; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0014145 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0014145
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionprotodermal factor 1-like
Genome locationLG05:4695046..4696192
RNA-Seq ExpressionTan0014145
SyntenyTan0014145
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR039923 - Protodermal factor 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604731.1 Protodermal factor 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.6e-11086.9Show/hide
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XP_022947015.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita moschata]9.3e-11187.3Show/hide
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XP_022970795.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita maxima]1.4e-11186.67Show/hide
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XP_023534009.1 protodermal factor 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-10985.49Show/hide
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XP_038900371.1 protodermal factor 1-like [Benincasa hispida]1.2e-11089.8Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KF76 Uncharacterized protein1.4e-10484.36Show/hide
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A0A1S3C4A9 protodermal factor 1-like9.0e-10484.77Show/hide
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A0A5A7UHX0 Protodermal factor 1-like9.0e-10484.77Show/hide
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        NRFP+TTKQVR+SFVSALSSN+AA DQAN FKLANEGKIK  A
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A0A6J1G5M6 protodermal factor 1-like4.5e-11187.3Show/hide
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        M+TKQAS LL+TLLAGLLS SLLIPVLSTTIADQK+YYSPPDPH+GTPPTGSHSN PIPPSHGYGGTPPH+STPTPSTP+K PSGG GYYNPP SGGS P
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A0A6J1I3W1 protodermal factor 1-like6.9e-11286.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9S728 Protodermal factor 18.3e-4645.54Show/hide
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        S  ++ L A LLS  L   V S    D KTYY SPP    GTPP                   T SH +PP                             
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            PPSH    TP H STP+  TPS PPS  GGYY+ P        +PP+  VDPGTP    +P T    P TPGTP IP+ PF     TC+YW NHP 
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Query:  MIWGVLGWWGTLGNCFGA----TNVPGFGTNLNLLQALSNTRTDGFGALLREGTASYLNSLASNRFPFTTKQVRSSFVSALSSNRAAADQANIFKLANEG
        +IWG+LGWWGT+G  FG     +++PGF  ++NLLQALSNTR+D  GAL REGTAS+LNS+ +++FPFTT QVR  FV+ LSSN+AA  QA+ FKLANEG
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Query:  KIK
        ++K
Subjt:  KIK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42840.1 protodermal factor 15.9e-4745.54Show/hide
Query:  SALLYTLLAGLLSHSLLIPVLSTTIADQKTYY-SPPDPHSGTPP-------------------TGSHSNPP-----------------------------
        S  ++ L A LLS  L   V S    D KTYY SPP    GTPP                   T SH +PP                             
Subjt:  SALLYTLLAGLLSHSLLIPVLSTTIADQKTYY-SPPDPHSGTPP-------------------TGSHSNPP-----------------------------

Query:  ---IPPSHGYGGTPPHHSTPTPSTPSKPPSGGGGYYNPPSSGG----SPPTTPVDPGTP---STPST----PSTPGTPSIPSTPF-----TCNYWLNHPG
            PPSH    TP H STP+  TPS PPS  GGYY+ P        +PP+  VDPGTP    +P T    P TPGTP IP+ PF     TC+YW NHP 
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Query:  MIWGVLGWWGTLGNCFGA----TNVPGFGTNLNLLQALSNTRTDGFGALLREGTASYLNSLASNRFPFTTKQVRSSFVSALSSNRAAADQANIFKLANEG
        +IWG+LGWWGT+G  FG     +++PGF  ++NLLQALSNTR+D  GAL REGTAS+LNS+ +++FPFTT QVR  FV+ LSSN+AA  QA+ FKLANEG
Subjt:  MIWGVLGWWGTLGNCFGA----TNVPGFGTNLNLLQALSNTRTDGFGALLREGTASYLNSLASNRFPFTTKQVRSSFVSALSSNRAAADQANIFKLANEG

Query:  KIK
        ++K
Subjt:  KIK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAAACCAAACAAGCTTCTGCTCTCCTTTACACTTTGCTTGCTGGCCTGCTTTCTCACAGCCTGCTCATCCCTGTACTCTCCACCACCATTGCTGACCAGAAAACCTA
TTATTCTCCTCCAGACCCACATTCTGGAACTCCCCCAACAGGTTCACACAGCAACCCTCCCATTCCACCATCACATGGCTATGGAGGCACACCGCCGCATCACTCAACGC
CAACCCCTTCGACACCGTCGAAGCCTCCGTCTGGTGGAGGTGGATACTACAACCCTCCATCATCTGGTGGTAGCCCACCAACCACCCCTGTAGATCCAGGCACTCCAAGC
ACTCCAAGCACTCCAAGCACACCAGGCACACCAAGCATTCCCTCTACTCCATTTACCTGCAATTATTGGCTGAATCACCCAGGAATGATATGGGGAGTATTGGGATGGTG
GGGAACGTTGGGAAATTGCTTTGGAGCAACCAATGTACCAGGATTTGGAACAAATCTCAACTTGCTCCAAGCACTTTCAAACACAAGGACTGATGGGTTTGGGGCTCTTT
TAAGAGAAGGCACTGCTTCGTACCTCAACTCTCTTGCCAGTAACAGATTCCCCTTCACAACCAAGCAAGTTAGATCGAGTTTTGTCTCGGCACTTAGCTCCAACAGAGCA
GCAGCAGATCAGGCCAACATCTTCAAACTAGCCAACGAGGGGAAAATTAAGTCCACAGCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAACAGCAACTAACCACATACTCTTCCACCTGTAAGAAGTAACTTCACTTCTCCTCTAAACTCCCTCTATATATTCCTCTTTGTTCCAAACATTCCATCCACCATTAGC
CTTCTTTCTTTCCCATTTCCATATCCCTTTTGCTCCAAAGCTGAAATATAGCAGAAGAAGCCATGAAAACCAAACAAGCTTCTGCTCTCCTTTACACTTTGCTTGCTGGC
CTGCTTTCTCACAGCCTGCTCATCCCTGTACTCTCCACCACCATTGCTGACCAGAAAACCTATTATTCTCCTCCAGACCCACATTCTGGAACTCCCCCAACAGGTTCACA
CAGCAACCCTCCCATTCCACCATCACATGGCTATGGAGGCACACCGCCGCATCACTCAACGCCAACCCCTTCGACACCGTCGAAGCCTCCGTCTGGTGGAGGTGGATACT
ACAACCCTCCATCATCTGGTGGTAGCCCACCAACCACCCCTGTAGATCCAGGCACTCCAAGCACTCCAAGCACTCCAAGCACACCAGGCACACCAAGCATTCCCTCTACT
CCATTTACCTGCAATTATTGGCTGAATCACCCAGGAATGATATGGGGAGTATTGGGATGGTGGGGAACGTTGGGAAATTGCTTTGGAGCAACCAATGTACCAGGATTTGG
AACAAATCTCAACTTGCTCCAAGCACTTTCAAACACAAGGACTGATGGGTTTGGGGCTCTTTTAAGAGAAGGCACTGCTTCGTACCTCAACTCTCTTGCCAGTAACAGAT
TCCCCTTCACAACCAAGCAAGTTAGATCGAGTTTTGTCTCGGCACTTAGCTCCAACAGAGCAGCAGCAGATCAGGCCAACATCTTCAAACTAGCCAACGAGGGGAAAATT
AAGTCCACAGCCTGAACCCGCCCTCTGCCTTACCAGTTACCAACTTAATAATTAATGAGTGTGTGCCTTAGCAGTTAGTAGTGACTAGTGAGACAGTGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKTKQASALLYTLLAGLLSHSLLIPVLSTTIADQKTYYSPPDPHSGTPPTGSHSNPPIPPSHGYGGTPPHHSTPTPSTPSKPPSGGGGYYNPPSSGGSPPTTPVDPGTPS
TPSTPSTPGTPSIPSTPFTCNYWLNHPGMIWGVLGWWGTLGNCFGATNVPGFGTNLNLLQALSNTRTDGFGALLREGTASYLNSLASNRFPFTTKQVRSSFVSALSSNRA
AADQANIFKLANEGKIKSTA