; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0014288 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0014288
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationLG07:64748048..64751020
RNA-Seq ExpressionTan0014288
SyntenyTan0014288
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_008443563.1 PREDICTED: LOB domain-containing protein 25-like [Cucumis melo]1.5e-9097.74Show/hide
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]6.5e-9198.31Show/hide
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XP_022152200.1 LOB domain-containing protein 25-like [Momordica charantia]6.3e-9492.89Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]1.4e-9695.38Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein7.5e-10197.95Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like7.0e-9197.74Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like7.0e-9197.74Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like3.0e-9492.89Show/hide
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A0A6J1EL51 LOB domain-containing protein 25-like2.3e-8688.54Show/hide
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        YGCVGAISILQRQVIKLQ+ELDATNA+LIRYACSE+PAP  SSSSQYARRSSSTSH GSSSTSSYGHYY+GLYF       GPCGD HDKGE
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 67.1e-4063.87Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC PDCVFAPYFPP+ PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
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          +L +Y  +   A ++S+
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 28.4e-4152.33Show/hide
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        +S+ +NSPCAACKFLRRKC P+CVFAPYFPP++PQKFANVHK+FGASNV+KLLNE+ P QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCVG IS+LQ Q+ +LQ +
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        L    ++L +Y    I A +  S      +  +    ++T+   HY+   +F       G   P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.4e-5184.68Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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Query:  DATNADLIRYA
        + TNADL+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 67.1e-4063.87Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC PDCVFAPYFPP+ PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
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          +L +Y  +   A ++S+
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES3.4e-5082.61Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 259.8e-5384.68Show/hide
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Query:  DATNADLIRYA
        + TNADL+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.4e-5182.61Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Query:  ELDATNADLIRYACS
        ELDA NADL  Y  S
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.4e-5182.61Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Query:  ELDATNADLIRYACS
        ELDA NADL  Y  S
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.4e-5182.61Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Query:  ELDATNADLIRYACS
        ELDA NADL  Y  S
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.4e-5182.61Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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Query:  ELDATNADLIRYACS
        ELDA NADL  Y  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAACAACAGCTTACAGAAAGGAGGGAAAGGGAAAAAAATTATTGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGTGCAGCCTGCAAGTTTCTACGGCG
AAAATGCCTCCCGGATTGCGTTTTCGCCCCGTATTTCCCGCCGGAGGAGCCACAAAAGTTCGCCAACGTCCACAAGATCTTCGGCGCCAGCAATGTCAGCAAACTACTGA
ACGAAGTCCAACCGCACCAGCGGGAGGACGCCGTGAACTCGCTCGCCTATGAGGCCGAGGCGAGGATGAAAGACCCTGTCTATGGCTGCGTTGGTGCCATCTCCATCCTC
CAAAGGCAAGTCATCAAGCTCCAGAAAGAACTCGACGCCACCAACGCCGACCTCATTCGCTACGCCTGCAGTGAAATCCCCGCCCCGTCCTCGTCGTCACAATACGCTCG
GAGGTCGTCGTCGACGAGTCACGAGGGAAGCTCATCTACCTCTAGCTATGGCCACTACTATACTGGGCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACAATGGTCCTTGTGGAG
ATGGCCATGACAAAGGAGAATACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACCCTTTTGAAATGATCACTGTTTATGCAGGTTTTCTCTCTCCTTTATTCCATTAGGGTTTTTCTTTCTCTCTCTCACACATGTAACATTATTTAGGGATATCCCATAAA
TAAAGTTTGGTCCTTGTTTTTTTCTTCTCTTTCTCTCTCTTTCTATTTCTCTCTCTATATGGCTGCAACTTCATTTTCCTTAAGATTTTCATACAAGAGATGTTGAAACA
ACAGCTTACAGAAAGGAGGGAAAGGGAAAAAAATTATTGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGTGCAGCCTGCAAGTTTCTACGGCGAAAATGCCTCC
CGGATTGCGTTTTCGCCCCGTATTTCCCGCCGGAGGAGCCACAAAAGTTCGCCAACGTCCACAAGATCTTCGGCGCCAGCAATGTCAGCAAACTACTGAACGAAGTCCAA
CCGCACCAGCGGGAGGACGCCGTGAACTCGCTCGCCTATGAGGCCGAGGCGAGGATGAAAGACCCTGTCTATGGCTGCGTTGGTGCCATCTCCATCCTCCAAAGGCAAGT
CATCAAGCTCCAGAAAGAACTCGACGCCACCAACGCCGACCTCATTCGCTACGCCTGCAGTGAAATCCCCGCCCCGTCCTCGTCGTCACAATACGCTCGGAGGTCGTCGT
CGACGAGTCACGAGGGAAGCTCATCTACCTCTAGCTATGGCCACTACTATACTGGGCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACAATGGTCCTTGTGGAGATGGCCATGAC
AAAGGAGAATACAAGTAAATTTTTCCAAGATCATATCTTTATAATTTGATCATCACATGAGGGTTCTCAATATGTTGATATGGGTGTGAAATTTTATGTATTTTGATTAA
TAAATATAAGTGATAGTTACAAATCACACCTTTTCTAGTTTGTAAAAATTATATCTTTATGTTACAAAAATGGTTTCAAACATCCTTATAGTTTGCTAAATCTATAAAAT
TAACTGACATAAGGGTGTATATGATTTGCAAATCATAAGAGTGTTTGAAATCATTTTTAAAACCTAAAGATATGATTTTTAAATTATAGCCAAAAGTACAAAGGTGTAAT
TTGCAATTATCTTCATATATAAATTTAAACATATATAAATTTGTGTTGTATATTTTAAGGTTTGCCCATGCCCTTGTAGGGTTTGATCTCATCTAAAAATACCTCTTTGG
AATGATGAGGGGAGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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