| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
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| XP_004152633.3 RNA-binding protein 38 [Cucumis sativus] | 1.4e-115 | 84.93 | Show/hide |
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SGGRNQIGN QST+ AAAGSYGGLRPPFPPPQ +IFP YRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQ+QQPQ+YQQSPS SPSSSS YY Y YGY SSSPSSSQ
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R FS PP S SYFPYYTNYTHM QGL+YTPM QIITPS TGWQTPQHTPTETEAGASGSNSPNTS
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| XP_008444844.1 PREDICTED: RNA-binding protein 38-like [Cucumis melo] | 2.2e-116 | 85.35 | Show/hide |
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NHPPPF GDTTWTK+FVGGLAWETQS EMHSFFQ FG ILEAVII+DK+TGKSKGYGFVTF+DPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPP P
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SGGRNQIGN QSTS AAAGSYGGLRPPFPPPQ +IFP YRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQ+QQPQ+YQQSPS SPSSSS YY YGYGY SSSPSSSQ
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R FS PP S SYFPYYTNYTHM Q GL YTPM QIITPS TGWQTPQHTPTETEAGASGSNSPNTS
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| XP_022961976.1 RNA-binding protein 38-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 4.5e-98 | 71.63 | Show/hide |
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PPPPP GGRNQIGN Q+TS AAAGSYGGL PP PPP ++FP +YRYRSYAPNYT+PYHQAIYNPQLQ QLY Q SP SSSY YGYG
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Y SSS SP + P+ G P S SS SYFPYYTNYTHM Q L Y MHQI TP+TG Q +PTETE GASGSN+PNT
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| XP_023546076.1 RNA-binding protein 38-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.7e-98 | 71.13 | Show/hide |
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PPPPP GGRNQIGN Q+ S AAAGSYGGL PP PPP ++FP +YRYRSYAPNYT+PYHQAIYNPQLQ QLYQ SP SSSY YGYG
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YGY SS SP + P+ GP S SS SYFPYYTNYTHM Q L Y MHQI TP+TG Q +PTETE GASGSN+PNT
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| XP_038884547.1 RNA-binding protein 38-like [Benincasa hispida] | 4.8e-116 | 83.45 | Show/hide |
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MAD+ S N P PPF GDTTWTK+FVGGLAWETQS EMHSFFQ FG ILEAVII+DK+TGKSKGYGFVTF+DPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAF
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GRPRPPP P SGGRNQ GN QST+ A AGSYGGLRPPFPPPQ +IFP YRYRSYAPNYTVPY QAIYNPQLQQPQ+YQQSPSSSPSSSSYY+GYGY
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SS SSSQ RG FS SS SYFPYYTNYTHM QGL YTPMHQIITPSTGWQTPQHTPTETEAGASGSNSPNTS
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A0A0LLP2 RRM domain-containing protein | 6.8e-116 | 84.93 | Show/hide |
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SGGRNQIGN QST+ AAAGSYGGLRPPFPPP P+IFP YRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQ+QQPQ+YQQSPS SPSSSS YY Y YGY SSSPSSSQ
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| A0A1S3BBB0 RNA-binding protein 38-like | 1.0e-116 | 85.35 | Show/hide |
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| A0A6J1HBJ1 RNA-binding protein 38-like isoform X2 | 3.1e-92 | 69.2 | Show/hide |
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PPPPP GGRNQIGN Q+TS AAAGSYGGL PP PPP ++FP +YRYRSYAPNYT+PYHQA QLY Q SP SSSY YGYG
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Y SSS SP + P+ G P S SS SYFPYYTNYTHM Q L Y MHQI TP+TG Q +PTETE GASGSN+PNT
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| A0A6J1HBU2 RNA-binding protein 38-like isoform X1 | 2.2e-98 | 71.63 | Show/hide |
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PPPPP GGRNQIGN Q+TS AAAGSYGGL PP PPP ++FP +YRYRSYAPNYT+PYHQAIYNPQLQ QLY Q SP SSSY YGYG
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Y SSS SP + P+ G P S SS SYFPYYTNYTHM Q L Y MHQI TP+TG Q +PTETE GASGSN+PNT
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| A0A6J1KAW8 RNA-binding protein 38-like | 3.2e-89 | 66.55 | Show/hide |
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PPPPP GGRNQIGN +TS AAA S+GGL P+ PPP ++FP +YRYRSYAPNYT+PYH QPQLYQQSP SS YGY
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YGY SSS S + GP S SS SYFPYYTNYTHM Q L Y MH I TP TG Q +PTETE GASGSN+PNT
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| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q62176 RNA-binding protein 38 | 6.1e-21 | 39.46 | Show/hide |
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DTT+TK+FVGGL + T + +F+ FG I EAV+I D+ TGKS+GYGFVT D +A RAC +PNPII GR+AN N+A G +P +G +G
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Query: PQSTSLAAAGSYGGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNP-----QLQQPQLYQQSP-SSSPSSSSYYYGYGY
Q +Y GL P + P ++ PS + P+ + PY + Y P P Y Q P ++SP++++ + GYGY
Subjt: PQSTSLAAAGSYGGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNP-----QLQQPQLYQQSP-SSSPSSSSYYYGYGY
|
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| Q6DIV4 RNA-binding protein 38 | 1.1e-19 | 33.94 | Show/hide |
Query: DTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPPPPSGGRNQIGN
DTT+TK+FVGGL + T + +F+ FG I EAV+I D+ TGKS+GYGFVT D +A RAC +PNPII GR+AN N+A G
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Query: PQSTSLAAAGSYGGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQL----------------YQQSPSSSPSSSSYYYGYGYGYSSS
P++ A L P F + P Y Y P+ +P P LQ P + Y+Q P ++ S ++ Y GYGY +
Subjt: PQSTSLAAAGSYGGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQL----------------YQQSPSSSPSSSSYYYGYGYGYSSS
Query: SPSSSQPLRGPFSSPPSS
P S+ +PP++
Subjt: SPSSSQPLRGPFSSPPSS
|
|
| Q76LC6 RNA-binding protein 24 | 8.8e-20 | 35.07 | Show/hide |
Query: DTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFG-RPRPPPPPSGGRNQIG
DTT+TK+FVGGL + T + +F+ FG+I EAV+I D+ TGKS+GYGFVT D +A RAC +PNPII GR+AN N+A G +PR
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Query: NPQSTSLAAAGSYGGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSY--YYGYGYG-YSSSSPSSSQPL--RG
++P F P I P++ R +Y P QA P + P + Q + +S+ +SS Y Y G Y Y+S++ +++ +
Subjt: NPQSTSLAAAGSYGGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSY--YYGYGYG-YSSSSPSSSQPL--RG
Query: PFSSPPSSSSY
P+++ P+++ Y
Subjt: PFSSPPSSSSY
|
|
| Q9H0Z9 RNA-binding protein 38 | 1.4e-20 | 39.46 | Show/hide |
Query: DTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPPPPSGGRNQIGN
DTT+TK+FVGGL + T + +F+ FG I EAV+I D+ TGKS+GYGFVT D +A RAC +PNPII GR+AN N+A G +P +G IG
Subjt: DTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPPPPSGGRNQIGN
Query: PQSTSLAAAGSYGGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNP-----QLQQPQLYQQSP-SSSPSSSSYYYGYGY
Q +Y GL P + P ++ PS + P+ + PY + Y P P Y Q P ++SP++++ + GY Y
Subjt: PQSTSLAAAGSYGGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNP-----QLQQPQLYQQSP-SSSPSSSSYYYGYGY
|
|
| Q9M1S3 Probable RNA-binding protein ARP1 | 5.2e-20 | 35.45 | Show/hide |
Query: FGDTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAF-GRPRPPPPPSGGRNQ
FGDT TKVFVGGLAW+T E M+ F +G ILEAVII DK T +SKGYGFVTF+D ++A RAC + PII GRRANCN+A+ GR R P + +
Subjt: FGDTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAF-GRPRPPPPPSGGRNQ
Query: IGNPQSTSLAAAGSY-------GGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYT----VPYHQAIY-NPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSYYYGYGYGYSSSS
N + G++ G P Y Y APN T V Y Y N Q Q P S P YY+ + YG
Subjt: IGNPQSTSLAAAGSY-------GGLRPPFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYT----VPYHQAIY-NPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSYYYGYGYGYSSSS
Query: PSSSQPLRGPFSSPPSSSSYFPYYTNYTHMHQGLLYTPMHQIITPSTGWQTPQHTPTETEAGASGSNS
++ P+ P+YT Y + HQ I P + P T +G G S
Subjt: PSSSQPLRGPFSSPPSSSSYFPYYTNYTHMHQGLLYTPMHQIITPSTGWQTPQHTPTETEAGASGSNS
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|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G20880.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.1e-38 | 42.91 | Show/hide |
Query: HFSNHPPPFGDTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPP-
H+ N PFGDTT+TKVFVGGLAWETQSE + F +G ILEAV+I DKNTG+SKGYGFVTFRDPE+ARRAC +P PII GRRANCN+A+ GR RPP
Subjt: HFSNHPPPFGDTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPP-
Query: ----PPSGGRNQIGNPQSTSL-AAAGSYGGLRPPFPPP-----QPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSYYYG---
P + GR + +P S+ + G + G P PP Q V++P Y Y P+Y Q Y P + Q L + +S Y YG
Subjt: ----PPSGGRNQIGNPQSTSL-AAAGSYGGLRPPFPPP-----QPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSYYYG---
Query: ------YGY--GYSSSSPSSSQPLRGPFSSPPSSSSYFPYYTNYTHMHQGLLYTPMHQIITPSTGWQT
+GY G S P S G ++ P S+ PY + HQ ++ Q I S QT
Subjt: ------YGY--GYSSSSPSSSQPLRGPFSSPPSSSSYFPYYTNYTHMHQGLLYTPMHQIITPSTGWQT
|
|
| AT1G22330.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.6e-45 | 45.19 | Show/hide |
Query: SNHPPPFGDTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPPPPS
S + PFGDTT TKVFVGGLAWET ++EM +F FG+ILEAVII DK TGKSKGYGFVTFRD +SA RA A+PNP+I GR+ANCNIA+FGRPRP P
Subjt: SNHPPPFGDTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPPPPS
Query: GGRNQIGNPQSTSLAAAGSYGGLRPPF--PPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSYYYGYGYGYSSSSPSSSQ
GR Q G+P SY G+ P +++PSY Y Y N YHQA+YN QLQQ Q YQQ YG G ++SPSSS
Subjt: GGRNQIGNPQSTSLAAAGSYGGLRPPF--PPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSYYYGYGYGYSSSSPSSSQ
Query: PLRGP--FSSPPSSSSYFPYYTNYT-HMHQGLLYTPMHQIITPSTGWQTPQHTPTETEAGASGSNSPNTS
+ P + PS Y + +Y H HQ ++ + S+ P + T + S P +S
Subjt: PLRGP--FSSPPSSSSYFPYYTNYT-HMHQGLLYTPMHQIITPSTGWQTPQHTPTETEAGASGSNSPNTS
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|
| AT1G76460.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.9e-41 | 46.84 | Show/hide |
Query: HFSNHPPPFGDTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPPP
H+ N PFGDTT+TKVFVGGLAWETQSE + F+ +G+ILEAV+I DKNTG+SKGYGFVTFRDPE+ARRACA+P PII GRRANCN+A+ GRPRPP P
Subjt: HFSNHPPPFGDTTWTKVFVGGLAWETQSEEMHSFFQHFGQILEAVIIKDKNTGKSKGYGFVTFRDPESARRACANPNPIICGRRANCNIAAFGRPRPPPP
Query: PSGGRNQ----------IGNPQSTSLAAAGSYGGLRP-PFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSYYYGY--
+ N IGN Q + G+Y +P P+ Q V++P Y +Y P Y Q +Y+P + Q L + +S Y YG
Subjt: PSGGRNQ----------IGNPQSTSLAAAGSYGGLRP-PFPPPQPVIFPSYSYRYRSYAPNYTVPYHQAIYNPQLQQPQLYQQSPSSSPSSSSYYYGY--
Query: -----GYGYSS----SSPSSS-QPLRGPFSSPPSSSS
G+GY++ S P S L GP S ++SS
Subjt: -----GYGYSS----SSPSSS-QPLRGPFSSPPSSSS
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| AT1G78260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.3e-50 | 51.63 | Show/hide |
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S + PFGDTT+TKVFVGGLAWET ++EM +F+ FG+ILEAVII DKNTGKSKGYGFVTFR+ +SA RA A+PNP+I GR+ANCNIA+FGRPRP PP
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GR Q G+P +Y G+ P PP PQ +++PSY Y +Y P+ YHQA+YN QLQQ Q YQQ SPSSS ++ S YYYG
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Y Y + P P + FSSP PS+SS+ P
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| AT1G78260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 1.7e-50 | 48.16 | Show/hide |
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S + PFGDTT+TKVFVGGLAWET ++EM +F+ FG+ILEAVII DKNTGKSKGYGFVTFR+ +SA RA A+PNP+I GR+ANCNIA+FGRPRP PP
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GR Q G+P +Y G+ P PP PQ +++PSY Y +Y P+ YHQA+YN QLQQ Q YQQ SPSSS ++ S YYYG
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Y Y + P P + FSSP PS+SS+ P P+ +++ STG
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