGTGTTGGCAACCTATTAGCCTGAAGGATCCAACCAGCCAAGAGTTGCTCGAAGCAGTAGAACAAG
AGAGAAGTATTAGACTTAATCCAGCTCGAAGCTCAACTATATTTCGCCATCCCACTCTTGGTGACTTTGAGTTACAGCATCTACCGGCTGGTGCTAATGATGCTGATCTT
GAAGAGCGTATACTCCAACACTTAGCTGCAGCAGCTGCCATGGGACAAGCTCGCCATAGTGCTAGAAGGGAAGGCCACAGACATCGGTCTGGAATTCATGGCCGTCCCCA
GTTGTTGGTGTTTTCTTCACATCCTAATTCTTCGTCGGCCTCTCCACCTCCTGGTGACAATCGGGAAGGTGAAGCAGCCCCAAGAATCATGGTAGCTACTATATCACCAC
CTCAACCTTCAGGAGAAGAGTCCCCACAACTCAATGCTTCAGTATCTCCAGTGCAAACTGATCAGTCTTCTCCTTCAGCACCTCAACCCAGTTCACATTCTGCCAGCCAA
CTTGGATCTCCTTCAAGTGATAGGAGATCTACCAGTCAACCAGTGCCAAATAGTCAAGATAGAGCCGGACCATCAGAGTTACAATCATTCTCAGATTCTCTAAAGTCTCG
ATTTAATGCAATGTCAATGAGATACAAAGATTCAATCACAAAGAGCACAAGAGGCTGGAGGGAGAAATTATTCTCTCGCAACACTTCAATGTCAGATATTGGCTCTGAAG
TTAGAAGAGAGGTTAATGCAGGGATAGCAACGGTATCACGCATGATGGAACGTCTTGAAACGAGAGATACTAGAAAAAGTAGCAGTCCTGAGTCCAGTAATGTAGCAGAT
AATAGCCCGGTTTCAGAATCAAATAACACACAGACACCAGAGAATGGAGGAAACAATCCTTTGAGTGGCTCAAGTAAAGAAGGGCCACGCCCTGCAGAATCCAGTTCAAG
TTGAATATTCTCAGAATTGGCTTCACTCAAAGGCCATCTTATATGAGGTGAATACTGCATTTGATTGTTTCCCTCTTCCATATGTACAAGAAATGCCAGTAGTAGACTGA
TGTCATAAAAAATTGGAAAAAAAACCTTCAAAATATTCACAAAAATGACCAAAATTTAGTTTATTTTATAATTAGTTAAGAGTAAATTTAAATATTAGTCACTGTATCAT
TGATAACTAGTAATAAAATAGCTTATTTACTCGTAAATTGAAAATATCATAGTTGGAATCGCCCTTGATAGAAGTAGTGGTAGGCTTCTTCACCTTTACTAGTGTCCTAA
TTTGGTAGGTGATTCGAAGGAGAAACTTGTACATTGTATGAAATAATGAGTTTGTAGGTTAGACCGTATTGGAGGACGAATCGTCGAGATTCAGTTCGGTCCCGAATTGG
TCGTTGGAAGTATACTATTTCCTCCTGGTTTCTTCTGATGAAAGGGAAAAATGTGCCAACTACCAGTGAGTTGAACCACTGCTGTCATTAGGTTTCACATGGGTCTCATG
CTATTTGTAGAATATCTTGTCTTTTATAATGCCTTTTTTGCTTGTGAAACCAAATGCACTGTTCTCTTTGTATATGCGAAGGAGCTTTCGTATATGTGTTTCTAGATATT
CCTTGTATATTTTGTTTTAGATAAAAGAGTTCCTCTAATTCTATAATTTTTTTTTTTTTTTTTTGATAATGCACTTTTCTAGAAGAAGTTTCTGGAGTGGCTAGTATTCC
ACCAATTAGTGGCCCAAGATTTTAGACTTTTATTAAGACGTGAATCCACCCAGAAAAAAAGTGAATCATTAGGTAGCTGACTGAGGAGTGAGGACATTCTATTTTGTCAA
TTTCTCCTAGTGCAAGCAATTTTGGATCTTGATGTAAGATTATAGATTGTTAAAAAAAAAAATGAATAAACATTGTTGTTCTCTTGAGATTCTTTTTGTTAACCCCATTG
AATGGGCTCTTGGATCTTGGATTCAACCTACTGGCCATTGGTCCTTGAACTTATTTCTTGCGGTTGGAATTTGGTGAACATTTGGAAGTTTGGGGAAAGATGATGTTTAT
TTTTATCCATGGTTGATGGAGTATGGAGATTTGAACTTCCAACGCAAAGGAAAGAAATACAAATACAGTTCAATTATTGTTGAGTTATATTTATTTTAGGCAAAAAAAAA
AAATTATTTGTTTGGTTGTACAAGACATTTTGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESPTMDETKKSEAHLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKDPTSQELLEAVEQERSIRLNPARSSTIF
RHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGQARHSARREGHRHRSGIHGRPQLLVFSSHPNSSSASPPPGDNREGEAAPRIMVATISPPQPSGEESPQLNASV
SPVQTDQSSPSAPQPSSHSASQLGSPSSDRRSTSQPVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTRGWREKLFSRNTSMSDIGSEVRREVNAGIATVSRM
MERLETRDTRKSSSPESSNVADNSPVSESNNTQTPENGGNNPLSGSSKEGPRPAESSSS