CuGenDBv2

Gene ID	Tan0014372
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	Aldo_ket_red domain-containing protein
Genome location	LG05:17197466..17220109
RNA-Seq Expression	Tan0014372
Synteny	Tan0014372
Gene Ontology terms	GO:0019853 - L-ascorbic acid biosynthetic process (biological process) GO:0010349 - L-galactose dehydrogenase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR020471 - Aldo-keto reductase IPR036812 - NADP-dependent oxidoreductase domain superfamily

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG7011583.1 L-galactose dehydrogenase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_038888393.1 L-galactose dehydrogenase [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

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A0A0A0K290 Aldo_ket_red domain-containing protein

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A0A1S3C0W3 L-galactose dehydrogenase

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A0A5A7SPF2 L-galactose dehydrogenase

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A0A6J1GJU5 L-galactose dehydrogenase

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A0A6J1IA20 L-galactose dehydrogenase isoform X1

9.4e-31

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SwissProt top hits

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O81884 L-galactose dehydrogenase

1.6e-27

60.33

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Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT4G33670.1 NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein

1.1e-28

60.33

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        SA +AA AHCK K K I+KLA
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTTCCCTCGCCGCGCAGAACCAACCCACCCGACTTCTTCTTCTTCTTCGTCTTCTTCGGGTTCTATCGCCAGCGACACGCCAACCAACCAGTTGTTTTCTTCTTCTC
GCGCGCCTCTAATTTCCCCATCCGTCCTCTCCGTCGACCGACCAACACGAAAGCTAACGTCTTCTTCTTCGCATTTTTGCGCAGCATAAGCCGTGGGAATCCTCGTATTT
TTCGATCGGTTTCTTCGTGTTTCGCCAACACCTCTTTCGATTCTCTTCTCTTCTTCCACCACCGTCCCTGCTCTGGCCAGCTTCCTCGCGAAATTTCAGTCCGATATATT
GTTGATTCTTCAGGGAAGATGACAGGTAAGGGTTCGTTGAACAGCTGCAGCTTTGGAGGAATTCATGTTCTCTATGATAGAGAGTTTGAAACATTTTTTAGGAATTCATA
CTCTCTCTTCACCCAGATGCACACGCAAACAAACATAGCCATCGTTGTGAACGAGACGATTCATGCACTTCAAAAGCTGAAGGAAGCTGGGAAGACTCGTTTCATTGGTA
TTACAGGACTTCTATTGGAAATTTTTACGTATGTGCTTGATCGAGTACCACCTAGCTACATTGATGTGATTCTTTCATATTGTCACTACAGTCTTAACGACTCAACATTG
TTAGATTTGCTACCTTACTTGAAGATGATATTATTCTCCAATTTAAAATTGCTACAGTCTGCATGTCAAGCTGCAGCTGCTCATTGTAAAAAGAAAAGGAAGAATATTTC
AAAGTTAGCCCCCAATGCAATCTCGTTGCAATGTCGAGCGTGCGGTGAAGCTGTATTGAAGACTACAGGCGATAGCGTTGCAACGCTATCTCGATAA

mRNA sequence

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Protein sequence

Show/hide protein sequence

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VDSSGKMTGKGSLNSCSFGGIHVLYDREFETFFRNSYSLFTQMHTQTNIAIVVNETIHALQKLKEAGKTRFIGITGLLLEIFTYVLDRVPPSYIDVILSYCHYSLNDSTL
LDLLPYLKMILFSNLKLLQSACQAAAAHCKKKRKNISKLAPNAISLQCRACGEAVLKTTGDSVATLSR

Tan0014372 (gene) of Snake gourd v1 genome