; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0014083 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0014083
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionDUF4050 domain-containing protein
Genome locationLG08:2190062..2193425
RNA-Seq ExpressionTan0014083
SyntenyTan0014083
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025124 - Domain of unknown function DUF4050


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_016903413.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503177 isoform X1 [Cucumis melo]2.2e-6680.25Show/hide
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XP_038889429.1 uncharacterized protein LOC120079339 isoform X1 [Benincasa hispida]3.0e-6883.33Show/hide
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XP_038889430.1 uncharacterized protein LOC120079339 isoform X2 [Benincasa hispida]6.8e-6886.11Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFZ6 Uncharacterized protein2.5e-6883.33Show/hide
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A0A1S3CQL1 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X28.6e-6984Show/hide
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A0A1S4E5A2 uncharacterized protein LOC103503177 isoform X11.1e-6680.25Show/hide
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A0A6J1G589 uncharacterized protein LOC1114508504.0e-6680.67Show/hide
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A0A6J1KGB3 uncharacterized protein LOC1114936405.2e-6680Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15350.1 unknown protein1.4e-1031.93Show/hide
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        K F + IPL+  + F+ ++
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AT1G15350.2 unknown protein1.4e-1031.93Show/hide
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        + PS+S+DFWSTST D+D  +T  S+ +   S  +++        N     +++N G +LW QTR RW+   +P      +    L+W   T + LL S 
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        K F + IPL+  + F+ ++
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AT4G32342.1 unknown protein3.0e-1337.07Show/hide
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         + IPL   +HF+ ++
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AT5G25360.1 unknown protein1.7e-1634.39Show/hide
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        WI +   C+G       KP   ++      G  +  R+   PS+S+DFWSTSTC++D       R  S IS T    N+   + + SN ++F+NHG  LW
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         QTR +W+ N    K+ +    T +SW  T E LL   K F R IPL   + F+ ++
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AT5G25360.2 unknown protein1.7e-1634.39Show/hide
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         QTR +W+ N    K+ +    T +SW  T E LL   K F R IPL   + F+ ++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGACGCGAGAGAGCTGGTTTTCCGTTTGGATCGATCGATTTCTCTCTTGTTTGGGGAGCACTAAACCTGCACCTGCTATCTCTGGGAATAATCTGAATTCTAGGAT
GCCAAGCATGTCAGATGATTTTTGGAGTACAAGCACGTGTGATCTCGATGAGTTGCTTACTCTTCAATCTCGACAGAACTCATTTATCAGCACAACAAGCTACAACCCTA
ATCATGGAGGTGGCACTGACAATTTGAGCAATCATTCTGACTTTATAAATCATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCAGGCTTCGATGGATTGAAAATCGTGAGCCTCCT
AAACGAACCAGAAAAAGTCATTTTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAAGAACTCTTGCTGGAAAGCAAAAAACCTTTTCATCGGCGCATACCTTTATCTGTAAGTCT
TCATTTTGTCTGTAATCTGGTGTTTTCTTTAGTTGACTACACTACACATTCAAATCCTCTGCTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAGGAAGAAGAAGAAGATGAATATGGTTTCGGTTGTTAATGTTAACTGCTATTAACGGTACGAAATTACTGATTACCAAATGGATTCCGTAAAGTTTCAATGGAAGTCA
CGATCACAATGATATCCAATCCAATTATACCTTGTTTATCCTATCCTATTCGGTATTAGGGATTTCGATTTCGATTTTTCGACTTCGATTTCGATTCCAATTCCTATTTC
GATTTCGATTTCGGCATGTTTCTGTGTTTTGATGTTTTTAATCTGATTCTTCGCCAAATATGGTGACGCGAGAGAGCTGGTTTTCCGTTTGGATCGATCGATTTCTCTCT
TGTTTGGGGAGCACTAAACCTGCACCTGCTATCTCTGGGAATAATCTGAATTCTAGGATGCCAAGCATGTCAGATGATTTTTGGAGTACAAGCACGTGTGATCTCGATGA
GTTGCTTACTCTTCAATCTCGACAGAACTCATTTATCAGCACAACAAGCTACAACCCTAATCATGGAGGTGGCACTGACAATTTGAGCAATCATTCTGACTTTATAAATC
ATGGTTTTGTTCTTTGGACTCAGACCAGGCTTCGATGGATTGAAAATCGTGAGCCTCCTAAACGAACCAGAAAAAGTCATTTTACAGGATTAAGTTGGTATATGACTAAA
GAACTCTTGCTGGAAAGCAAAAAACCTTTTCATCGGCGCATACCTTTATCTGTAAGTCTTCATTTTGTCTGTAATCTGGTGTTTTCTTTAGTTGACTACACTACACATTC
AAATCCTCTGCTTTGAATATGTAACCATGATACAATTGACAGGAAATGGTAGACTTTCTGGTAGAAGAATGGGAAGAAGAAGGGCTGTATTATTGAACTAGTCAATCGAA
AACCATCACCTTGTGCATACACCATGTTTATGACTTTTTCGAAGTTTAATTAAACGGCTACCGCCTTAACTTGGGATCAATTCGGTATAAGTTAACATACAAAATGACAT
CACCTGGTTTGCTAACCTTTTCTATTGGTACATTGGAGACCTCTAGGAGAGGGGACAAGTGTGAAATAACCCGAAATCCAAGATCTTCTGAGTGATCAGCGAGCTAAATG
GTGAGCCTCCTCCGACCATCAGCTAATATATACTTCGTATACATACATATCAAGCTTTCTTCATCGTTTCTTCTTTGCATGACAGTAGTTTAAAATATGCAGAAGCATCA
ACTTTGCAGTGTGTTTGATGCAATGTTGATGATTGACTTGTTATAATTGATGTAAGAGAATCGTTATCAATTAATCTCTAAAACAAACTCCCTTGTTTTGAATTCTGATA
ATACTGATCTTGATTTTGTGATGATATTGCTGTCAACTTTGAGTTGGATGGTAGAGAGCAAATAATAGACAAAGTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVTRESWFSVWIDRFLSCLGSTKPAPAISGNNLNSRMPSMSDDFWSTSTCDLDELLTLQSRQNSFISTTSYNPNHGGGTDNLSNHSDFINHGFVLWTQTRLRWIENREPP
KRTRKSHFTGLSWYMTKELLLESKKPFHRRIPLSVSLHFVCNLVFSLVDYTTHSNPLL